More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0733 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0733  outer membrane efflux protein, putative  100 
 
 
463 aa  932    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0954  outer membrane efflux protein  64.79 
 
 
463 aa  576  1.0000000000000001e-163  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1884  outer membrane efflux protein  63.27 
 
 
483 aa  565  1e-160  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0837  outer membrane efflux protein  62.86 
 
 
462 aa  552  1e-156  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1617  outer membrane efflux protein  55.31 
 
 
467 aa  515  1.0000000000000001e-145  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0833  outer membrane efflux protein  55.46 
 
 
496 aa  466  9.999999999999999e-131  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0627  outer membrane efflux protein, putative  55.08 
 
 
470 aa  461  9.999999999999999e-129  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.173588  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0881  outer membrane efflux protein  31.03 
 
 
535 aa  205  2e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.705042  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5578  outer membrane efflux protein  34.97 
 
 
451 aa  182  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.46516 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  31.8 
 
 
1496 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1475  outer membrane efflux protein  23.96 
 
 
449 aa  136  9e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.236212  normal  0.298581 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3429  outer membrane efflux protein  24.51 
 
 
442 aa  133  6.999999999999999e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.437271  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5506  outer membrane efflux protein  23.49 
 
 
451 aa  132  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.307266  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0538  outer membrane efflux protein  25.51 
 
 
462 aa  130  4.0000000000000003e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  29.78 
 
 
1470 aa  127  5e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1967  outer membrane efflux protein  23.74 
 
 
443 aa  122  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000399706  normal  0.35271 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0162  outer membrane efflux protein  26.4 
 
 
433 aa  121  3e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1143  outer membrane efflux protein  23.5 
 
 
455 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0286987  normal  0.128527 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2517  Outer membrane efflux protein  28.48 
 
 
455 aa  118  3e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0940003  normal  0.677218 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0814  outer membrane efflux protein  27.64 
 
 
460 aa  116  8.999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4162  outer membrane efflux protein  22.32 
 
 
443 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000533026  normal  0.288124 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0120  outer membrane efflux protein  22.15 
 
 
448 aa  114  4.0000000000000004e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000165447  hitchhiker  0.000000000000561163 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3719  outer membrane efflux protein  22.92 
 
 
444 aa  113  7.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.633766  normal  0.0948534 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01970  outer membrane efflux protein, putative  23.06 
 
 
456 aa  112  1.0000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.154405  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0610  outer membrane efflux protein  25.11 
 
 
453 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2515  outer membrane protein  22.8 
 
 
463 aa  110  7.000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2704  outer membrane efflux protein  26.74 
 
 
423 aa  109  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0224  outer membrane efflux protein  25.65 
 
 
419 aa  108  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000720591  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3706  outer membrane efflux protein  24.72 
 
 
447 aa  105  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2173  outer membrane efflux protein  23.33 
 
 
448 aa  105  2e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0042  outer membrane efflux protein  22.22 
 
 
454 aa  105  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2807  outer membrane efflux protein/ immunoreative antigen  21.04 
 
 
441 aa  104  3e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2362  outer membrane efflux protein  25.43 
 
 
446 aa  104  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.451057 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3409  outer membrane efflux protein  28.04 
 
 
419 aa  103  8e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000155286  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1177  outer membrane efflux protein  22.79 
 
 
427 aa  102  1e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0762  outer membrane efflux protein  24.94 
 
 
446 aa  100  4e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1482  outer membrane efflux protein  23.47 
 
 
471 aa  101  4e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.387043 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4447  outer membrane efflux protein  26.13 
 
 
459 aa  100  8e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3710  outer membrane efflux protein  24.87 
 
 
419 aa  99  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2441  outer membrane efflux protein  24.47 
 
 
453 aa  97.8  4e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  23.64 
 
 
441 aa  96.7  9e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0961  Outer membrane protein-like  24.15 
 
 
491 aa  95.9  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0234127  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3801  outer membrane efflux protein  25 
 
 
449 aa  95.9  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.233057 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3717  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.65 
 
 
477 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2647  outer membrane efflux protein  22.6 
 
 
445 aa  95.5  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.910769  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1727  type I secretion outer membrane protein, TolC family  28.57 
 
 
452 aa  94  5e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000826676  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  28.05 
 
 
419 aa  93.2  9e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1990  outer membrane efflux protein  22.53 
 
 
471 aa  93.2  9e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.154832  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4306  outer membrane efflux protein  27.45 
 
 
447 aa  93.2  9e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0096  outer membrane efflux protein  23.01 
 
 
441 aa  92.8  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3633  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.81 
 
 
476 aa  92  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4472  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  26.81 
 
 
476 aa  92  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.621832  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3894  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.81 
 
 
476 aa  92  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4284  outer membrane efflux protein  27.08 
 
 
447 aa  91.3  4e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2367  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  27.13 
 
 
474 aa  90.9  5e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1577  outer membrane efflux protein, OprM  24.52 
 
 
606 aa  89.7  1e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000543553  normal  0.404493 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1015  outer membrane protein  22.31 
 
 
488 aa  89.7  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.22355e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1759  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  24.7 
 
 
600 aa  89.4  1e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000901075  normal  0.0327712 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2298  outer membrane efflux protein  23.64 
 
 
525 aa  89.4  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1851  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  27.44 
 
 
474 aa  89  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.170655 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4492  outer membrane efflux protein  22.91 
 
 
455 aa  87.8  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.685781 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2001  LipD protein, putative  23.85 
 
 
445 aa  87.8  4e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.538795  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0311  outer membrane CHANEL lipoprotein  29.17 
 
 
476 aa  86.7  8e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.564157  normal  0.11877 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4358  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.69 
 
 
482 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1165  Outer membrane efflux protein  27.31 
 
 
462 aa  85.5  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6823  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.62 
 
 
480 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.248499 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2724  outer membrane efflux protein  23.88 
 
 
440 aa  85.9  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.190068  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1606  outer membrane efflux protein  27.59 
 
 
421 aa  85.1  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2633  outer membrane efflux protein  27.86 
 
 
424 aa  85.1  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0063  outer membrane efflux protein  19.07 
 
 
408 aa  84  0.000000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0180654  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2629  outer membrane efflux protein  24.66 
 
 
421 aa  83.6  0.000000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111539  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3096  outer membrane efflux protein  24.83 
 
 
497 aa  83.6  0.000000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3165  outer membrane efflux protein  26.8 
 
 
445 aa  82.8  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.391786  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1665  outer membrane efflux protein  23.25 
 
 
464 aa  82.8  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2606  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  25.06 
 
 
478 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0037798  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0278  outer membrane efflux protein  22.61 
 
 
441 aa  81.6  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000626538  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1333  outer membrane efflux protein, putative  23.43 
 
 
463 aa  81.6  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1951  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.12 
 
 
480 aa  82.4  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2662  outer membrane efflux protein  20 
 
 
445 aa  82  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1482  outer membrane efflux protein  24.23 
 
 
426 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.979092  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1278  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  24.71 
 
 
486 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00202436  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3627  outer membrane efflux protein  25.78 
 
 
461 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.433273  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4153  outer membrane efflux protein  25.94 
 
 
447 aa  81.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0283  outer membrane efflux protein  25.26 
 
 
439 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1723  outer membrane efflux protein  23.95 
 
 
436 aa  81.3  0.00000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3628  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.7 
 
 
479 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.93917  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3644  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.37 
 
 
471 aa  80.9  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2899  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.33 
 
 
504 aa  80.5  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4009  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  24.92 
 
 
486 aa  80.5  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0874069  normal  0.0174443 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1721  TolC family type I secretion outer membrane protein  29.07 
 
 
482 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.456925  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1266  outer membrane efflux protein  22.05 
 
 
444 aa  80.5  0.00000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0549  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  26.2 
 
 
501 aa  80.5  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.569542  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3155  TolC family type I secretion outer membrane protein  29.07 
 
 
482 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.267117  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2822  TolC family type I secretion outer membrane protein  29.07 
 
 
479 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.390937  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2027  outer membrane efflux protein  23.31 
 
 
495 aa  80.1  0.00000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000179084 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0046  TolC family type I secretion outer membrane protein  29.07 
 
 
471 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2950  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.05 
 
 
479 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3620  TolC family type I secretion outer membrane protein  29.07 
 
 
482 aa  80.5  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3057  outer membrane efflux protein  26.58 
 
 
440 aa  80.1  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.969203  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0545  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  26.52 
 
 
470 aa  80.1  0.00000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>