61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_0894 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_0894  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 487 aa  954    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3733  outer membrane efflux protein  60.7 
 
 		 488 aa  534  1e-150  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3981  outer membrane efflux protein  59.06 
 
 		 493 aa  534  1e-150  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4026  outer membrane efflux protein  58.18 
 
 		 486 aa  509  1e-143  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5232  hypothetical protein  54.71 
 
 		 493 aa  437  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60770  putative outer membrane protein  54.48 
 
 		 493 aa  433  1e-120  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2471  outer membrane efflux protein  42.05 
 
 		 481 aa  321  1.9999999999999998e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5198  outer efflux pump domain-containing protein  42.95 
 
 		 522 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0545953 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4093  outer membrane efflux protein  41.83 
 
 		 514 aa  281  2e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.66979 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0749  outer membrane efflux protein  34.92 
 
 		 490 aa  256  8e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2992  hypothetical protein  27.85 
 
 		 542 aa  152  1e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2852  hypothetical protein  27.85 
 
 		 542 aa  152  1e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0040  type I secretion outer membrane protein  26.09 
 
 		 507 aa  147  5e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.99479  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2010  outer membrane efflux family protein  25.76 
 
 		 509 aa  144  5e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2027  outer membrane efflux protein  25.98 
 
 		 495 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000179084 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2200  outer membrane efflux protein  25.05 
 
 		 495 aa  111  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03082  hypothetical protein  31.34 
 
 		 492 aa  105  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.208658  normal  0.984334 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1126  outer membrane efflux protein  24.49 
 
 		 514 aa  104  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1609  outer membrane efflux protein  25.26 
 
 		 499 aa  95.9  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.184768  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1650  Outer membrane efflux protein  24.8 
 
 		 499 aa  94  5e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0374464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2562  outer membrane efflux protein  26.98 
 
 		 500 aa  91.7  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0520371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1600  outer membrane efflux protein  23.91 
 
 		 499 aa  91.3  4e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.174043  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2551  outer membrane efflux protein  25.8 
 
 		 647 aa  81.6  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0615  Outer membrane protein-like  23.28 
 
 		 577 aa  78.2  0.0000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00243369  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2020  outer membrane efflux protein  21.77 
 
 		 491 aa  74.7  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0936605  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0373  outer membrane efflux protein  26.01 
 
 		 662 aa  75.1  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.540248 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2126  hypothetical protein  23.39 
 
 		 508 aa  71.6  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6409  outer membrane efflux protein  25.28 
 
 		 537 aa  70.5  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0533  outer membrane efflux protein  22.73 
 
 		 762 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1733  outer membrane efflux protein  26.48 
 
 		 559 aa  56.6  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0025  outer membrane efflux protein  23.19 
 
 		 486 aa  56.2  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.245374  normal  0.08145 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1445  outer membrane efflux protein  23.37 
 
 		 690 aa  55.8  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.757577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1351  outer membrane efflux protein  26.32 
 
 		 528 aa  55.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.225814  normal  0.0380363 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1671  outer membrane efflux protein  25.73 
 
 		 461 aa  54.7  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0066  outer membrane efflux protein  26.71 
 
 		 436 aa  53.9  0.000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2201  outer membrane efflux protein  21.54 
 
 		 587 aa  53.5  0.000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.854853  normal  0.28263 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1967  outer membrane efflux protein  21.74 
 
 		 443 aa  53.1  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000399706  normal  0.35271 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3737  outer membrane efflux protein  21.69 
 
 		 437 aa  52.8  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.315415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4284  outer membrane efflux protein  23.78 
 
 		 447 aa  53.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4153  outer membrane efflux protein  24.03 
 
 		 447 aa  51.6  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2529  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.74 
 
 		 485 aa  50.8  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.918806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4306  outer membrane efflux protein  23.45 
 
 		 447 aa  50.8  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3202  hypothetical protein  30.28 
 
 		 223 aa  50.1  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.413653  normal  0.147493 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2899  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.66 
 
 		 504 aa  49.7  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0364  outer membrane channel protein  24.05 
 
 		 500 aa  48.5  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0962  outer membrane efflux protein  21.14 
 
 		 464 aa  49.3  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000066626  normal  0.118679 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0549  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  24.31 
 
 		 501 aa  48.1  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.569542  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0954  outer membrane efflux protein  22.74 
 
 		 463 aa  47.8  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4162  outer membrane efflux protein  22.48 
 
 		 443 aa  47.8  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000533026  normal  0.288124 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6770  outer membrane efflux protein  24.02 
 
 		 488 aa  46.6  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  23.51 
 
 		 441 aa  46.6  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3997  Outer membrane protein-like protein  24.84 
 
 		 486 aa  45.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000837564 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2818  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.39 
 
 		 469 aa  45.1  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.282777  normal  0.979363 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0580  putative outer membrane transport protein  23.53 
 
 		 451 aa  44.3  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0516  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  23.91 
 
 		 500 aa  44.7  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0482869  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0583  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.94 
 
 		 477 aa  44.7  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.196176  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0651  outer membrane efflux protein  26.15 
 
 		 524 aa  44.3  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.703393  normal  0.0209094 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0833  outer membrane efflux protein  24.49 
 
 		 496 aa  43.9  0.006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3124  outer membrane efflux protein  28.39 
 
 		 448 aa  43.9  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0545  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  23.38 
 
 		 470 aa  43.9  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3970  Outer membrane efflux protein  24.75 
 
 		 426 aa  43.9  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214282  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>