163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0962 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0962  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 464 aa  946    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000066626  normal  0.118679 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1203  outer membrane efflux protein  31.66 
 
 		 497 aa  215  9.999999999999999e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0662  outer membrane efflux protein  28.21 
 
 		 483 aa  194  2e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2866  outer membrane efflux protein  29.03 
 
 		 480 aa  189  1e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0685652 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1671  outer membrane efflux protein  28.17 
 
 		 461 aa  185  1.0000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1941  outer membrane efflux protein  28.17 
 
 		 432 aa  171  2e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01115  putative outer membrane transport/efflux protein  28.05 
 
 		 443 aa  166  1.0000000000000001e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1667  outer membrane efflux protein  26.08 
 
 		 455 aa  149  8e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0384  outer membrane efflux protein  24.44 
 
 		 444 aa  131  3e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.895564  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0066  outer membrane efflux protein  25.81 
 
 		 436 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4897  outer membrane efflux protein  26.21 
 
 		 437 aa  108  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0861249  normal  0.15922 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4942  outer membrane efflux protein  25.75 
 
 		 449 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.755187  normal  0.782486 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3126  outer membrane efflux protein  25.31 
 
 		 444 aa  106  7e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0364  outer membrane channel protein  21.66 
 
 		 500 aa  85.1  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0679  outer membrane efflux protein  20.47 
 
 		 444 aa  84.7  0.000000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0368289 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3343  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.05 
 
 		 452 aa  83.2  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02621  outer membrane protein required for AvrXa21 activity C (raxC)  23.82 
 
 		 443 aa  81.6  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1665  outer membrane efflux protein  22.41 
 
 		 464 aa  79.3  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2069  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.39 
 
 		 452 aa  78.6  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2156  outer membrane export factor  23.1 
 
 		 452 aa  77.4  0.0000000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16260  Type I secretion outer membrane protein  24.22 
 
 		 472 aa  69.7  0.00000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1333  outer membrane efflux protein, putative  23.97 
 
 		 463 aa  68.2  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1482  outer membrane efflux protein  21.51 
 
 		 471 aa  68.2  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.387043 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1569  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.02 
 
 		 461 aa  67  0.0000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.151598  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1531  outer membrane efflux protein  23.36 
 
 		 472 aa  66.2  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5161  type I secretion outer membrane protein, TolC family  22.51 
 
 		 488 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.451764  normal  0.264948 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2098  putative outer membrane protein tolC  23.43 
 
 		 456 aa  65.1  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3801  outer membrane efflux protein  21.67 
 
 		 449 aa  65.9  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233057 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  21.3 
 
 		 419 aa  65.5  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4696  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.51 
 
 		 497 aa  64.7  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0986  outer membrane efflux protein, putative  23.56 
 
 		 484 aa  64.7  0.000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0291  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  23.88 
 
 		 465 aa  63.5  0.000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.33434  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5239  type I secretion outer membrane protein, TolC family  22.51 
 
 		 488 aa  63.2  0.000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1798  outer membrane efflux protein  27.42 
 
 		 471 aa  61.2  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.337857  normal  0.0360275 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0935  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25.13 
 
 		 469 aa  61.2  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.219048  normal  0.252651 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4306  outer membrane efflux protein  21.63 
 
 		 447 aa  60.5  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2457  type I secretion outer membrane protein, TolC family  19.85 
 
 		 449 aa  60.1  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1407  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.67 
 
 		 471 aa  60.1  0.00000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.267158 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4284  outer membrane efflux protein  20.83 
 
 		 447 aa  58.9  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0610  outer membrane efflux protein  31.65 
 
 		 453 aa  58.2  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1633  outer membrane efflux protein  20.3 
 
 		 470 aa  58.2  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.788464  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  20.09 
 
 		 441 aa  57.8  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3706  outer membrane efflux protein  23.54 
 
 		 447 aa  57.4  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0945  outer membrane efflux family protein  20.7 
 
 		 456 aa  57  0.0000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.681331  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2883  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.78 
 
 		 442 aa  57  0.0000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00170075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1884  outer membrane efflux protein  22.12 
 
 		 483 aa  56.2  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0373  outer membrane efflux protein  22.16 
 
 		 662 aa  56.2  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.540248 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0573  outer membrane channel protein  21.27 
 
 		 464 aa  55.5  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0654  outer membrane channel protein  21.27 
 
 		 464 aa  55.5  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.945309  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0538  outer membrane efflux protein  22.19 
 
 		 462 aa  54.7  0.000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1727  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.1 
 
 		 452 aa  55.1  0.000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000826676  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1617  outer membrane efflux protein  21.38 
 
 		 467 aa  55.1  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0938  outer membrane efflux family protein  20.41 
 
 		 452 aa  54.7  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1967  outer membrane efflux protein  22.14 
 
 		 443 aa  54.7  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000399706  normal  0.35271 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1561  RND efflux system, outer membrane lipoprotein CmeC  23.54 
 
 		 480 aa  54.3  0.000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0162  outer membrane efflux protein  21.22 
 
 		 433 aa  54.3  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2662  outer membrane efflux protein  22.82 
 
 		 445 aa  54.3  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2692  outer membrane efflux protein  20.89 
 
 		 442 aa  53.9  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922433  normal  0.254416 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0381  outer membrane protein OprM  21.2 
 
 		 485 aa  53.5  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00119096 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2154  outer membrane protein CyaE, putative  21.58 
 
 		 453 aa  52.8  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0403  outer membrane protein OprM  21.53 
 
 		 485 aa  52.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000102824 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0791  outer membrane efflux protein  20.78 
 
 		 454 aa  53.1  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.670065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0483  type I secretion outer membrane protein, TolC  22.94 
 
 		 440 aa  53.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0443  outer membrane efflux protein OprA  21.2 
 
 		 485 aa  52.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.340499  hitchhiker  0.0000000156404 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0383  outer membrane protein OprM  20.95 
 
 		 485 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2243  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.53 
 
 		 455 aa  52  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0284  outer membrane channel protein  20.95 
 
 		 465 aa  52.4  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3619  outer membrane channel protein  21.82 
 
 		 469 aa  51.2  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1633  Type I secretion outer membrane protein, TolC  21.24 
 
 		 519 aa  51.6  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.181955  normal  0.716054 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03690  outer membrane channel precursor protein  25.79 
 
 		 462 aa  51.6  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000344286  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3468  outer membrane channel protein  22.86 
 
 		 495 aa  51.6  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0175451  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02907  outer membrane channel precursor protein  22.86 
 
 		 493 aa  51.2  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0665  type I secretion outer membrane protein, TolC family  22.86 
 
 		 493 aa  51.2  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4349  outer membrane channel protein  22.86 
 
 		 493 aa  51.2  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.823303  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02857  hypothetical protein  22.86 
 
 		 493 aa  51.2  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3429  outer membrane efflux protein  22.86 
 
 		 442 aa  51.2  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.437271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1698  outer membrane efflux protein  20.86 
 
 		 433 aa  51.2  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.572085  normal  0.0641673 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0563  RND efflux system, outer membrane lipoprotein CmeC  22.83 
 
 		 482 aa  51.2  0.00004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0291463  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0662  outer membrane channel protein  22.86 
 
 		 493 aa  51.2  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.120975  normal  0.0171626 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  20.23 
 
 		 1496 aa  50.8  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3257  Type I secretion outer membrane protein, TolC  19.64 
 
 		 462 aa  50.8  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.30122  normal  0.885594 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3124  outer membrane efflux protein  19.13 
 
 		 448 aa  50.8  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3213  outer membrane channel protein  22.86 
 
 		 495 aa  50.8  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00955114  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3499  outer membrane channel protein  22.86 
 
 		 495 aa  50.8  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0404091  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3330  outer membrane channel protein  22.86 
 
 		 493 aa  50.8  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03674  putative outer membrane CHANEL lipoprotein  29.55 
 
 		 488 aa  50.4  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.119855 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1353  outer membrane efflux protein  19.87 
 
 		 451 aa  50.4  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.678572  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02837  hypothetical protein  21.78 
 
 		 423 aa  50.4  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4284  Outer membrane protein-like protein  21.9 
 
 		 480 aa  50.1  0.00009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0389  outer membrane protein OprM  21.67 
 
 		 485 aa  49.7  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.303382  hitchhiker  0.0000297498 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2616  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  23.76 
 
 		 501 aa  49.7  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3362  outer membrane efflux protein  26.04 
 
 		 431 aa  49.7  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5061  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.62 
 
 		 445 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.447957 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5878  TolC family type I secretion outer membrane protein  19.38 
 
 		 463 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.539647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0903  outer membrane efflux protein  22.56 
 
 		 436 aa  48.5  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.331424  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3737  outer membrane efflux protein  25.49 
 
 		 437 aa  48.9  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.315415  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3777  outer membrane channel protein  21.49 
 
 		 470 aa  48.5  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2148  TolC family type I secretion outer membrane protein  19.39 
 
 		 497 aa  49.3  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.400858  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0894  outer membrane efflux protein  21.14 
 
 		 487 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0733  outer membrane efflux protein, putative  20.66 
 
 		 463 aa  48.1  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>