283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1698 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1698  outer membrane efflux protein  100 
 
 
433 aa  866    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.572085  normal  0.0641673 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1723  outer membrane efflux protein  36.6 
 
 
436 aa  220  5e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  29.47 
 
 
419 aa  134  3e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3710  outer membrane efflux protein  27.96 
 
 
419 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1177  outer membrane efflux protein  28.88 
 
 
427 aa  114  3e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3409  outer membrane efflux protein  28.92 
 
 
419 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000155286  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0224  outer membrane efflux protein  27.38 
 
 
419 aa  107  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000720591  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1165  Outer membrane efflux protein  29.54 
 
 
462 aa  96.3  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1884  outer membrane efflux protein  24.1 
 
 
483 aa  95.9  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0627  outer membrane efflux protein, putative  25 
 
 
470 aa  94  5e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.173588  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0950  outer membrane efflux protein  27.05 
 
 
424 aa  92.4  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0066  outer membrane efflux protein  27.7 
 
 
436 aa  87.8  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3165  outer membrane efflux protein  30.09 
 
 
445 aa  87.8  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.391786  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0833  outer membrane efflux protein  24.94 
 
 
496 aa  87.8  4e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  24.54 
 
 
441 aa  87  6e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1617  outer membrane efflux protein  22.84 
 
 
467 aa  86.7  7e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2969  outer membrane efflux protein  30.48 
 
 
443 aa  86.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.725894  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0837  outer membrane efflux protein  22.93 
 
 
462 aa  85.5  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3057  outer membrane efflux protein  29.79 
 
 
440 aa  85.1  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.969203  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0096  outer membrane efflux protein  24.48 
 
 
441 aa  84.7  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0954  outer membrane efflux protein  23.33 
 
 
463 aa  84.7  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0733  outer membrane efflux protein, putative  22.44 
 
 
463 aa  80.1  0.00000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4182  outer membrane efflux protein  28.69 
 
 
431 aa  79.7  0.00000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256436  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3096  outer membrane efflux protein  26.36 
 
 
497 aa  79.3  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1749  outer membrane efflux protein  21.94 
 
 
458 aa  78.6  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3853  outer membrane efflux protein  30 
 
 
447 aa  79  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1727  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.37 
 
 
452 aa  78.6  0.0000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000826676  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0961  Outer membrane protein-like  23.97 
 
 
491 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0234127  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0120  outer membrane efflux protein  23.36 
 
 
448 aa  76.6  0.0000000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000165447  hitchhiker  0.000000000000561163 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5561  outer membrane efflux protein  28.48 
 
 
431 aa  76.3  0.0000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0364  outer membrane channel protein  24.11 
 
 
500 aa  75.9  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0071  outer membrane efflux protein  23.87 
 
 
441 aa  76.3  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0066  outer membrane efflux protein  23.74 
 
 
443 aa  76.3  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0057  outer membrane protein, putative  23.82 
 
 
470 aa  75.5  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4284  outer membrane efflux protein  25 
 
 
447 aa  75.1  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4153  outer membrane efflux protein  25.51 
 
 
447 aa  75.5  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3937  outer membrane efflux protein  29.05 
 
 
447 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00157367 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1633  outer membrane efflux protein  26.84 
 
 
420 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.159543  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4306  outer membrane efflux protein  25 
 
 
447 aa  74.3  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1761  hypothetical protein  26.76 
 
 
576 aa  72  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2441  outer membrane efflux protein  25.53 
 
 
453 aa  71.6  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2021  outer membrane efflux protein  25.99 
 
 
437 aa  71.2  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2365  outer membrane efflux protein  28.01 
 
 
482 aa  71.2  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.316372 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2630  Type I secretion outer membrane protein, TolC  27.92 
 
 
489 aa  70.9  0.00000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  25.36 
 
 
1470 aa  70.1  0.00000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3973  outer membrane efflux protein  30.82 
 
 
513 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0704049 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2704  outer membrane efflux protein  26.19 
 
 
423 aa  69.7  0.00000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2629  outer membrane efflux protein  26.75 
 
 
421 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111539  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3627  outer membrane efflux protein  26.65 
 
 
461 aa  68.9  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.433273  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2950  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.16 
 
 
479 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1606  outer membrane efflux protein  27.39 
 
 
421 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2173  outer membrane efflux protein  24.02 
 
 
448 aa  68.6  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3628  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.18 
 
 
479 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.93917  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1721  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.86 
 
 
482 aa  67  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.456925  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  25.48 
 
 
1496 aa  67  0.0000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3155  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.86 
 
 
482 aa  67  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.267117  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2799  outer membrane efflux protein  24.7 
 
 
435 aa  67  0.0000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000194078  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0046  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.86 
 
 
471 aa  67  0.0000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1629  outer membrane efflux protein  24.87 
 
 
438 aa  66.6  0.0000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2822  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.86 
 
 
479 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.390937  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3620  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.86 
 
 
482 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3644  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.86 
 
 
471 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1143  outer membrane efflux protein  23.2 
 
 
455 aa  66.2  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0286987  normal  0.128527 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1376  Outer membrane efflux protein  24.77 
 
 
435 aa  65.9  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.109779  hitchhiker  0.00244241 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0903  outer membrane efflux protein  27.71 
 
 
436 aa  65.9  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.331424  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0740  outer membrane efflux protein  30.12 
 
 
445 aa  65.1  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.783995  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2724  outer membrane efflux protein  22.42 
 
 
440 aa  65.1  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.190068  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0762  outer membrane efflux protein  23.19 
 
 
446 aa  65.1  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0945  secretion protein  26.05 
 
 
472 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0814  outer membrane efflux protein  23.68 
 
 
460 aa  64.7  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3056  outer membrane efflux protein  24.69 
 
 
485 aa  64.3  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.111107 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1054  outer membrane efflux protein  28.57 
 
 
514 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000452487  normal  0.217723 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0863  outer membrane efflux protein  22.2 
 
 
476 aa  63.2  0.000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0409869  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4162  outer membrane efflux protein  23.7 
 
 
443 aa  62.4  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000533026  normal  0.288124 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1955  outer membrane efflux protein  26.3 
 
 
476 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.223795  normal  0.557378 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10330  putative outer membrane protein precursor  23.51 
 
 
471 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.339948  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1266  outer membrane efflux protein  23.6 
 
 
444 aa  62.4  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0498  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.68 
 
 
494 aa  61.6  0.00000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3904  outer membrane channel protein  24.06 
 
 
435 aa  61.2  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5578  outer membrane efflux protein  27.03 
 
 
514 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0232692  hitchhiker  0.00628536 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3645  outer membrane efflux protein  27.03 
 
 
514 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.784148  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4722  outer membrane efflux protein  27.03 
 
 
514 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0674524  decreased coverage  0.00195148 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2001  outer membrane efflux protein  22.54 
 
 
473 aa  60.5  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.612283  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0538  outer membrane efflux protein  22.4 
 
 
462 aa  60.8  0.00000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2368  outer membrane efflux protein  22.54 
 
 
473 aa  60.5  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0254327  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0453  Outer membrane efflux protein  25.94 
 
 
470 aa  60.5  0.00000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1789  outer membrane efflux protein  27.32 
 
 
493 aa  60.5  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3563  outer membrane channel protein  24.48 
 
 
434 aa  60.5  0.00000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000135514  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0242  outer membrane efflux protein  25.17 
 
 
444 aa  60.1  0.00000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.231209  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2350  outer membrane efflux protein  22.69 
 
 
441 aa  60.1  0.00000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0162  outer membrane efflux protein  23.85 
 
 
433 aa  60.1  0.00000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2145  outer membrane efflux protein  26.01 
 
 
472 aa  60.1  0.00000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0192834 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4579  outer membrane efflux protein  27.04 
 
 
515 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0188996  decreased coverage  0.000000771093 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1482  outer membrane efflux protein  26.15 
 
 
426 aa  60.1  0.00000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.979092  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0580  putative outer membrane transport protein  23.89 
 
 
451 aa  59.7  0.00000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3626  outer membrane efflux protein  25.45 
 
 
627 aa  59.7  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0887926  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4114  outer membrane efflux protein  28.4 
 
 
519 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.865486  normal  0.0282956 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0283  outer membrane efflux protein  27.42 
 
 
439 aa  58.5  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0278  outer membrane efflux protein  23.26 
 
 
441 aa  58.2  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000626538  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2633  outer membrane efflux protein  22.92 
 
 
424 aa  58.2  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>