More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS03674 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS03674  putative outer membrane CHANEL lipoprotein  100 
 
 		 488 aa  985    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.119855 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2367  outer membrane efflux protein  52.02 
 
 		 495 aa  456  1e-127  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5005  outer membrane efflux protein  49.69 
 
 		 485 aa  351  2e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.844775 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5155  outer membrane efflux protein  52.36 
 
 		 481 aa  349  7e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.239334  normal  0.865316 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6770  outer membrane efflux protein  36.34 
 
 		 488 aa  221  3e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1165  Outer membrane efflux protein  40.24 
 
 		 462 aa  215  9.999999999999999e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3628  TolC family type I secretion outer membrane protein  38.04 
 
 		 479 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.93917  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3644  TolC family type I secretion outer membrane protein  37.95 
 
 		 471 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2950  TolC family type I secretion outer membrane protein  37.8 
 
 		 479 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0945  secretion protein  37.33 
 
 		 472 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2822  TolC family type I secretion outer membrane protein  38.04 
 
 		 479 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.390937  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3620  TolC family type I secretion outer membrane protein  38.04 
 
 		 482 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3155  TolC family type I secretion outer membrane protein  38.04 
 
 		 482 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.267117  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0046  TolC family type I secretion outer membrane protein  38.04 
 
 		 471 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1721  TolC family type I secretion outer membrane protein  38.04 
 
 		 482 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.456925  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10330  putative outer membrane protein precursor  36.87 
 
 		 471 aa  209  1e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.339948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1727  type I secretion outer membrane protein, TolC family  33.72 
 
 		 452 aa  206  7e-52  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000826676  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3056  outer membrane efflux protein  34.42 
 
 		 485 aa  188  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111107 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1955  outer membrane efflux protein  34.62 
 
 		 476 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.223795  normal  0.557378 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1021  outer membrane efflux protein  32.7 
 
 		 528 aa  147  6e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1759  outer membrane efflux protein  29.03 
 
 		 738 aa  143  7e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0239  outer membrane efflux protein  29.69 
 
 		 521 aa  129  1.0000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.368646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4144  alkaline protease secretion protein AprF  29.13 
 
 		 477 aa  113  8.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0485622  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2169  outer membrane toxin secretion efflux protein, putative  28.4 
 
 		 496 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1827  outer membrane efflux protein  28.4 
 
 		 496 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.115006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48090  alkaline protease secretion outer membrane protein AprF precursor  29.23 
 
 		 481 aa  111  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0152412 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2864  outer membrane efflux protein  29.12 
 
 		 476 aa  110  8.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3265  outer membrane efflux protein  29.12 
 
 		 476 aa  110  8.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0594  outer membrane efflux protein  24.64 
 
 		 508 aa  106  9e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1063  hypothetical protein  24.88 
 
 		 453 aa  105  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.45317 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4579  outer membrane efflux protein  27.18 
 
 		 515 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0188996  decreased coverage  0.000000771093 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0533  outer membrane efflux protein  24.88 
 
 		 453 aa  105  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4114  outer membrane efflux protein  27.14 
 
 		 519 aa  104  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.865486  normal  0.0282956 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2191  outer membrane efflux protein  25.65 
 
 		 508 aa  103  8e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2121  Outer membrane efflux protein  25.17 
 
 		 509 aa  103  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1054  outer membrane efflux protein  28.26 
 
 		 514 aa  102  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000452487  normal  0.217723 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1789  outer membrane efflux protein  31.97 
 
 		 493 aa  95.9  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3973  outer membrane efflux protein  27.23 
 
 		 513 aa  94.4  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0704049 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4722  outer membrane efflux protein  28.82 
 
 		 514 aa  94.4  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0674524  decreased coverage  0.00195148 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5578  outer membrane efflux protein  28.82 
 
 		 514 aa  94.4  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0232692  hitchhiker  0.00628536 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3645  outer membrane efflux protein  28.82 
 
 		 514 aa  94.4  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.784148  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0224  outer membrane efflux protein  25.46 
 
 		 419 aa  94.4  5e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000720591  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4512  outer membrane efflux protein  26.98 
 
 		 520 aa  88.6  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0572559 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4354  Outer membrane efflux protein  28.32 
 
 		 517 aa  88.2  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4977  outer membrane efflux protein TolC, putative  25.97 
 
 		 479 aa  87.4  5e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0491  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25.24 
 
 		 477 aa  87  7e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00611692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1162  outer membrane efflux protein  25.77 
 
 		 515 aa  86.7  9e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000199135  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1177  outer membrane efflux protein  22.76 
 
 		 427 aa  86.3  0.000000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1834  multidrug efflux outer membrane protein EefC  26.46 
 
 		 457 aa  85.9  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000044393 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0543  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25.96 
 
 		 479 aa  84.3  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.991736 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1929  multidrug efflux outer membrane protein EefC  26.21 
 
 		 457 aa  84  0.000000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000583054 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65750  putative outer membrane efflux protein precursor  25.06 
 
 		 482 aa  84  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2443  RND efflux system outer membrane lipoprotein  30.67 
 
 		 544 aa  84  0.000000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.167735  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0768  outer membrane channel protein  24.15 
 
 		 435 aa  83.6  0.000000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000309945  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3841  RND efflux system outer membrane lipoprotein  29.7 
 
 		 490 aa  82.8  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.626052  normal  0.467321 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3457  type I secretion outer membrane protein, TolC family  26.14 
 
 		 434 aa  82.8  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4715  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.99 
 
 		 477 aa  81.3  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.133912 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3563  outer membrane channel protein  22.05 
 
 		 434 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000135514  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3958  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.87 
 
 		 491 aa  80.9  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.753849  normal  0.338977 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3356  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.37 
 
 		 442 aa  80.9  0.00000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.431157  normal  0.886803 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5705  outer membrane efflux protein  24.83 
 
 		 481 aa  80.9  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3737  outer membrane efflux protein  21.83 
 
 		 437 aa  80.9  0.00000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.315415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2059  Outer membrane efflux protein  30.38 
 
 		 513 aa  80.5  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.26387  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1905  outer membrane efflux protein OprA  30.38 
 
 		 516 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1660  hypothetical protein  30.51 
 
 		 516 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.077421  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1891  outer membrane efflux protein OprA  30.15 
 
 		 513 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.271004  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0193  outer membrane efflux protein  24.89 
 
 		 527 aa  79.7  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.339929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0412  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.46 
 
 		 477 aa  79.7  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1798  outer membrane efflux protein  26.5 
 
 		 471 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.337857  normal  0.0360275 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1858  outer membrane efflux protein  31.45 
 
 		 490 aa  79  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.514737  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3453  putative tolC outer membrane protein  25.79 
 
 		 438 aa  78.6  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.341393 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2069  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.74 
 
 		 452 aa  79  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1943  outer membrane efflux protein  31.45 
 
 		 490 aa  79  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.261377  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1664  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.75 
 
 		 453 aa  78.6  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2109  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.68 
 
 		 466 aa  78.2  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4923  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.77 
 
 		 477 aa  78.2  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4976  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.15 
 
 		 478 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1522  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.73 
 
 		 485 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3236  outer membrane channel protein  23.17 
 
 		 435 aa  77.4  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000456355  hitchhiker  0.0000511139 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4799  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.77 
 
 		 477 aa  77.4  0.0000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.125067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0753  outer membrane channel protein  23.9 
 
 		 435 aa  77  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000555232  normal  0.0190145 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1633  outer membrane efflux protein  25.12 
 
 		 470 aa  76.6  0.0000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.788464  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0725  outer membrane channel protein  23.17 
 
 		 435 aa  76.6  0.0000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000245313  hitchhiker  0.000963429 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2156  outer membrane export factor  22.2 
 
 		 452 aa  76.6  0.0000000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1482  outer membrane efflux protein  24.47 
 
 		 426 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.979092  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1545  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.57 
 
 		 485 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.355658 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5237  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  26.55 
 
 		 516 aa  75.9  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.776503  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2338  efflux ABC transporter outer membrane protein  25.93 
 
 		 470 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3225  outer membrane channel protein  23.08 
 
 		 432 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000929322  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1407  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.75 
 
 		 488 aa  76.3  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.380774 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1126  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.84 
 
 		 450 aa  75.9  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1723  outer membrane efflux protein  26.06 
 
 		 436 aa  75.5  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3409  outer membrane efflux protein  25.94 
 
 		 419 aa  75.9  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000155286  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4195  outer membrane channel protein  22.43 
 
 		 443 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000611538  hitchhiker  0.000431125 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0544  outer membrane channel protein  21.55 
 
 		 448 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000576987  normal  0.601769 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1557  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.82 
 
 		 455 aa  75.5  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3777  outer membrane channel protein  23.41 
 
 		 470 aa  75.5  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1600  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.44 
 
 		 483 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.375157 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4268  outer membrane channel protein  23.77 
 
 		 497 aa  75.1  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0102816 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2510  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  26.7 
 
 		 465 aa  75.1  0.000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>