More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_0590 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00533  copper/silver efflux system, outer membrane component  99.12 
 
 
457 aa  917    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3057  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  99.34 
 
 
457 aa  919    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3074  copper/silver efflux system outer membrane protein CusC  99.12 
 
 
457 aa  917    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.127852  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4297  copper/silver efflux system outer membrane protein CusC  70.37 
 
 
461 aa  664    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00173675  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0653  copper/silver efflux system outer membrane protein CusC  98.48 
 
 
460 aa  920    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.191725  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0259  copper/silver efflux system outer membrane protein CusC  70.37 
 
 
461 aa  665    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0590  copper/silver efflux system outer membrane protein CusC  100 
 
 
460 aa  933    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.583273  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3425  copper/silver efflux system outer membrane protein CusC  71.46 
 
 
461 aa  648    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0590  copper/silver efflux system outer membrane protein CusC  99.35 
 
 
460 aa  927    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0284493  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00522  hypothetical protein  99.12 
 
 
457 aa  917    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0619  copper/silver efflux system outer membrane protein CusC  99.12 
 
 
457 aa  917    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000166732  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4009  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  43.84 
 
 
486 aa  363  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0874069  normal  0.0174443 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3717  RND efflux system outer membrane lipoprotein  45.59 
 
 
477 aa  361  2e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0527  outer membrane protein OprM precursor  45.47 
 
 
485 aa  359  6e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71666  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05550  major intrinsic multiple antibiotic resistance efflux outer membrane protein OprM precursor  45.26 
 
 
485 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.203755  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0545  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  44.2 
 
 
470 aa  358  1.9999999999999998e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0516  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  44.05 
 
 
500 aa  354  2e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0482869  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0549  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  44.12 
 
 
501 aa  352  5.9999999999999994e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.569542  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0506  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  41.61 
 
 
492 aa  352  5.9999999999999994e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4305  outer membrane efflux protein  42.46 
 
 
486 aa  351  1e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0009  drug efflux lipoprotein  41.94 
 
 
514 aa  347  3e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.347699  normal  0.0645676 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3747  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  41.9 
 
 
514 aa  346  5e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.846743  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0811  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  41.44 
 
 
517 aa  345  8e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000173561 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3442  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  40.6 
 
 
496 aa  345  8.999999999999999e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.811835  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3424  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  41.68 
 
 
514 aa  345  8.999999999999999e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1384  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  42.08 
 
 
484 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.285433 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1024  RND efflux system outer membrane lipoprotein  42.33 
 
 
484 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.484622  normal  0.130102 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4339  RND efflux system outer membrane lipoprotein  42.08 
 
 
484 aa  342  7e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0952934  normal  0.254961 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1416  RND efflux system outer membrane lipoprotein NodT  40.25 
 
 
469 aa  341  2e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4429  RND efflux system outer membrane lipoprotein  42.33 
 
 
484 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.305214  normal  0.0579633 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2695  outer membrane efflux protein  40.64 
 
 
512 aa  339  5.9999999999999996e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2443  RND efflux system outer membrane lipoprotein  40.17 
 
 
544 aa  338  8e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.167735  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1905  outer membrane efflux protein OprA  40.68 
 
 
516 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1891  outer membrane efflux protein OprA  40.68 
 
 
513 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.271004  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2059  Outer membrane efflux protein  40.68 
 
 
513 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.26387  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1660  hypothetical protein  40.68 
 
 
516 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.077421  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3925  multidrug efflux system protein  41.76 
 
 
499 aa  337  2.9999999999999997e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000707781  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2636  RND efflux system outer membrane lipoprotein  41.6 
 
 
507 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2654  RND efflux system outer membrane lipoprotein  41.81 
 
 
507 aa  336  5e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0354944  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0289  outer membrane protein OmpK  41.03 
 
 
474 aa  336  5.999999999999999e-91  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2607  RND efflux system outer membrane lipoprotein  41.51 
 
 
507 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1997  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  41.51 
 
 
507 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0794932  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2606  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  42.37 
 
 
478 aa  335  1e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0037798  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1278  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  42.09 
 
 
486 aa  335  1e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00202436  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2527  RND efflux system outer membrane lipoprotein  41.81 
 
 
507 aa  335  1e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.10146 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2327  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  39.16 
 
 
528 aa  335  1e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.356993  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2838  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.96 
 
 
528 aa  334  2e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.207275 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3271  outer membrane efflux protein OprA  42.98 
 
 
467 aa  334  2e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0532  RND efflux system outer membrane lipoprotein  41.06 
 
 
475 aa  334  2e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.17075 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0169  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  42.19 
 
 
493 aa  333  3e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000204876 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0567  RND efflux system outer membrane lipoprotein  41.15 
 
 
483 aa  333  4e-90  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5938  RND efflux system outer membrane lipoprotein  40.76 
 
 
507 aa  333  4e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0183223  normal  0.547092 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0480  RND efflux system outer membrane lipoprotein  41.39 
 
 
505 aa  331  1e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0104002 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0690  RND efflux system outer membrane lipoprotein  41.77 
 
 
507 aa  332  1e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.491395 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2864  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  41.65 
 
 
468 aa  330  2e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0383351  normal  0.128914 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3490  RND efflux system outer membrane lipoprotein  41.87 
 
 
503 aa  330  3e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.350691 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3433  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  39.91 
 
 
477 aa  330  4e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6206  RND efflux system outer membrane lipoprotein  41.65 
 
 
508 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00238233 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5839  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  41.65 
 
 
508 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0530876  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0682  RND efflux system outer membrane lipoprotein  41.87 
 
 
519 aa  327  3e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.323921  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6682  RND efflux system outer membrane lipoprotein  41.52 
 
 
508 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0229467  normal  0.0582449 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5237  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  40.8 
 
 
516 aa  327  4.0000000000000003e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.776503  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2367  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  41.3 
 
 
474 aa  327  4.0000000000000003e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1286  RND efflux system outer membrane lipoprotein  41.87 
 
 
543 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.556611  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3497  RND efflux system outer membrane lipoprotein  40.26 
 
 
470 aa  325  7e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3590  RND efflux system outer membrane lipoprotein NodT  40.6 
 
 
491 aa  325  1e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0499  RND efflux system outer membrane lipoprotein  41.72 
 
 
485 aa  325  2e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0080  RND efflux system outer membrane lipoprotein  41.43 
 
 
551 aa  323  3e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2209  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  42.32 
 
 
472 aa  324  3e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6609  RND efflux system outer membrane lipoprotein  40.96 
 
 
510 aa  323  3e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.64888  normal  0.8754 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3466  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  43.02 
 
 
461 aa  323  4e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1046  RND efflux system outer membrane lipoprotein  41.43 
 
 
512 aa  323  5e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0856  outer membrane efflux protein OprB  41.43 
 
 
514 aa  323  5e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1020  outer membrane efflux protein  41.43 
 
 
514 aa  323  5e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.224609  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2052  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  40.56 
 
 
499 aa  323  5e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1203  outer membrane efflux protein OprB  41.43 
 
 
512 aa  323  5e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.21076  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0033  outer membrane efflux protein OprB  41.43 
 
 
512 aa  323  5e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0381  outer membrane efflux protein OprB  41.43 
 
 
553 aa  323  5e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1582  outer membrane efflux protein OprB  41.43 
 
 
512 aa  323  5e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0861  outer membrane efflux protein OprB  41.43 
 
 
514 aa  323  5e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.89354  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3256  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  40 
 
 
525 aa  323  5e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.865648 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0317  RND efflux system outer membrane lipoprotein  41.43 
 
 
514 aa  322  7e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.34053  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0612  RND efflux system outer membrane lipoprotein  41.43 
 
 
514 aa  322  7e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.904611  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0060  RND efflux system outer membrane lipoprotein  41.43 
 
 
514 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0428433  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2447  RND efflux system outer membrane lipoprotein  41.43 
 
 
514 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2869  RND efflux system outer membrane lipoprotein  41.4 
 
 
480 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.451085  normal  0.401715 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1499  outer membrane efflux protein OprB  41.21 
 
 
512 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.112473  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2429  RND efflux system outer membrane lipoprotein  39.61 
 
 
467 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.41681  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4358  RND efflux system outer membrane lipoprotein  41.78 
 
 
482 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2963  putative outer membrane drug efflux lipoprotein  41.9 
 
 
487 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0710  RND efflux system outer membrane lipoprotein  40.29 
 
 
515 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.437206  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0329  RND efflux system outer membrane lipoprotein  38.84 
 
 
474 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1450  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  39.19 
 
 
471 aa  320  1.9999999999999998e-86  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6823  RND efflux system outer membrane lipoprotein  41.46 
 
 
480 aa  320  3e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.248499 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1522  RND efflux system outer membrane lipoprotein  39.74 
 
 
485 aa  320  3e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0101  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  43.13 
 
 
472 aa  320  3e-86  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4088  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  40 
 
 
489 aa  320  3.9999999999999996e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.947344  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0121  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  39.61 
 
 
469 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4769  RND efflux system outer membrane lipoprotein  40.27 
 
 
485 aa  319  7e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.482827  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4472  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  41.15 
 
 
476 aa  319  7e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.621832  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>