More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0364 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0364  outer membrane channel protein  100 
 
 		 500 aa  1015    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0066  outer membrane efflux protein  33.41 
 
 		 436 aa  214  3.9999999999999995e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1633  outer membrane efflux protein  24.57 
 
 		 470 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.788464  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1665  outer membrane efflux protein  24.35 
 
 		 464 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1531  outer membrane efflux protein  27.11 
 
 		 472 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1482  outer membrane efflux protein  25.98 
 
 		 471 aa  125  2e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.387043 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1333  outer membrane efflux protein, putative  27.92 
 
 		 463 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0986  outer membrane efflux protein, putative  26.5 
 
 		 484 aa  118  3e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0384  outer membrane efflux protein  23.97 
 
 		 444 aa  114  4.0000000000000004e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.895564  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1203  outer membrane efflux protein  22.27 
 
 		 497 aa  106  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1217  outer membrane efflux protein  26.17 
 
 		 438 aa  104  5e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.87899  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2969  outer membrane efflux protein  28.82 
 
 		 443 aa  95.1  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.725894  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6495  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.67 
 
 		 518 aa  95.5  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1671  outer membrane efflux protein  21.71 
 
 		 461 aa  94.7  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1826  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25.24 
 
 		 487 aa  94.7  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1725  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.42 
 
 		 489 aa  94.7  4e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.736299  normal  0.0102072 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2529  RND efflux system outer membrane lipoprotein  29.81 
 
 		 485 aa  94.4  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.918806  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0736  hypothetical protein  23.23 
 
 		 455 aa  93.6  8e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3096  outer membrane efflux protein  24.88 
 
 		 497 aa  93.6  8e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  25.35 
 
 		 419 aa  92.8  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5878  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.39 
 
 		 463 aa  92.4  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.539647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2121  Outer membrane efflux protein  26.78 
 
 		 509 aa  92  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4235  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.11 
 
 		 463 aa  92  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.902691  normal  0.529157 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1384  outer membrane efflux protein  24.55 
 
 		 435 aa  91.7  3e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.642492  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02907  outer membrane channel precursor protein  25.96 
 
 		 493 aa  90.1  7e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0665  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.96 
 
 		 493 aa  90.1  7e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2156  outer membrane export factor  26.32 
 
 		 452 aa  90.5  7e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3499  outer membrane channel protein  25.96 
 
 		 495 aa  90.5  7e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0404091  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0662  outer membrane channel protein  25.96 
 
 		 493 aa  90.1  7e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.120975  normal  0.0171626 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3213  outer membrane channel protein  25.96 
 
 		 495 aa  90.5  7e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00955114  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3165  outer membrane efflux protein  27.78 
 
 		 445 aa  90.5  7e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.391786  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02857  hypothetical protein  25.96 
 
 		 493 aa  90.1  7e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3330  outer membrane channel protein  25.96 
 
 		 493 aa  90.5  7e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0662  outer membrane efflux protein  22.71 
 
 		 483 aa  90.1  8e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4349  outer membrane channel protein  25.96 
 
 		 493 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.823303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3468  outer membrane channel protein  25.72 
 
 		 495 aa  89.7  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0175451  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2577  Type I secretion outer membrane protein, TolC  22.5 
 
 		 522 aa  88.6  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00589159 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3004  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.25 
 
 		 464 aa  88.6  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.599739 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0754  hypothetical protein  22.74 
 
 		 455 aa  88.6  3e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3057  outer membrane efflux protein  27.43 
 
 		 440 aa  88.2  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.969203  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3126  outer membrane efflux protein  22.25 
 
 		 444 aa  87.8  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1345  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.08 
 
 		 455 aa  87.4  5e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2441  outer membrane efflux protein  23.89 
 
 		 453 aa  87.4  5e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4942  outer membrane efflux protein  24.7 
 
 		 449 aa  87  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.755187  normal  0.782486 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1990  outer membrane efflux protein  24.15 
 
 		 471 aa  87.4  6e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.154832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0791  outer membrane efflux protein  24.94 
 
 		 454 aa  87  7e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.670065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2568  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.48 
 
 		 464 aa  87  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5432  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.14 
 
 		 553 aa  87  7e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.199925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2941  outer membrane efflux protein  23.64 
 
 		 436 aa  86.7  8e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0140963  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1941  outer membrane efflux protein  21.31 
 
 		 432 aa  86.7  9e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4696  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.4 
 
 		 497 aa  86.7  9e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2069  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.59 
 
 		 452 aa  86.3  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0762  outer membrane efflux protein  22.78 
 
 		 446 aa  86.3  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5161  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.4 
 
 		 488 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.451764  normal  0.264948 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02621  outer membrane protein required for AvrXa21 activity C (raxC)  27.63 
 
 		 443 aa  85.1  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0814  outer membrane efflux protein  23.04 
 
 		 460 aa  85.9  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0962  outer membrane efflux protein  21.66 
 
 		 464 aa  85.1  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000066626  normal  0.118679 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0096  outer membrane efflux protein  24.49 
 
 		 441 aa  84.7  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3437  outer membrane channel protein  26.38 
 
 		 489 aa  84.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3444  outer membrane channel protein  26.38 
 
 		 489 aa  84.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.606184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3367  outer membrane channel protein  26.38 
 
 		 489 aa  84.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3372  outer membrane channel protein  26.38 
 
 		 489 aa  84.3  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.258775 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5970  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25.98 
 
 		 442 aa  84  0.000000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2021  outer membrane efflux protein  22.66 
 
 		 437 aa  83.6  0.000000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5239  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.98 
 
 		 488 aa  83.6  0.000000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3539  outer membrane channel protein  26.07 
 
 		 489 aa  83.2  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.735558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05030  outer membrane efflux protein  22.78 
 
 		 471 aa  82  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.691581  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3360  type I secretion outer membrane protein, TolC family protein  24.23 
 
 		 444 aa  82.4  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.21716  normal  0.12144 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3233  outer membrane efflux protein  22.73 
 
 		 462 aa  81.6  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.367218  normal  0.578966 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0594  outer membrane efflux protein  23.11 
 
 		 508 aa  81.6  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4284  outer membrane efflux protein  28.45 
 
 		 447 aa  81.3  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1749  outer membrane efflux protein  20.61 
 
 		 458 aa  81.3  0.00000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05550  major intrinsic multiple antibiotic resistance efflux outer membrane protein OprM precursor  23.66 
 
 		 485 aa  81.3  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.203755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0619  copper/silver efflux system outer membrane protein CusC  22.56 
 
 		 457 aa  80.9  0.00000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000166732  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3343  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.99 
 
 		 452 aa  80.9  0.00000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3074  copper/silver efflux system outer membrane protein CusC  22.56 
 
 		 457 aa  80.9  0.00000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.127852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1063  hypothetical protein  23.11 
 
 		 453 aa  80.9  0.00000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.45317 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3424  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  23.53 
 
 		 514 aa  80.5  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2243  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.71 
 
 		 455 aa  80.5  0.00000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2639  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.98 
 
 		 461 aa  80.5  0.00000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0533  outer membrane efflux protein  23.11 
 
 		 453 aa  80.5  0.00000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00533  copper/silver efflux system, outer membrane component  22.56 
 
 		 457 aa  80.5  0.00000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0527  outer membrane protein OprM precursor  24.46 
 
 		 485 aa  80.5  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71666  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00522  hypothetical protein  22.56 
 
 		 457 aa  80.5  0.00000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4306  outer membrane efflux protein  28.18 
 
 		 447 aa  80.5  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3747  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  23.82 
 
 		 514 aa  80.5  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.846743  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3057  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  22.56 
 
 		 457 aa  80.1  0.00000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0679  outer membrane efflux protein  24.88 
 
 		 444 aa  80.1  0.00000000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0368289 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  25.84 
 
 		 1496 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0590  copper/silver efflux system outer membrane protein CusC  22.56 
 
 		 460 aa  79.7  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0284493  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1177  outer membrane efflux protein  21.56 
 
 		 427 aa  79.7  0.0000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0590  copper/silver efflux system outer membrane protein CusC  22.56 
 
 		 460 aa  79.7  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.583273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003047  type I secretion TolC precursor  24.94 
 
 		 423 aa  79.7  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0802  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.58 
 
 		 453 aa  79.3  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3737  outer membrane efflux protein  22.99 
 
 		 437 aa  79.7  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.315415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3157  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.26 
 
 		 442 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.262509 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3926  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25.28 
 
 		 441 aa  78.6  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0653  copper/silver efflux system outer membrane protein CusC  23.13 
 
 		 460 aa  79.3  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.191725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3448  outer membrane channel protein  25.17 
 
 		 494 aa  78.6  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.203909 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0259  copper/silver efflux system outer membrane protein CusC  24.32 
 
 		 461 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>