More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3096 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_3096  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 497 aa  1003    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4182  outer membrane efflux protein  27.4 
 
 		 431 aa  102  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5561  outer membrane efflux protein  29.52 
 
 		 431 aa  101  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1884  outer membrane efflux protein  24.54 
 
 		 483 aa  98.2  3e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0364  outer membrane channel protein  24.88 
 
 		 500 aa  94  5e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2441  outer membrane efflux protein  24.56 
 
 		 453 aa  93.6  6e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1177  outer membrane efflux protein  25.32 
 
 		 427 aa  93.6  7e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0961  Outer membrane protein-like  24.15 
 
 		 491 aa  92  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0234127  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4505  outer membrane efflux protein  26.27 
 
 		 972 aa  90.1  8e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.300614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0954  outer membrane efflux protein  24.19 
 
 		 463 aa  88.6  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1761  hypothetical protein  25.89 
 
 		 576 aa  88.2  3e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3801  outer membrane efflux protein  24.11 
 
 		 449 aa  87  7e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233057 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0733  outer membrane efflux protein, putative  24.83 
 
 		 463 aa  87  7e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1617  outer membrane efflux protein  22.12 
 
 		 467 aa  85.5  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0837  outer membrane efflux protein  24.35 
 
 		 462 aa  85.5  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1376  Outer membrane efflux protein  27.27 
 
 		 435 aa  84  0.000000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.109779  hitchhiker  0.00244241 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1990  outer membrane efflux protein  24.37 
 
 		 471 aa  84  0.000000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.154832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3626  outer membrane efflux protein  25.48 
 
 		 627 aa  83.6  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0887926  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1727  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.32 
 
 		 452 aa  83.2  0.000000000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000826676  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2799  outer membrane efflux protein  23.59 
 
 		 435 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000194078  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1380  outer membrane efflux protein  21.14 
 
 		 425 aa  83.2  0.00000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1967  outer membrane efflux protein  24.76 
 
 		 443 aa  82.8  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000399706  normal  0.35271 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  25.82 
 
 		 419 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2883  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.06 
 
 		 442 aa  82  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00170075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4162  outer membrane efflux protein  22.72 
 
 		 443 aa  80.9  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000533026  normal  0.288124 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0627  outer membrane efflux protein, putative  21.18 
 
 		 470 aa  80.1  0.00000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.173588  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0162  outer membrane efflux protein  23.82 
 
 		 433 aa  80.1  0.00000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1633  outer membrane efflux protein  25.08 
 
 		 420 aa  79.3  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.159543  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3710  outer membrane efflux protein  23.13 
 
 		 419 aa  78.6  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02621  outer membrane protein required for AvrXa21 activity C (raxC)  24.75 
 
 		 443 aa  79  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3343  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.07 
 
 		 452 aa  78.6  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1698  outer membrane efflux protein  25.72 
 
 		 433 aa  78.2  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.572085  normal  0.0641673 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2629  outer membrane efflux protein  25.27 
 
 		 421 aa  77.8  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111539  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0611  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.58 
 
 		 464 aa  77.8  0.0000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0802  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.17 
 
 		 453 aa  77.8  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1015  Outer membrane efflux protein  24.24 
 
 		 731 aa  77.4  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0127212 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0283  outer membrane efflux protein  23.56 
 
 		 439 aa  77.4  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0610  outer membrane efflux protein  24.91 
 
 		 453 aa  77  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2367  outer membrane efflux protein  24.53 
 
 		 495 aa  77.4  0.0000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1165  Outer membrane efflux protein  26.35 
 
 		 462 aa  77  0.0000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2069  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.93 
 
 		 452 aa  77  0.0000000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2866  outer membrane efflux protein  22.73 
 
 		 480 aa  76.6  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0685652 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3496  outer membrane efflux protein  27.34 
 
 		 565 aa  76.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3706  outer membrane efflux protein  22.42 
 
 		 447 aa  75.9  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3409  outer membrane efflux protein  23.1 
 
 		 419 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000155286  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0066  outer membrane efflux protein  22.01 
 
 		 443 aa  75.9  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1606  outer membrane efflux protein  25.62 
 
 		 421 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0066  outer membrane efflux protein  21.79 
 
 		 436 aa  75.5  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0096  outer membrane efflux protein  22.71 
 
 		 441 aa  75.5  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2544  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  24.24 
 
 		 467 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.109213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0120  outer membrane efflux protein  26.69 
 
 		 448 aa  75.1  0.000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000165447  hitchhiker  0.000000000000561163 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5078  outer membrane efflux protein  23.18 
 
 		 635 aa  73.9  0.000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.851054  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0833  outer membrane efflux protein  23.61 
 
 		 496 aa  73.6  0.000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003047  type I secretion TolC precursor  22.47 
 
 		 423 aa  73.6  0.000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1217  outer membrane efflux protein  24.85 
 
 		 438 aa  73.6  0.000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.87899  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2156  outer membrane export factor  23.24 
 
 		 452 aa  73.6  0.000000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2173  outer membrane efflux protein  22.68 
 
 		 448 aa  73.2  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0515  outer membrane efflux protein  26.11 
 
 		 578 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1941  outer membrane efflux protein  22.33 
 
 		 432 aa  72.8  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0532  outer membrane efflux protein  26.11 
 
 		 578 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.52231  normal  0.0114882 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0849  outer membrane efflux protein  18.6 
 
 		 417 aa  72.4  0.00000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000450472  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  25.33 
 
 		 441 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0749  outer membrane efflux protein  22.81 
 
 		 490 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2562  outer membrane efflux protein  25.53 
 
 		 500 aa  72.4  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0520371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3625  outer membrane efflux protein  26.21 
 
 		 525 aa  71.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.262442  normal  0.276667 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2298  outer membrane efflux protein  26.36 
 
 		 525 aa  71.6  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0549  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  25.97 
 
 		 501 aa  71.2  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.569542  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1650  Outer membrane efflux protein  24.07 
 
 		 499 aa  70.9  0.00000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0374464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0498  type I secretion outer membrane protein, TolC family  22.46 
 
 		 494 aa  70.9  0.00000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2365  outer membrane efflux protein  28.11 
 
 		 482 aa  70.9  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.316372 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0366  putative secretion protein  22.09 
 
 		 454 aa  70.5  0.00000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.676066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0545  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  26.49 
 
 		 470 aa  70.5  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1723  outer membrane efflux protein  23.59 
 
 		 436 aa  70.5  0.00000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1338  type I secretion outer membrane protein, TolC family  21.95 
 
 		 456 aa  70.5  0.00000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0728783  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1266  outer membrane efflux protein  20.43 
 
 		 444 aa  70.1  0.00000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3627  outer membrane efflux protein  22.82 
 
 		 461 aa  70.1  0.00000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.433273  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2704  outer membrane efflux protein  25.69 
 
 		 423 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3429  outer membrane efflux protein  25.12 
 
 		 442 aa  69.7  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.437271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0042  outer membrane efflux protein  22.82 
 
 		 454 aa  69.7  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28780  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  26.14 
 
 		 512 aa  69.7  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.506262  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1482  outer membrane efflux protein  24.11 
 
 		 426 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.979092  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1384  outer membrane efflux protein  21.79 
 
 		 435 aa  68.9  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.642492  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2180  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.9 
 
 		 874 aa  68.9  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000461522  normal  0.954774 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0814  outer membrane efflux protein  24.25 
 
 		 460 aa  68.2  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0499  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.6 
 
 		 546 aa  68.6  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.16116  normal  0.32958 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1878  type I secretion outer membrane protein, TolC family  21.19 
 
 		 475 aa  68.2  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.660542  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3165  outer membrane efflux protein  25.46 
 
 		 445 aa  68.2  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.391786  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0516  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  26.16 
 
 		 500 aa  67.8  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0482869  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0366  outer membrane efflux protein  23.17 
 
 		 437 aa  67.4  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1359  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  24.61 
 
 		 462 aa  67.4  0.0000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2035  RND efflux system outer membrane lipoprotein  29.71 
 
 		 486 aa  67  0.0000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.152355  normal  0.152355 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0814  outer membrane protein  25.25 
 
 		 479 aa  67  0.0000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0391  Outer membrane efflux family protein  24.84 
 
 		 437 aa  66.6  0.0000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0543  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.76 
 
 		 479 aa  66.6  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.991736 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4230  outer membrane efflux protein  23.57 
 
 		 458 aa  66.2  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0431504  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1994  outer membrane efflux protein  27.21 
 
 		 495 aa  66.2  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.184092  normal  0.0261874 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1749  outer membrane efflux protein  24.73 
 
 		 458 aa  66.2  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0762  outer membrane efflux protein  22.09 
 
 		 446 aa  66.6  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2969  outer membrane efflux protein  25.08 
 
 		 443 aa  65.5  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.725894  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2893  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.69 
 
 		 516 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>