111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0373 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_0373  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 662 aa  1343    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.540248 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1445  outer membrane efflux protein  46.53 
 
 		 690 aa  464  1e-129  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.757577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2551  outer membrane efflux protein  31.33 
 
 		 647 aa  264  4.999999999999999e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1609  outer membrane efflux protein  25.92 
 
 		 499 aa  117  5e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.184768  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1650  Outer membrane efflux protein  25.59 
 
 		 499 aa  117  5e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0374464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0651  outer membrane efflux protein  25.65 
 
 		 524 aa  114  6e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.703393  normal  0.0209094 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1126  outer membrane efflux protein  24.06 
 
 		 514 aa  111  5e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2126  hypothetical protein  23.15 
 
 		 508 aa  110  9.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0025  outer membrane efflux protein  26.15 
 
 		 486 aa  105  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.245374  normal  0.08145 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2027  outer membrane efflux protein  25.43 
 
 		 495 aa  104  6e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000179084 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1600  outer membrane efflux protein  24.34 
 
 		 499 aa  100  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.174043  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2020  outer membrane efflux protein  23.84 
 
 		 491 aa  98.2  4e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0936605  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1733  outer membrane efflux protein  25.59 
 
 		 559 aa  95.9  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1351  outer membrane efflux protein  24.89 
 
 		 528 aa  93.2  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.225814  normal  0.0380363 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1875  outer membrane efflux protein  26.74 
 
 		 506 aa  92  3e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2200  outer membrane efflux protein  24.03 
 
 		 495 aa  90.5  8e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0749  outer membrane efflux protein  23.95 
 
 		 490 aa  85.1  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3981  outer membrane efflux protein  25.67 
 
 		 493 aa  85.1  0.000000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2562  outer membrane efflux protein  24.08 
 
 		 500 aa  82  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0520371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0533  outer membrane efflux protein  23.62 
 
 		 762 aa  79.7  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4093  outer membrane efflux protein  25 
 
 		 514 aa  78.2  0.0000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.66979 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3733  outer membrane efflux protein  25.55 
 
 		 488 aa  76.3  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0954  outer membrane efflux protein  24.38 
 
 		 463 aa  72.4  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2471  outer membrane efflux protein  24.21 
 
 		 481 aa  73.2  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4026  outer membrane efflux protein  24.32 
 
 		 486 aa  71.6  0.00000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2221  outer membrane efflux protein  24.67 
 
 		 590 aa  70.5  0.00000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000846233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5198  outer efflux pump domain-containing protein  22.53 
 
 		 522 aa  70.1  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0545953 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1217  outer membrane efflux protein  25.58 
 
 		 438 aa  69.3  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.87899  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0090  hypothetical protein  23.22 
 
 		 731 aa  66.6  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0894  outer membrane efflux protein  23.46 
 
 		 487 aa  65.9  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3558  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25.77 
 
 		 472 aa  62.4  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.445028  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2805  outer membrane efflux protein  21.75 
 
 		 685 aa  61.6  0.00000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.977623  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0733  outer membrane efflux protein, putative  24.18 
 
 		 463 aa  60.8  0.00000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0615  Outer membrane protein-like  25.17 
 
 		 577 aa  60.5  0.00000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00243369  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0837  outer membrane efflux protein  24.07 
 
 		 462 aa  60.5  0.00000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1761  hypothetical protein  24.69 
 
 		 576 aa  59.7  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60770  putative outer membrane protein  23.3 
 
 		 493 aa  60.5  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1907  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25.21 
 
 		 472 aa  59.3  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0040  type I secretion outer membrane protein  21.45 
 
 		 507 aa  59.7  0.0000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.99479  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5232  hypothetical protein  24.21 
 
 		 493 aa  58.5  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2010  outer membrane efflux family protein  22.02 
 
 		 509 aa  58.2  0.0000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2201  outer membrane efflux protein  21.97 
 
 		 587 aa  56.6  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.854853  normal  0.28263 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1884  outer membrane efflux protein  20.94 
 
 		 483 aa  57  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6409  outer membrane efflux protein  22.17 
 
 		 537 aa  55.8  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3959  Outer membrane protein-like protein  22.67 
 
 		 472 aa  55.1  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2013  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.58 
 
 		 472 aa  55.5  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.226354  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1967  outer membrane efflux protein  24.57 
 
 		 443 aa  55.1  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000399706  normal  0.35271 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6770  outer membrane efflux protein  23.41 
 
 		 488 aa  54.3  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1617  outer membrane efflux protein  22.1 
 
 		 467 aa  54.3  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4162  outer membrane efflux protein  23.25 
 
 		 443 aa  54.3  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000533026  normal  0.288124 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0962  outer membrane efflux protein  22.13 
 
 		 464 aa  54.3  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000066626  normal  0.118679 
 
 
-
 
NC_002950  PG1667  outer membrane efflux protein  26.28 
 
 		 455 aa  52.8  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1190  Outer membrane efflux protein  20.79 
 
 		 510 aa  52.4  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4169  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.65 
 
 		 470 aa  52.8  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2028  Outer membrane protein-like protein  23.51 
 
 		 617 aa  52.4  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.950233  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0605  outer membrane efflux protein  22.44 
 
 		 470 aa  52  0.00004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0545  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  22.69 
 
 		 470 aa  51.2  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0105  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  24.21 
 
 		 457 aa  51.2  0.00006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.265235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1054  outer membrane efflux protein  25.21 
 
 		 514 aa  50.8  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000452487  normal  0.217723 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1827  outer membrane efflux protein  22.02 
 
 		 496 aa  50.8  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.115006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2169  outer membrane toxin secretion efflux protein, putative  22.02 
 
 		 496 aa  50.8  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0516  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  22.02 
 
 		 500 aa  50.8  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0482869  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0833  outer membrane efflux protein  22.62 
 
 		 496 aa  50.1  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2992  hypothetical protein  22.93 
 
 		 542 aa  49.3  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1826  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.68 
 
 		 487 aa  49.3  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2852  hypothetical protein  22.93 
 
 		 542 aa  49.3  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0961  Outer membrane protein-like  22.22 
 
 		 491 aa  48.9  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0234127  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3645  outer membrane efflux protein  25 
 
 		 514 aa  48.5  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.784148  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4722  outer membrane efflux protein  25 
 
 		 514 aa  48.5  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0674524  decreased coverage  0.00195148 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5578  outer membrane efflux protein  25 
 
 		 514 aa  48.5  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0232692  hitchhiker  0.00628536 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0627  outer membrane efflux protein, putative  24.72 
 
 		 470 aa  48.1  0.0005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.173588  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2441  outer membrane efflux protein  23.73 
 
 		 453 aa  48.1  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2866  outer membrane efflux protein  22.72 
 
 		 480 aa  47.8  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0685652 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3096  outer membrane efflux protein  21.89 
 
 		 497 aa  46.6  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1338  type I secretion outer membrane protein, TolC family  22.72 
 
 		 456 aa  47  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0728783  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3453  putative tolC outer membrane protein  26.13 
 
 		 438 aa  46.6  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.341393 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1951  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.24 
 
 		 480 aa  46.6  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3973  outer membrane efflux protein  25.14 
 
 		 513 aa  47  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0704049 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4505  outer membrane efflux protein  22.63 
 
 		 972 aa  46.2  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.300614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0066  outer membrane efflux protein  21.38 
 
 		 436 aa  46.2  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1482  outer membrane efflux protein  23.72 
 
 		 471 aa  46.6  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.387043 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0364  outer membrane channel protein  23.64 
 
 		 500 aa  45.4  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1135  outer membrane protein TolC, putative  22.67 
 
 		 480 aa  45.8  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.196284  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1990  outer membrane efflux protein  24.54 
 
 		 471 aa  45.4  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.154832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1150  outer membrane efflux protein  23.93 
 
 		 746 aa  45.8  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3126  outer membrane efflux protein  22.22 
 
 		 444 aa  45.8  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1841  outer membrane efflux protein  22.05 
 
 		 471 aa  45.1  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.285879 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3534  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.06 
 
 		 483 aa  45.1  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00132321  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1738  putative outer membrane protein TolC  22.33 
 
 		 521 aa  45.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1690  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25 
 
 		 478 aa  45.1  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.522729 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0176  outer membrane efflux protein  28.04 
 
 		 536 aa  44.7  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0549  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  22.15 
 
 		 501 aa  44.7  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.569542  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0997  putative outer membrane protein TolC  22.33 
 
 		 476 aa  44.7  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.471122  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0296  outer membrane protein TolC, putative  22.33 
 
 		 476 aa  44.7  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.618695  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0269  putative outer membrane protein TolC  22.33 
 
 		 476 aa  44.7  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0165015  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1822  putative outer membrane protein TolC  22.67 
 
 		 476 aa  44.7  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0124  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.96 
 
 		 525 aa  44.3  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.78298 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3626  outer membrane efflux protein  22.78 
 
 		 627 aa  44.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0887926  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0543  Type I secretion outer membrane protein, TolC  21.9 
 
 		 479 aa  44.3  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.991736 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0388  RND efflux system, outer membrane lipoprotein CmeC  20.1 
 
 		 492 aa  44.3  0.007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>