More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_1407 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1798  outer membrane efflux protein  89.29 
 
 		 471 aa  835    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.337857  normal  0.0360275 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0935  Type I secretion outer membrane protein, TolC  69.71 
 
 		 469 aa  649    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.219048  normal  0.252651 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1407  TolC family type I secretion outer membrane protein  100 
 
 		 471 aa  950    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.267158 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16260  Type I secretion outer membrane protein  61.79 
 
 		 472 aa  517  1.0000000000000001e-145  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0718  TolC family type I secretion outer membrane protein  48.43 
 
 		 442 aa  377  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0483  type I secretion outer membrane protein, TolC  30.35 
 
 		 440 aa  176  7e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2639  TolC family type I secretion outer membrane protein  30.75 
 
 		 461 aa  171  2e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0695  porin (omp) ABC transporter protein  31.59 
 
 		 484 aa  167  4e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0288188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0430  TolC family type I secretion outer membrane protein  29.34 
 
 		 436 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000114483  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03690  outer membrane channel precursor protein  29.82 
 
 		 462 aa  162  8.000000000000001e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000344286  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0604  type I secretion outer membrane protein, TolC family  29.31 
 
 		 478 aa  162  8.000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.836386 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2711  Type I secretion outer membrane protein TolC  30.14 
 
 		 493 aa  159  7e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0645  type I secretion outer membrane protein, TolC family  29.76 
 
 		 488 aa  156  6e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.173394 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0366  putative secretion protein  28.94 
 
 		 454 aa  153  5.9999999999999996e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.676066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3926  Type I secretion outer membrane protein, TolC  29.44 
 
 		 441 aa  153  7e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2534  Type I secretion outer membrane protein, TolC  29.2 
 
 		 468 aa  152  8e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3777  outer membrane channel protein  29.4 
 
 		 470 aa  152  1e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0491  Type I secretion outer membrane protein, TolC  30.48 
 
 		 477 aa  151  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00611692  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4923  TolC family type I secretion outer membrane protein  29.66 
 
 		 477 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4799  TolC family type I secretion outer membrane protein  29.44 
 
 		 477 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.125067  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3723  type I secretion outer membrane protein, TolC family  28.28 
 
 		 512 aa  149  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1746  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.47 
 
 		 446 aa  147  3e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2069  TolC family type I secretion outer membrane protein  29.09 
 
 		 452 aa  146  7.0000000000000006e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0749  Type I secretion outer membrane protein, TolC  29.91 
 
 		 497 aa  146  7.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2156  outer membrane export factor  29.32 
 
 		 452 aa  146  7.0000000000000006e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4181  outer membrane channel protein  28.97 
 
 		 449 aa  145  1e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65750  putative outer membrane efflux protein precursor  29.62 
 
 		 482 aa  145  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4976  TolC family type I secretion outer membrane protein  30.02 
 
 		 478 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0381  type I secretion outer membrane protein, TolC family  28.95 
 
 		 445 aa  144  3e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0230254  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0611  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.05 
 
 		 464 aa  144  3e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5705  outer membrane efflux protein  29.86 
 
 		 481 aa  144  4e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1126  TolC family type I secretion outer membrane protein  29.14 
 
 		 450 aa  144  5e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4715  TolC family type I secretion outer membrane protein  30.21 
 
 		 477 aa  143  7e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.133912 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0802  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.32 
 
 		 453 aa  142  9.999999999999999e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2630  Type I secretion outer membrane protein, TolC  27.99 
 
 		 489 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1338  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.97 
 
 		 456 aa  140  3e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0728783  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2047  type I secretion outer membrane protein  27.86 
 
 		 616 aa  140  3.9999999999999997e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0139  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.86 
 
 		 616 aa  140  3.9999999999999997e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4977  outer membrane efflux protein TolC, putative  28.93 
 
 		 479 aa  140  7e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3619  outer membrane channel protein  27.59 
 
 		 469 aa  139  8.999999999999999e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0610  TolC family type I secretion outer membrane protein  30.12 
 
 		 480 aa  139  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3904  outer membrane channel protein  29.58 
 
 		 435 aa  139  1e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2203  type I secretion outer membrane protein, TolC family  27.49 
 
 		 441 aa  139  1e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.917815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2697  type I secretion outer membrane protein, TolC  27.97 
 
 		 437 aa  138  2e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0768  outer membrane channel protein  28.09 
 
 		 435 aa  138  2e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000309945  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0813  outer membrane channel protein  29.64 
 
 		 435 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000621601  normal  0.257824 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3578  outer membrane channel protein  29.64 
 
 		 435 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000408694  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0781  outer membrane channel protein  29.64 
 
 		 435 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000184345  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0725  outer membrane channel protein  29.64 
 
 		 435 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000245313  hitchhiker  0.000963429 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0753  outer membrane channel protein  28.81 
 
 		 435 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000555232  normal  0.0190145 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3563  outer membrane channel protein  29.81 
 
 		 434 aa  137  4e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000135514  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2682  Type I secretion outer membrane protein, TolC  26.71 
 
 		 451 aa  137  4e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.829421  hitchhiker  0.000293137 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1664  Type I secretion outer membrane protein, TolC  27.06 
 
 		 453 aa  137  5e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1642  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.23 
 
 		 446 aa  136  7.000000000000001e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.779397 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3236  outer membrane channel protein  28.71 
 
 		 435 aa  136  9e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000456355  hitchhiker  0.0000511139 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3048  outer membrane channel protein  28.12 
 
 		 432 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000973822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3448  outer membrane channel protein  26.35 
 
 		 494 aa  135  9.999999999999999e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.203909 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0806  outer membrane channel protein  29.4 
 
 		 435 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000113836  hitchhiker  0.0000000000882186 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2675  outer membrane channel protein  28.12 
 
 		 441 aa  135  9.999999999999999e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2013  outer membrane channel protein  27.04 
 
 		 438 aa  135  9.999999999999999e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000158125  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0543  Type I secretion outer membrane protein, TolC  28.72 
 
 		 479 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.991736 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0979  outer membrane efflux protein  27.32 
 
 		 375 aa  135  1.9999999999999998e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.2318 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2457  type I secretion outer membrane protein, TolC family  29.89 
 
 		 449 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3332  outer membrane channel protein  27.6 
 
 		 431 aa  134  3e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0563453  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1407  type I secretion outer membrane protein, TolC family  27.74 
 
 		 451 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2616  Type I secretion outer membrane protein, TolC  28.14 
 
 		 450 aa  134  5e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.930678  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4195  outer membrane channel protein  28.44 
 
 		 443 aa  133  6e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000611538  hitchhiker  0.000431125 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2283  Type I secretion outer membrane protein, TolC  28.09 
 
 		 480 aa  133  7.999999999999999e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004522  type I secretion TolC precursor  27.82 
 
 		 442 aa  133  9e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000301167  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02907  outer membrane channel precursor protein  27.46 
 
 		 493 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0665  type I secretion outer membrane protein, TolC family  27.46 
 
 		 493 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0736  hypothetical protein  27.67 
 
 		 455 aa  132  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0744  Type I secretion outer membrane protein, TolC  26.44 
 
 		 449 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.291612  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0662  outer membrane channel protein  27.46 
 
 		 493 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.120975  normal  0.0171626 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02857  hypothetical protein  27.46 
 
 		 493 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4349  outer membrane channel protein  27.46 
 
 		 493 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.823303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3330  outer membrane channel protein  27.46 
 
 		 493 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3213  outer membrane channel protein  27.46 
 
 		 495 aa  131  3e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00955114  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3499  outer membrane channel protein  27.46 
 
 		 495 aa  131  3e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0404091  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3367  outer membrane channel protein  26.56 
 
 		 489 aa  131  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1598  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.25 
 
 		 459 aa  130  3e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.538573  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3539  outer membrane channel protein  26.56 
 
 		 489 aa  131  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.735558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3444  outer membrane channel protein  26.56 
 
 		 489 aa  131  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.606184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3437  outer membrane channel protein  26.56 
 
 		 489 aa  131  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0544  outer membrane channel protein  28.04 
 
 		 448 aa  131  3e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000576987  normal  0.601769 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3372  outer membrane channel protein  26.56 
 
 		 489 aa  131  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.258775 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1041  type I secretion outer membrane efflux protein  30.48 
 
 		 451 aa  130  7.000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3468  outer membrane channel protein  27 
 
 		 495 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0175451  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0774  outer membrane channel protein  27.44 
 
 		 441 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000983275  unclonable  0.000000000104798 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0754  hypothetical protein  27.02 
 
 		 455 aa  126  7e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3356  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.93 
 
 		 442 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.431157  normal  0.886803 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2604  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25 
 
 		 442 aa  125  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3225  outer membrane channel protein  26.89 
 
 		 432 aa  125  2e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000929322  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02621  outer membrane protein required for AvrXa21 activity C (raxC)  27.44 
 
 		 443 aa  125  2e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3343  type I secretion outer membrane protein, TolC family  28.28 
 
 		 452 aa  124  3e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0323  outer membrane channel protein  26.95 
 
 		 463 aa  124  3e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000673159  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3360  type I secretion outer membrane protein, TolC family protein  25.36 
 
 		 444 aa  124  3e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.21716  normal  0.12144 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1990  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.04 
 
 		 498 aa  123  7e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2026  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.82 
 
 		 405 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.341805  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0313  outer membrane channel protein  26.53 
 
 		 463 aa  122  9.999999999999999e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>