More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_02837 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013456  VEA_003047  type I secretion TolC precursor  83.22 
 
 
423 aa  728    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02837  hypothetical protein  100 
 
 
423 aa  851    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1170  putative outer membrane protein TolC  47.82 
 
 
419 aa  389  1e-107  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.109696  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0430  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.61 
 
 
436 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000114483  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03690  outer membrane channel precursor protein  24.84 
 
 
462 aa  121  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000344286  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0366  putative secretion protein  24.34 
 
 
454 aa  114  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.676066  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4181  outer membrane channel protein  24.6 
 
 
449 aa  112  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3926  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.61 
 
 
441 aa  108  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3563  outer membrane channel protein  24.4 
 
 
434 aa  108  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000135514  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0544  outer membrane channel protein  24.67 
 
 
448 aa  107  5e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000576987  normal  0.601769 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0768  outer membrane channel protein  24.6 
 
 
435 aa  107  5e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000309945  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0802  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.29 
 
 
453 aa  106  8e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3225  outer membrane channel protein  25.17 
 
 
432 aa  105  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000929322  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3904  outer membrane channel protein  24.14 
 
 
435 aa  103  6e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0753  outer membrane channel protein  23.53 
 
 
435 aa  103  6e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000555232  normal  0.0190145 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3236  outer membrane channel protein  23.53 
 
 
435 aa  102  9e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000456355  hitchhiker  0.0000511139 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0725  outer membrane channel protein  23.22 
 
 
435 aa  102  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000245313  hitchhiker  0.000963429 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0813  outer membrane channel protein  22.57 
 
 
435 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000621601  normal  0.257824 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3578  outer membrane channel protein  22.57 
 
 
435 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000408694  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0806  outer membrane channel protein  22.57 
 
 
435 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000113836  hitchhiker  0.0000000000882186 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0781  outer membrane channel protein  22.57 
 
 
435 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000184345  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3157  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.88 
 
 
442 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.262509 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3332  outer membrane channel protein  24.5 
 
 
431 aa  100  4e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0563453  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2457  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.42 
 
 
449 aa  100  6e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3048  outer membrane channel protein  22.42 
 
 
432 aa  99.8  9e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000973822  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2639  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.34 
 
 
461 aa  99.4  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1746  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.18 
 
 
446 aa  99  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2630  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.9 
 
 
489 aa  98.6  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0774  outer membrane channel protein  23.27 
 
 
441 aa  96.7  6e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000983275  unclonable  0.000000000104798 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0381  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.53 
 
 
445 aa  95.9  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0230254  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3356  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.53 
 
 
442 aa  96.3  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.431157  normal  0.886803 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1304  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.02 
 
 
446 aa  95.9  1e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000151154  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2558  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.51 
 
 
452 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.431388  normal  0.101058 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2883  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.36 
 
 
442 aa  92  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00170075  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2013  outer membrane channel protein  25.06 
 
 
438 aa  91.3  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000158125  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4195  outer membrane channel protein  23.25 
 
 
443 aa  91.3  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000611538  hitchhiker  0.000431125 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2675  outer membrane channel protein  23.74 
 
 
441 aa  90.5  5e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00869  outer membrane channel protein  24.7 
 
 
445 aa  90.1  7e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0695  porin (omp) ABC transporter protein  24.27 
 
 
484 aa  89  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0288188  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0935  Type I secretion outer membrane protein, TolC  22.55 
 
 
469 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.219048  normal  0.252651 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004522  type I secretion TolC precursor  23.8 
 
 
442 aa  89.4  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000301167  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1598  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.2 
 
 
459 aa  88.2  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.538573  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16260  Type I secretion outer membrane protein  23.83 
 
 
472 aa  88.6  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4268  outer membrane channel protein  24.41 
 
 
497 aa  87.8  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0102816 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0744  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.58 
 
 
449 aa  87  5e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.291612  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2534  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.56 
 
 
468 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1407  type I secretion outer membrane protein, TolC family  21.79 
 
 
451 aa  85.1  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1022  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.85 
 
 
489 aa  84.3  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.15714  normal  0.470087 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2711  Type I secretion outer membrane protein TolC  22.42 
 
 
493 aa  84.7  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1705  Outer membrane efflux protein  22.49 
 
 
436 aa  83.2  0.000000000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.370592  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0645  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.54 
 
 
488 aa  82.8  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.173394 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3343  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.17 
 
 
452 aa  81.6  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1266  outer membrane efflux protein  22.03 
 
 
444 aa  82  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1642  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.38 
 
 
446 aa  81.6  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.779397 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0654  outer membrane channel protein  24.19 
 
 
464 aa  80.9  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.945309  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3468  outer membrane channel protein  24.24 
 
 
495 aa  80.9  0.00000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0175451  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0573  outer membrane channel protein  24.19 
 
 
464 aa  80.9  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0019  outer membrane efflux protein  23.72 
 
 
440 aa  80.9  0.00000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4349  outer membrane channel protein  24 
 
 
493 aa  80.5  0.00000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.823303  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02907  outer membrane channel precursor protein  24 
 
 
493 aa  80.5  0.00000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0665  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24 
 
 
493 aa  80.5  0.00000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3330  outer membrane channel protein  24 
 
 
493 aa  80.1  0.00000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3213  outer membrane channel protein  24 
 
 
495 aa  80.5  0.00000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00955114  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02857  hypothetical protein  24 
 
 
493 aa  80.5  0.00000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3499  outer membrane channel protein  24 
 
 
495 aa  80.5  0.00000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0404091  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0662  outer membrane channel protein  24 
 
 
493 aa  80.5  0.00000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.120975  normal  0.0171626 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1228  agglutination protein  23.56 
 
 
445 aa  80.1  0.00000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000902456  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0543  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.83 
 
 
479 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.991736 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02621  outer membrane protein required for AvrXa21 activity C (raxC)  25.53 
 
 
443 aa  79.3  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3448  outer membrane channel protein  22.95 
 
 
494 aa  79  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.203909 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0284  outer membrane channel protein  24.83 
 
 
465 aa  79  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001579  agglutination protein  24.41 
 
 
437 aa  78.2  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.582339  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0498  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.14 
 
 
494 aa  78.2  0.0000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0718  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.02 
 
 
442 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4977  outer membrane efflux protein TolC, putative  24.6 
 
 
479 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  23.65 
 
 
419 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02379  hypothetical protein  21.43 
 
 
436 aa  77  0.0000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003406  agglutination protein  22.38 
 
 
423 aa  77.4  0.0000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0604  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.09 
 
 
478 aa  77  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.836386 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3777  outer membrane channel protein  23.77 
 
 
470 aa  77  0.0000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0611  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.49 
 
 
464 aa  77  0.0000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2283  Type I secretion outer membrane protein, TolC  20.99 
 
 
480 aa  77  0.0000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1338  type I secretion outer membrane protein, TolC family  21.54 
 
 
456 aa  77  0.0000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0728783  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0364  outer membrane channel protein  23.01 
 
 
500 aa  75.9  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1407  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.74 
 
 
471 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.267158 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1282  outer membrane efflux protein  22.22 
 
 
446 aa  74.3  0.000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0406152  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0585  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.39 
 
 
456 aa  73.9  0.000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.449084  normal  0.127961 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003403  agglutination protein  21.98 
 
 
436 aa  73.9  0.000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000998881  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3539  outer membrane channel protein  23.69 
 
 
489 aa  73.9  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.735558  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1798  outer membrane efflux protein  21.53 
 
 
471 aa  73.6  0.000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.337857  normal  0.0360275 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2069  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.96 
 
 
452 aa  73.6  0.000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0736  hypothetical protein  22.79 
 
 
455 aa  73.6  0.000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1126  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.06 
 
 
450 aa  73.6  0.000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3372  outer membrane channel protein  23.74 
 
 
489 aa  73.6  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.258775 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3444  outer membrane channel protein  23.74 
 
 
489 aa  73.2  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.606184  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3367  outer membrane channel protein  23.74 
 
 
489 aa  73.2  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3437  outer membrane channel protein  23.74 
 
 
489 aa  73.2  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0483  type I secretion outer membrane protein, TolC  23.95 
 
 
440 aa  73.6  0.000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2203  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.27 
 
 
441 aa  73.2  0.000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.917815  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3457  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.86 
 
 
434 aa  72.4  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>