210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2021 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2021  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 437 aa  889    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0559  outer membrane efflux protein  50.11 
 
 		 455 aa  435  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4902  outer membrane efflux protein  34.04 
 
 		 439 aa  255  1.0000000000000001e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4260  outer membrane efflux protein  30.65 
 
 		 438 aa  208  1e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2692  outer membrane efflux protein  30.41 
 
 		 442 aa  184  4.0000000000000006e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922433  normal  0.254416 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1353  outer membrane efflux protein  24.38 
 
 		 451 aa  136  7.000000000000001e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.678572  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1773  outer membrane efflux protein  23.53 
 
 		 435 aa  119  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4182  outer membrane efflux protein  25 
 
 		 431 aa  98.6  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1749  outer membrane efflux protein  24.11 
 
 		 458 aa  94  5e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6121  outer membrane efflux protein  25.77 
 
 		 453 aa  92.4  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1884  outer membrane efflux protein  22.86 
 
 		 483 aa  92.8  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1990  outer membrane efflux protein  23.92 
 
 		 471 aa  89  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.154832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0627  outer membrane efflux protein, putative  22.75 
 
 		 470 aa  88.6  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.173588  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5561  outer membrane efflux protein  23.87 
 
 		 431 aa  88.6  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0833  outer membrane efflux protein  23.98 
 
 		 496 aa  87.8  3e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2704  outer membrane efflux protein  23.46 
 
 		 423 aa  86.7  8e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1482  outer membrane efflux protein  22.97 
 
 		 426 aa  84.3  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.979092  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0364  outer membrane channel protein  22.66 
 
 		 500 aa  83.6  0.000000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0066  outer membrane efflux protein  23.63 
 
 		 436 aa  83.2  0.000000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0610  outer membrane efflux protein  21.48 
 
 		 453 aa  83.2  0.000000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2441  outer membrane efflux protein  23.31 
 
 		 453 aa  82  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1376  Outer membrane efflux protein  22.43 
 
 		 435 aa  81.3  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.109779  hitchhiker  0.00244241 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2365  outer membrane efflux protein  23.68 
 
 		 482 aa  80.1  0.00000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.316372 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3298  outer membrane efflux protein  20.49 
 
 		 418 aa  79.3  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000531453  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0733  outer membrane efflux protein, putative  22.72 
 
 		 463 aa  77.8  0.0000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2629  outer membrane efflux protein  23.38 
 
 		 421 aa  77.8  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111539  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1617  outer membrane efflux protein  21.72 
 
 		 467 aa  77  0.0000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1380  outer membrane efflux protein  24 
 
 		 425 aa  76.3  0.000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0961  Outer membrane protein-like  22.8 
 
 		 491 aa  72.8  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0234127  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1633  outer membrane efflux protein  22.17 
 
 		 420 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.159543  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1606  outer membrane efflux protein  21.96 
 
 		 421 aa  71.6  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3801  outer membrane efflux protein  21.28 
 
 		 449 aa  71.2  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233057 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0283  outer membrane efflux protein  23.84 
 
 		 439 aa  71.2  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2866  outer membrane efflux protein  25.71 
 
 		 480 aa  70.9  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0685652 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0120  outer membrane efflux protein  22.09 
 
 		 448 aa  70.5  0.00000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000165447  hitchhiker  0.000000000000561163 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1456  outer membrane efflux protein  23.76 
 
 		 446 aa  70.5  0.00000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.974754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1665  outer membrane efflux protein  22.86 
 
 		 464 aa  68.9  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1266  outer membrane efflux protein  21.57 
 
 		 444 aa  68.2  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0662  outer membrane efflux protein  24.09 
 
 		 483 aa  67.4  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0881  outer membrane efflux protein  21.08 
 
 		 535 aa  67  0.0000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.705042  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1779  outer membrane efflux protein  22.38 
 
 		 444 aa  67  0.0000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0223897  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2799  outer membrane efflux protein  21.56 
 
 		 435 aa  66.6  0.0000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000194078  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3129  Outer membrane efflux protein  24.1 
 
 		 446 aa  66.2  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000215977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3737  outer membrane efflux protein  24.44 
 
 		 437 aa  66.2  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.315415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2173  outer membrane efflux protein  21.95 
 
 		 448 aa  65.5  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0162  outer membrane efflux protein  24.76 
 
 		 433 aa  65.9  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3076  outer membrane efflux protein  23.33 
 
 		 502 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.240907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  22.51 
 
 		 441 aa  64.7  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1482  outer membrane efflux protein  21.48 
 
 		 471 aa  64.7  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.387043 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2633  outer membrane efflux protein  23 
 
 		 424 aa  64.3  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1177  outer membrane efflux protein  22.33 
 
 		 427 aa  63.5  0.000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3706  outer membrane efflux protein  22.12 
 
 		 447 aa  63.2  0.000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0538  outer membrane efflux protein  22.62 
 
 		 462 aa  63.2  0.000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3853  outer membrane efflux protein  23.02 
 
 		 447 aa  63.2  0.000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1217  outer membrane efflux protein  23.93 
 
 		 438 aa  62.8  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.87899  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1698  outer membrane efflux protein  25.55 
 
 		 433 aa  62.8  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.572085  normal  0.0641673 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0384  outer membrane efflux protein  22.39 
 
 		 444 aa  62  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.895564  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  21.98 
 
 		 419 aa  62  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6073  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.22 
 
 		 457 aa  62  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.523429 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6370  TolC family type I secretion outer membrane protein  24 
 
 		 456 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.668018  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1634  outer membrane efflux protein  23.52 
 
 		 431 aa  62.4  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.194063  normal  0.997182 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0837  outer membrane efflux protein  21.11 
 
 		 462 aa  61.6  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3937  outer membrane efflux protein  22.8 
 
 		 447 aa  60.8  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00157367 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0849  outer membrane efflux protein  23.08 
 
 		 417 aa  60.8  0.00000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000450472  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1027  outer membrane efflux protein  23.79 
 
 		 452 aa  60.5  0.00000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1162  outer membrane efflux protein  20.09 
 
 		 515 aa  60.5  0.00000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000199135  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  22.27 
 
 		 1470 aa  59.7  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  22.19 
 
 		 1496 aa  57.8  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0141  RND efflux system, outer membrane protein  24.82 
 
 		 506 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1037  RND efflux system, outer membrane protein  24.82 
 
 		 508 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2001  outer membrane efflux protein  22.19 
 
 		 473 aa  57.8  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.612283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2368  outer membrane efflux protein  22.19 
 
 		 473 aa  57.8  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0254327  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1312  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  24.82 
 
 		 508 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2774  Outer membrane protein  24.82 
 
 		 508 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2631  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  24.82 
 
 		 508 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0168  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  24.82 
 
 		 508 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0618806  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0391  Outer membrane efflux family protein  24.06 
 
 		 437 aa  57  0.0000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03674  putative outer membrane CHANEL lipoprotein  23.52 
 
 		 488 aa  57  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.119855 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6010  outer membrane efflux protein  24.46 
 
 		 462 aa  57  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.750386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1195  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.6 
 
 		 482 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000171892  normal  0.38657 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5408  putative efflux outer membrane protein  22.07 
 
 		 506 aa  56.2  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3409  outer membrane efflux protein  24 
 
 		 419 aa  55.1  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000155286  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0814  outer membrane efflux protein  21.97 
 
 		 455 aa  55.5  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.881482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2517  Outer membrane efflux protein  20.09 
 
 		 455 aa  55.5  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0940003  normal  0.677218 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0605  outer membrane efflux protein  19.1 
 
 		 470 aa  55.1  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0224  outer membrane efflux protein  23.39 
 
 		 419 aa  55.5  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000720591  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3468  outer membrane efflux protein  25.35 
 
 		 448 aa  55.8  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000163735  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5078  outer membrane efflux protein  19.95 
 
 		 635 aa  55.1  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.851054  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1727  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.93 
 
 		 452 aa  54.7  0.000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000826676  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3627  outer membrane efflux protein  23.44 
 
 		 461 aa  54.7  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.433273  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1716  outer membrane protein  24.18 
 
 		 440 aa  54.3  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000584875  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0440  RND efflux system, outer membrane protein  24.64 
 
 		 509 aa  52.8  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0863  outer membrane efflux protein  22.56 
 
 		 476 aa  52  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0409869  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3096  outer membrane efflux protein  20.51 
 
 		 497 aa  52.4  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1531  outer membrane efflux protein  24.82 
 
 		 472 aa  52.4  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0582  outer membrane efflux protein  20.84 
 
 		 464 aa  51.6  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5506  outer membrane efflux protein  22.73 
 
 		 451 aa  52  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.307266  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0094  outer membrane efflux protein, putative  20.41 
 
 		 501 aa  51.2  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0379352 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2064  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  24.82 
 
 		 499 aa  51.2  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0372  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  26.57 
 
 		 464 aa  50.8  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.088852 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>