More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2941 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2941  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 436 aa  875    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0140963  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2659  outer membrane efflux protein  48.26 
 
 		 436 aa  421  1e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3737  outer membrane efflux protein  43.56 
 
 		 437 aa  366  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.315415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0903  outer membrane efflux protein  35.41 
 
 		 436 aa  264  2e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.331424  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3233  outer membrane efflux protein  34.05 
 
 		 462 aa  230  4e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.367218  normal  0.578966 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0366  outer membrane efflux protein  31.43 
 
 		 437 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5135  outer membrane efflux protein  31.08 
 
 		 448 aa  189  9e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01590  putative outer membrane protein TolC  31.18 
 
 		 451 aa  177  4e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.29548  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1634  outer membrane efflux protein  29.07 
 
 		 431 aa  176  9e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.194063  normal  0.997182 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0814  outer membrane efflux protein  28.5 
 
 		 455 aa  169  1e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.881482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0710  Outer membrane protein-like  25.8 
 
 		 445 aa  125  1e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.00000000572058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0364  outer membrane channel protein  23.64 
 
 		 500 aa  89.7  9e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1727  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.54 
 
 		 452 aa  86.7  7e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000826676  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0384  outer membrane efflux protein  23.57 
 
 		 444 aa  83.6  0.000000000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.895564  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0945  secretion protein  23.42 
 
 		 472 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2692  outer membrane efflux protein  25.93 
 
 		 442 aa  79.7  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922433  normal  0.254416 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4153  outer membrane efflux protein  23.13 
 
 		 447 aa  77.8  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1177  outer membrane efflux protein  23.15 
 
 		 427 aa  77  0.0000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10330  putative outer membrane protein precursor  22.63 
 
 		 471 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.339948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  21.46 
 
 		 1470 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4284  outer membrane efflux protein  22.33 
 
 		 447 aa  74.3  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1746  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.67 
 
 		 446 aa  73.2  0.000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4306  outer membrane efflux protein  22.09 
 
 		 447 aa  70.9  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1667  outer membrane efflux protein  21.85 
 
 		 455 aa  69.7  0.00000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  20.69 
 
 		 1496 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0627  outer membrane efflux protein, putative  22.06 
 
 		 470 aa  68.2  0.0000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.173588  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5078  outer membrane efflux protein  22.61 
 
 		 635 aa  67.8  0.0000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.851054  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1665  outer membrane efflux protein  23.06 
 
 		 464 aa  67  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1617  outer membrane efflux protein  21.18 
 
 		 467 aa  67  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0662  outer membrane efflux protein  26.1 
 
 		 483 aa  67  0.0000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2148  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.54 
 
 		 497 aa  67  0.0000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.400858  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1482  outer membrane efflux protein  23.04 
 
 		 471 aa  66.2  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.387043 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1941  outer membrane efflux protein  21.51 
 
 		 432 aa  65.5  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0753  outer membrane channel protein  23.18 
 
 		 435 aa  65.1  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000555232  normal  0.0190145 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2594  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.08 
 
 		 477 aa  65.5  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000572805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3124  outer membrane efflux protein  18.71 
 
 		 448 aa  65.1  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0120  outer membrane efflux protein  22.84 
 
 		 448 aa  64.3  0.000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000165447  hitchhiker  0.000000000000561163 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0768  outer membrane channel protein  23.3 
 
 		 435 aa  64.3  0.000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000309945  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1266  outer membrane efflux protein  22.94 
 
 		 444 aa  63.9  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0733  outer membrane efflux protein, putative  21.32 
 
 		 463 aa  63.9  0.000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0366  putative secretion protein  23.02 
 
 		 454 aa  63.9  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.676066  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3904  outer membrane channel protein  23.82 
 
 		 435 aa  63.9  0.000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0986  outer membrane efflux protein, putative  22.83 
 
 		 484 aa  63.5  0.000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1826  Type I secretion outer membrane protein, TolC  20.8 
 
 		 487 aa  63.5  0.000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1633  outer membrane efflux protein  20.95 
 
 		 470 aa  63.2  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.788464  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2604  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.68 
 
 		 442 aa  63.2  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0774  outer membrane channel protein  24.68 
 
 		 441 aa  63.2  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000983275  unclonable  0.000000000104798 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3236  outer membrane channel protein  22.92 
 
 		 435 aa  63.2  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000456355  hitchhiker  0.0000511139 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0725  outer membrane channel protein  22.92 
 
 		 435 aa  63.2  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000245313  hitchhiker  0.000963429 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2367  outer membrane efflux protein  22.19 
 
 		 495 aa  62  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4294  outer membrane efflux protein  20.24 
 
 		 448 aa  62.4  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0190007  normal  0.396606 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1671  outer membrane efflux protein  22.41 
 
 		 461 aa  62  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2441  outer membrane efflux protein  23.05 
 
 		 453 aa  61.6  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0610  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.34 
 
 		 480 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3644  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.29 
 
 		 471 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1967  outer membrane efflux protein  22.85 
 
 		 443 aa  61.2  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000399706  normal  0.35271 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1376  Outer membrane efflux protein  21.08 
 
 		 435 aa  60.8  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.109779  hitchhiker  0.00244241 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1143  outer membrane efflux protein  23.46 
 
 		 455 aa  61.2  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0286987  normal  0.128527 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0066  outer membrane efflux protein  21.58 
 
 		 436 aa  60.5  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2352  TolC family type I secretion outer membrane protein  25 
 
 		 446 aa  60.5  0.00000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3332  outer membrane channel protein  23.28 
 
 		 431 aa  60.5  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0563453  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0046  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.29 
 
 		 471 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2822  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.29 
 
 		 479 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.390937  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0498  type I secretion outer membrane protein, TolC family  22.06 
 
 		 494 aa  60.1  0.00000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1721  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.29 
 
 		 482 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.456925  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3343  type I secretion outer membrane protein, TolC family  21.63 
 
 		 452 aa  60.1  0.00000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3155  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.29 
 
 		 482 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.267117  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3620  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.29 
 
 		 482 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4181  outer membrane channel protein  23.5 
 
 		 449 aa  59.7  0.00000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3628  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.29 
 
 		 479 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.93917  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1761  hypothetical protein  25.22 
 
 		 576 aa  60.1  0.00000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1482  outer membrane efflux protein  20.68 
 
 		 426 aa  59.3  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.979092  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1475  outer membrane efflux protein  23.68 
 
 		 449 aa  59.3  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.236212  normal  0.298581 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0543  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.05 
 
 		 479 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.991736 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0162  outer membrane efflux protein  22.68 
 
 		 433 aa  59.3  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3225  outer membrane channel protein  23.68 
 
 		 432 aa  59.3  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000929322  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0954  outer membrane efflux protein  21.2 
 
 		 463 aa  58.9  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004522  type I secretion TolC precursor  23.05 
 
 		 442 aa  58.9  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000301167  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2647  outer membrane efflux protein  22.66 
 
 		 445 aa  58.9  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.910769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0042  outer membrane efflux protein  24.17 
 
 		 454 aa  58.9  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2435  outer membrane efflux protein  20.74 
 
 		 438 aa  58.9  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3126  outer membrane efflux protein  22.43 
 
 		 444 aa  58.2  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4977  outer membrane efflux protein TolC, putative  24.05 
 
 		 479 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2362  outer membrane efflux protein  23.23 
 
 		 446 aa  57.8  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.451057 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03690  outer membrane channel precursor protein  21.6 
 
 		 462 aa  58.2  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000344286  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2950  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.29 
 
 		 479 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01115  putative outer membrane transport/efflux protein  22.22 
 
 		 443 aa  58.2  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0806  outer membrane channel protein  22.63 
 
 		 435 aa  58.2  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000113836  hitchhiker  0.0000000000882186 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0781  outer membrane channel protein  22.63 
 
 		 435 aa  57.8  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000184345  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3578  outer membrane channel protein  22.63 
 
 		 435 aa  57.8  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000408694  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0063  outer membrane efflux protein  21.9 
 
 		 408 aa  57.8  0.0000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0180654  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0813  outer membrane channel protein  22.63 
 
 		 435 aa  57.8  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000621601  normal  0.257824 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5506  outer membrane efflux protein  23.36 
 
 		 451 aa  57.4  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.307266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1600  outer membrane efflux protein  22.22 
 
 		 499 aa  57.4  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.174043  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0544  outer membrane channel protein  25.13 
 
 		 448 aa  57.4  0.0000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000576987  normal  0.601769 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1531  outer membrane efflux protein  23.68 
 
 		 472 aa  57.4  0.0000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0744  Type I secretion outer membrane protein, TolC  21.65 
 
 		 449 aa  56.6  0.0000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.291612  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1217  outer membrane efflux protein  21.88 
 
 		 438 aa  56.6  0.0000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.87899  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1773  outer membrane efflux protein  27.84 
 
 		 435 aa  56.2  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0791  outer membrane efflux protein  23.76 
 
 		 454 aa  56.2  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.670065  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>