276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3737 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3737  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 437 aa  878    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.315415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2659  outer membrane efflux protein  46.05 
 
 		 436 aa  368  1e-100  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2941  outer membrane efflux protein  43.56 
 
 		 436 aa  358  7e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0140963  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0366  outer membrane efflux protein  32.63 
 
 		 437 aa  239  5.999999999999999e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3233  outer membrane efflux protein  35.82 
 
 		 462 aa  237  3e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.367218  normal  0.578966 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0903  outer membrane efflux protein  31.91 
 
 		 436 aa  219  7e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.331424  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5135  outer membrane efflux protein  27.93 
 
 		 448 aa  176  6e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01590  putative outer membrane protein TolC  31.61 
 
 		 451 aa  174  1.9999999999999998e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.29548  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1634  outer membrane efflux protein  29.06 
 
 		 431 aa  162  1e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.194063  normal  0.997182 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0814  outer membrane efflux protein  29.2 
 
 		 455 aa  159  7e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.881482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0710  Outer membrane protein-like  26.34 
 
 		 445 aa  123  7e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.00000000572058  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03674  putative outer membrane CHANEL lipoprotein  21.83 
 
 		 488 aa  81.3  0.00000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.119855 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0364  outer membrane channel protein  22.99 
 
 		 500 aa  79.7  0.00000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3124  outer membrane efflux protein  21.95 
 
 		 448 aa  78.2  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1727  type I secretion outer membrane protein, TolC family  22.62 
 
 		 452 aa  77.8  0.0000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000826676  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2367  outer membrane efflux protein  22.69 
 
 		 495 aa  72.4  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0042  outer membrane efflux protein  24.95 
 
 		 454 aa  73.2  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0384  outer membrane efflux protein  23.69 
 
 		 444 aa  72  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.895564  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1165  Outer membrane efflux protein  23.5 
 
 		 462 aa  71.6  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0610  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.95 
 
 		 480 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0366  putative secretion protein  22.49 
 
 		 454 aa  70.1  0.00000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.676066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0066  outer membrane efflux protein  23.17 
 
 		 436 aa  69.3  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1633  outer membrane efflux protein  22.99 
 
 		 470 aa  67.4  0.0000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.788464  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0430  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.1 
 
 		 436 aa  66.2  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000114483  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2021  outer membrane efflux protein  24.44 
 
 		 437 aa  66.2  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10330  putative outer membrane protein precursor  23.19 
 
 		 471 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.339948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2243  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.14 
 
 		 455 aa  65.1  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4977  outer membrane efflux protein TolC, putative  22.75 
 
 		 479 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1617  outer membrane efflux protein  23.57 
 
 		 467 aa  65.1  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  22.07 
 
 		 441 aa  64.3  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2686  Outer membrane secretion protein  21.48 
 
 		 472 aa  64.3  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.553025  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1665  outer membrane efflux protein  21.65 
 
 		 464 aa  63.9  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0491  Type I secretion outer membrane protein, TolC  21.33 
 
 		 477 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00611692  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1482  outer membrane efflux protein  21.03 
 
 		 426 aa  63.5  0.000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.979092  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0543  Type I secretion outer membrane protein, TolC  21.56 
 
 		 479 aa  63.5  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.991736 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1671  outer membrane efflux protein  24.22 
 
 		 461 aa  62.8  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0945  secretion protein  22.83 
 
 		 472 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3126  outer membrane efflux protein  23.78 
 
 		 444 aa  62.4  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1376  Outer membrane efflux protein  20.38 
 
 		 435 aa  62.4  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.109779  hitchhiker  0.00244241 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3298  outer membrane efflux protein  23.76 
 
 		 418 aa  62.4  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000531453  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4260  outer membrane efflux protein  25.82 
 
 		 438 aa  62.4  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0283  outer membrane efflux protein  21.92 
 
 		 439 aa  61.6  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  22.97 
 
 		 1470 aa  61.6  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0480  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.23 
 
 		 505 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0104002 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0121  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  21.83 
 
 		 469 aa  61.6  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3056  outer membrane efflux protein  19.2 
 
 		 485 aa  60.8  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111107 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4162  outer membrane efflux protein  24.47 
 
 		 443 aa  60.8  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000533026  normal  0.288124 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5232  hypothetical protein  22.47 
 
 		 493 aa  60.5  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1749  outer membrane efflux protein  24.18 
 
 		 458 aa  60.5  0.00000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2799  outer membrane efflux protein  22.37 
 
 		 435 aa  60.1  0.00000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000194078  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0833  outer membrane efflux protein  22.59 
 
 		 496 aa  59.3  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1143  outer membrane efflux protein  25.73 
 
 		 455 aa  59.7  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0286987  normal  0.128527 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3801  outer membrane efflux protein  20.86 
 
 		 449 aa  59.3  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233057 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1177  outer membrane efflux protein  22.25 
 
 		 427 aa  58.9  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2173  outer membrane efflux protein  23.01 
 
 		 448 aa  58.5  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3256  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  25.83 
 
 		 525 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.865648 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2639  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.17 
 
 		 461 aa  58.2  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0775  RND efflux system outer membrane lipoprotein  21.97 
 
 		 476 aa  58.2  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2441  outer membrane efflux protein  21.75 
 
 		 453 aa  57.8  0.0000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1967  outer membrane efflux protein  22.67 
 
 		 443 aa  57.4  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000399706  normal  0.35271 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1149  TolC family type I secretion outer membrane protein  20 
 
 		 456 aa  57.4  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.435165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3706  outer membrane efflux protein  23.91 
 
 		 447 aa  57.4  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1884  outer membrane efflux protein  21.06 
 
 		 483 aa  57.4  0.0000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0662  outer membrane efflux protein  21.52 
 
 		 483 aa  57  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5705  outer membrane efflux protein  22.49 
 
 		 481 aa  56.6  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2692  outer membrane efflux protein  23.9 
 
 		 442 aa  55.8  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922433  normal  0.254416 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4923  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.39 
 
 		 477 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4715  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.17 
 
 		 477 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.133912 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2850  outer membrane efflux protein  23.31 
 
 		 527 aa  56.2  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.28382  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02379  hypothetical protein  22.03 
 
 		 436 aa  55.5  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5506  outer membrane efflux protein  24.46 
 
 		 451 aa  55.5  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.307266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0610  outer membrane efflux protein  20.8 
 
 		 453 aa  55.5  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3558  Type I secretion outer membrane protein, TolC  31.43 
 
 		 472 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.445028  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1021  outer membrane efflux protein  25.26 
 
 		 528 aa  55.1  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4799  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.39 
 
 		 477 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.125067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1442  outer membrane efflux protein  24.6 
 
 		 431 aa  54.7  0.000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00764479  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2950  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.09 
 
 		 479 aa  54.7  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6770  outer membrane efflux protein  21.18 
 
 		 488 aa  54.7  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3490  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.06 
 
 		 503 aa  54.7  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.350691 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3733  outer membrane efflux protein  25 
 
 		 488 aa  54.7  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3981  outer membrane efflux protein  23.89 
 
 		 493 aa  54.7  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1907  Type I secretion outer membrane protein, TolC  26.14 
 
 		 472 aa  54.3  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4976  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.25 
 
 		 478 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0498  type I secretion outer membrane protein, TolC family  22.17 
 
 		 494 aa  54.3  0.000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1217  outer membrane efflux protein  20.71 
 
 		 438 aa  54.3  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.87899  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0710  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.17 
 
 		 515 aa  53.9  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.437206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65750  putative outer membrane efflux protein precursor  22.49 
 
 		 482 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4646  RND efflux system outer membrane lipoprotein  22.65 
 
 		 464 aa  53.9  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.220862  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1266  outer membrane efflux protein  25.16 
 
 		 444 aa  53.9  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3627  outer membrane efflux protein  21.26 
 
 		 461 aa  53.9  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.433273  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1531  outer membrane efflux protein  22.69 
 
 		 472 aa  53.9  0.000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0559  outer membrane efflux protein  22.12 
 
 		 455 aa  53.5  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1941  outer membrane efflux protein  21.63 
 
 		 432 aa  53.5  0.000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2353  chemiosmotic efflux system C protein C  24.16 
 
 		 437 aa  53.5  0.000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2515  outer membrane protein  23.93 
 
 		 463 aa  53.5  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3157  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  25.51 
 
 		 480 aa  53.5  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2013  type I secretion outer membrane protein, TolC family  26.14 
 
 		 472 aa  53.5  0.000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.226354  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3048  outer membrane channel protein  20.13 
 
 		 432 aa  53.5  0.000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000973822  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2276  outer membrane efflux protein  24.19 
 
 		 432 aa  53.1  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0693511 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3231  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.57 
 
 		 483 aa  53.1  0.000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>