168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0710 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_0710  Outer membrane protein-like  100 
 
 		 445 aa  893    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.00000000572058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0814  outer membrane efflux protein  47.8 
 
 		 455 aa  354  2e-96  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.881482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1634  outer membrane efflux protein  45.54 
 
 		 431 aa  341  1e-92  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.194063  normal  0.997182 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01590  putative outer membrane protein TolC  31.34 
 
 		 451 aa  174  1.9999999999999998e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.29548  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3233  outer membrane efflux protein  29.31 
 
 		 462 aa  148  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.367218  normal  0.578966 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2659  outer membrane efflux protein  27.92 
 
 		 436 aa  144  3e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3737  outer membrane efflux protein  26.71 
 
 		 437 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.315415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2941  outer membrane efflux protein  26.19 
 
 		 436 aa  130  6e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0140963  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0903  outer membrane efflux protein  26.67 
 
 		 436 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.331424  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0366  outer membrane efflux protein  23.98 
 
 		 437 aa  110  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1177  outer membrane efflux protein  23.73 
 
 		 427 aa  87  6e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5135  outer membrane efflux protein  22.49 
 
 		 448 aa  79.7  0.00000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1482  outer membrane efflux protein  23.63 
 
 		 471 aa  74.7  0.000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.387043 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  26.54 
 
 		 1470 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1333  outer membrane efflux protein, putative  23.52 
 
 		 463 aa  68.9  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1617  outer membrane efflux protein  24.47 
 
 		 467 aa  67.8  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0364  outer membrane channel protein  23.44 
 
 		 500 aa  65.5  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2241  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.84 
 
 		 524 aa  65.1  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.417493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1941  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.04 
 
 		 497 aa  65.9  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.211357  normal  0.0401761 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2175  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  22.55 
 
 		 482 aa  64.3  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.388686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2704  outer membrane efflux protein  25.47 
 
 		 423 aa  63.9  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1562  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.71 
 
 		 478 aa  63.9  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1228  agglutination protein  21.58 
 
 		 445 aa  62  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000902456  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0881  outer membrane efflux protein  25.29 
 
 		 535 aa  62  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.705042  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2035  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.58 
 
 		 486 aa  61.6  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.152355  normal  0.152355 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10058  putative outer membrane lipoprotein  24.82 
 
 		 468 aa  60.1  0.00000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.328354  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1282  outer membrane efflux protein  25.61 
 
 		 446 aa  59.3  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0406152  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03690  outer membrane channel precursor protein  21.96 
 
 		 462 aa  59.7  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000344286  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1665  outer membrane efflux protein  21.69 
 
 		 464 aa  59.7  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0679  outer membrane efflux protein  25.23 
 
 		 444 aa  58.9  0.0000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0368289 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2209  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  24.11 
 
 		 472 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4294  outer membrane efflux protein  24.88 
 
 		 448 aa  59.3  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0190007  normal  0.396606 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1633  outer membrane efflux protein  22.86 
 
 		 470 aa  58.2  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.788464  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3801  outer membrane efflux protein  26.8 
 
 		 449 aa  57.4  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233057 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4284  outer membrane efflux protein  24 
 
 		 447 aa  57.4  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  25.11 
 
 		 1496 aa  56.6  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0066  outer membrane efflux protein  24.06 
 
 		 436 aa  56.2  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1633  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25.23 
 
 		 519 aa  56.2  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.181955  normal  0.716054 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0162  outer membrane efflux protein  25.78 
 
 		 433 aa  55.8  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0954  outer membrane efflux protein  23.45 
 
 		 463 aa  56.2  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3256  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  25.06 
 
 		 525 aa  56.2  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.865648 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4027  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.38 
 
 		 467 aa  56.6  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.296212  normal  0.401422 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1994  outer membrane efflux protein  22.71 
 
 		 495 aa  55.8  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.184092  normal  0.0261874 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4306  outer membrane efflux protein  24.07 
 
 		 447 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0619  copper/silver efflux system outer membrane protein CusC  22.49 
 
 		 457 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000166732  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3074  copper/silver efflux system outer membrane protein CusC  22.49 
 
 		 457 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.127852  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3057  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  22.49 
 
 		 457 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4153  outer membrane efflux protein  25.23 
 
 		 447 aa  54.7  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0653  copper/silver efflux system outer membrane protein CusC  22.49 
 
 		 460 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.191725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6104  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  21.3 
 
 		 468 aa  55.1  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2785  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  23.03 
 
 		 474 aa  54.7  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0347137  normal  0.0590439 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1024  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.11 
 
 		 484 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.484622  normal  0.130102 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4429  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.58 
 
 		 484 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.305214  normal  0.0579633 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00533  copper/silver efflux system, outer membrane component  22.49 
 
 		 457 aa  54.3  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1384  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  23.64 
 
 		 484 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.285433 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1990  outer membrane efflux protein  22.89 
 
 		 471 aa  54.3  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.154832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1845  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.91 
 
 		 471 aa  54.3  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0000390204  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4339  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.64 
 
 		 484 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0952934  normal  0.254961 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00522  hypothetical protein  22.49 
 
 		 457 aa  54.3  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1633  outer membrane efflux protein  24.76 
 
 		 420 aa  54.3  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.159543  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0480  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.12 
 
 		 505 aa  54.3  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0104002 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0814  outer membrane efflux protein  23.86 
 
 		 460 aa  53.9  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0590  copper/silver efflux system outer membrane protein CusC  22.49 
 
 		 460 aa  54.3  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0284493  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2606  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  25.12 
 
 		 478 aa  53.9  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0037798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4009  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  24.53 
 
 		 486 aa  53.9  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0874069  normal  0.0174443 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0590  copper/silver efflux system outer membrane protein CusC  22.27 
 
 		 460 aa  53.5  0.000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.583273  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0945  outer membrane efflux family protein  23.96 
 
 		 456 aa  52.8  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.681331  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0791  outer membrane efflux protein  22.78 
 
 		 454 aa  52.8  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.670065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0633  type I secretion outer membrane protein, TolC family  20.8 
 
 		 484 aa  53.1  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00458641  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1119  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  23.79 
 
 		 473 aa  52  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1376  Outer membrane efflux protein  25.19 
 
 		 435 aa  52.4  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.109779  hitchhiker  0.00244241 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0784  type I secretion outer membrane protein, TolC family  20.32 
 
 		 491 aa  52  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.649029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1665  type I secretion outer membrane protein, TolC family  21.54 
 
 		 472 aa  52.4  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0567  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.63 
 
 		 483 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1884  outer membrane efflux protein  24.29 
 
 		 483 aa  51.2  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2052  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  21.53 
 
 		 499 aa  51.6  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48090  alkaline protease secretion outer membrane protein AprF precursor  24.15 
 
 		 481 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0152412 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0938  outer membrane efflux family protein  23.72 
 
 		 452 aa  50.8  0.00005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2692  outer membrane efflux protein  21.9 
 
 		 442 aa  50.4  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922433  normal  0.254416 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2636  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.58 
 
 		 507 aa  50.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0259  copper/silver efflux system outer membrane protein CusC  19.46 
 
 		 461 aa  50.4  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2148  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.83 
 
 		 497 aa  50.4  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.400858  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4305  outer membrane efflux protein  23.71 
 
 		 486 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3093  outer membrane protein  23.53 
 
 		 503 aa  49.7  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2013  type I secretion outer membrane protein, TolC family  22.95 
 
 		 472 aa  49.7  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.226354  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0291  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  23.36 
 
 		 465 aa  49.7  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.33434  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4297  copper/silver efflux system outer membrane protein CusC  19.46 
 
 		 461 aa  49.3  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00173675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4205  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.71 
 
 		 431 aa  49.3  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.668787  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1723  outer membrane efflux protein  24.43 
 
 		 436 aa  48.5  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0808  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  27.07 
 
 		 476 aa  48.9  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1727  type I secretion outer membrane protein, TolC family  21.5 
 
 		 452 aa  48.9  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000826676  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1145  anibiotic ABC transporter efflux pump  23.96 
 
 		 442 aa  48.9  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0950506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6495  type I secretion outer membrane protein, TolC family  22.01 
 
 		 518 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0887  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.75 
 
 		 586 aa  48.9  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000421492  hitchhiker  0.0000263613 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3490  RND efflux system outer membrane lipoprotein  22.79 
 
 		 503 aa  48.9  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.350691 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2243  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.41 
 
 		 455 aa  48.5  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4235  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.3 
 
 		 463 aa  48.9  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.902691  normal  0.529157 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3777  outer membrane channel protein  21.59 
 
 		 470 aa  48.9  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1278  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  23.99 
 
 		 486 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00202436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2607  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.34 
 
 		 507 aa  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>