More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2148 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_2148  TolC family type I secretion outer membrane protein  100 
 
 
497 aa  990    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.400858  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4008  TolC family type I secretion outer membrane protein  40.4 
 
 
562 aa  293  3e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3004  TolC family type I secretion outer membrane protein  43.27 
 
 
464 aa  290  3e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.599739 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6495  type I secretion outer membrane protein, TolC family  40.32 
 
 
518 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5878  TolC family type I secretion outer membrane protein  40.68 
 
 
463 aa  266  5e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.539647  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1003  TolC family type I secretion outer membrane protein  42.67 
 
 
462 aa  262  1e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2577  Type I secretion outer membrane protein, TolC  38.96 
 
 
522 aa  259  6e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00589159 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2851  type I secretion outer membrane protein, TolC family  38.68 
 
 
463 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2894  Type I secretion outer membrane protein, TolC  38.38 
 
 
460 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386257  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1826  Type I secretion outer membrane protein, TolC  37.36 
 
 
487 aa  246  4.9999999999999997e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3231  TolC family type I secretion outer membrane protein  37.75 
 
 
483 aa  246  6e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2243  TolC family type I secretion outer membrane protein  37.23 
 
 
455 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2597  type I secretion outer membrane protein, TolC family  36.72 
 
 
492 aa  243  3.9999999999999997e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1798  Type I secretion outer membrane protein, TolC  38.06 
 
 
538 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.99988  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3945  putative outer membrane protein tolC precursor  36.59 
 
 
461 aa  239  6.999999999999999e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.8738  normal  0.222307 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0938  outer membrane efflux family protein  38.34 
 
 
452 aa  239  9e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1434  type I secretion outer membrane protein, TolC  37.17 
 
 
490 aa  239  1e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.44207  normal  0.675589 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1725  TolC family type I secretion outer membrane protein  36.3 
 
 
489 aa  239  1e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.736299  normal  0.0102072 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1690  type I secretion outer membrane protein, TolC family  35.17 
 
 
478 aa  238  2e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.522729 
 
 
-
 
NC_004310  BR0945  outer membrane efflux family protein  38.13 
 
 
456 aa  238  3e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.681331  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5239  type I secretion outer membrane protein, TolC family  38.13 
 
 
488 aa  237  3e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5161  type I secretion outer membrane protein, TolC family  38.28 
 
 
488 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.451764  normal  0.264948 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4696  TolC family type I secretion outer membrane protein  38.28 
 
 
497 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1096  TolC family type I secretion outer membrane protein  37.47 
 
 
494 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.739146 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1453  type I secretion outer membrane protein, TolC family  35.62 
 
 
480 aa  234  3e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0186  Type I secretion outer membrane protein, TolC  36.85 
 
 
485 aa  233  4.0000000000000004e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2568  Type I secretion outer membrane protein, TolC  37.67 
 
 
464 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1569  TolC family type I secretion outer membrane protein  38.12 
 
 
461 aa  228  2e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.151598  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4823  TolC family type I secretion outer membrane protein  39.53 
 
 
446 aa  228  3e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2686  Outer membrane secretion protein  36.3 
 
 
472 aa  226  1e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.553025  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1149  TolC family type I secretion outer membrane protein  37.66 
 
 
456 aa  225  1e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.435165  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3558  Type I secretion outer membrane protein, TolC  35.95 
 
 
472 aa  223  9e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.445028  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4235  TolC family type I secretion outer membrane protein  34.76 
 
 
463 aa  219  8.999999999999998e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.902691  normal  0.529157 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2013  type I secretion outer membrane protein, TolC family  35.06 
 
 
472 aa  219  1e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.226354  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1907  Type I secretion outer membrane protein, TolC  35.15 
 
 
472 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1894  TolC family type I secretion outer membrane protein  36.54 
 
 
466 aa  216  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.170185  normal  0.445756 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3004  putative outer TolC membrane protein  34.06 
 
 
469 aa  216  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.833992 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3453  putative tolC outer membrane protein  34.17 
 
 
438 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.341393 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0251  Outer membrane efflux protein  36.54 
 
 
466 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.608595  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2583  Type I secretion outer membrane protein, TolC  37.83 
 
 
497 aa  213  7.999999999999999e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.655757 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2024  TolC family type I secretion outer membrane protein  36.04 
 
 
465 aa  208  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5432  TolC family type I secretion outer membrane protein  36.87 
 
 
553 aa  204  3e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.199925  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2262  Type I secretion outer membrane protein, TolC  35.91 
 
 
497 aa  202  9e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0148702  normal  0.873765 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2098  putative outer membrane protein tolC  36.73 
 
 
456 aa  201  3e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1781  TolC family type I secretion outer membrane protein  34.97 
 
 
517 aa  199  7.999999999999999e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0863506  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3542  type I secretion outer membrane protein, TolC family  36.12 
 
 
477 aa  189  1e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3257  Type I secretion outer membrane protein, TolC  32.35 
 
 
462 aa  183  6e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.30122  normal  0.885594 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1445  type I secretion outer membrane protein, TolC family  36.55 
 
 
460 aa  181  2e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.40462 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0652  TolC family type I secretion outer membrane protein  30.98 
 
 
428 aa  172  1e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000458305  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1991  Type I secretion outer membrane protein, TolC  32.29 
 
 
473 aa  172  2e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.533391  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0246  Type I secretion outer membrane protein, TolC  33.41 
 
 
538 aa  166  5.9999999999999996e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2727  TolC family type I secretion outer membrane protein  34.37 
 
 
464 aa  161  3e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.226974  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0685  TolC family type I secretion outer membrane protein  31.66 
 
 
405 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000118649  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0722  TolC family type I secretion outer membrane protein  31.14 
 
 
449 aa  146  7.0000000000000006e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.278359  normal  0.698539 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1020  putative outer membrane protein TolC  25.5 
 
 
423 aa  133  6e-30  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.808388  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0823  Outer membrane efflux protein  25.12 
 
 
432 aa  121  3e-26  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0383439  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2013  outer membrane channel protein  27.91 
 
 
438 aa  119  1.9999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000158125  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0546  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.67 
 
 
444 aa  118  3e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00869  outer membrane channel protein  28.67 
 
 
445 aa  117  6e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0543  Type I secretion outer membrane protein, TolC  29.35 
 
 
479 aa  116  8.999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.991736 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0491  Type I secretion outer membrane protein, TolC  27.9 
 
 
477 aa  116  8.999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00611692  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2711  Type I secretion outer membrane protein TolC  28.25 
 
 
493 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6073  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.8 
 
 
457 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.523429 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1041  type I secretion outer membrane efflux protein  27.78 
 
 
451 aa  113  9e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0433  type I secretion outer membrane protein, TolC family protein  26.3 
 
 
469 aa  113  9e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.462048  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4977  outer membrane efflux protein TolC, putative  29.25 
 
 
479 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5970  Type I secretion outer membrane protein, TolC  28.13 
 
 
442 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6370  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.8 
 
 
456 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.668018  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3777  outer membrane channel protein  26.98 
 
 
470 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3619  outer membrane channel protein  28.21 
 
 
469 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0610  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.51 
 
 
480 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2534  Type I secretion outer membrane protein, TolC  26.35 
 
 
468 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4715  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.56 
 
 
477 aa  111  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.133912 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004522  type I secretion TolC precursor  27.27 
 
 
442 aa  111  3e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000301167  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0323  outer membrane channel protein  27.19 
 
 
463 aa  111  3e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000673159  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4799  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.42 
 
 
477 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.125067  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4923  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.51 
 
 
477 aa  109  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65750  putative outer membrane efflux protein precursor  27.31 
 
 
482 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0604  type I secretion outer membrane protein, TolC family  27.69 
 
 
478 aa  108  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.836386 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5705  outer membrane efflux protein  28.34 
 
 
481 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4976  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.64 
 
 
478 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0943  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.54 
 
 
481 aa  107  4e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.359214  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2697  type I secretion outer membrane protein, TolC  26.85 
 
 
437 aa  105  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0313  outer membrane channel protein  26.73 
 
 
463 aa  105  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3261  type I secretion outer membrane protein, TolC  26.22 
 
 
469 aa  104  3e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.537181 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2097  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.83 
 
 
633 aa  103  5e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0749  Type I secretion outer membrane protein, TolC  27.77 
 
 
497 aa  104  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3809  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.12 
 
 
457 aa  103  6e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0041623 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02379  hypothetical protein  24.02 
 
 
436 aa  103  7e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0695  porin (omp) ABC transporter protein  26.7 
 
 
484 aa  102  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0288188  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2457  type I secretion outer membrane protein, TolC family  27.31 
 
 
449 aa  102  1e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3093  outer membrane protein  30.23 
 
 
503 aa  102  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0645  type I secretion outer membrane protein, TolC family  26.97 
 
 
488 aa  102  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.173394 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4519  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.82 
 
 
452 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03690  outer membrane channel precursor protein  26 
 
 
462 aa  102  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000344286  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3958  TolC family type I secretion outer membrane protein  29.19 
 
 
491 aa  102  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.753849  normal  0.338977 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2156  outer membrane export factor  28.29 
 
 
452 aa  101  3e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2830  TolC family type I secretion outer membrane protein  30.18 
 
 
455 aa  101  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0538261  hitchhiker  0.00247347 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1990  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.54 
 
 
498 aa  101  3e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3236  outer membrane channel protein  26.83 
 
 
435 aa  101  3e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000456355  hitchhiker  0.0000511139 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>