133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1600 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_1600  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 499 aa  1000    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.174043  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1609  outer membrane efflux protein  53.96 
 
 		 499 aa  508  9.999999999999999e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.184768  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2020  outer membrane efflux protein  52.54 
 
 		 491 aa  500  1e-140  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0936605  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1650  Outer membrane efflux protein  54.05 
 
 		 499 aa  485  1e-136  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0374464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1126  outer membrane efflux protein  49.01 
 
 		 514 aa  483  1e-135  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2027  outer membrane efflux protein  48.85 
 
 		 495 aa  448  1.0000000000000001e-124  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000179084 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2200  outer membrane efflux protein  47.45 
 
 		 495 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0533  outer membrane efflux protein  35.63 
 
 		 762 aa  276  5e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2126  hypothetical protein  34.46 
 
 		 508 aa  258  2e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1190  Outer membrane efflux protein  33.12 
 
 		 510 aa  231  3e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2562  outer membrane efflux protein  26.74 
 
 		 500 aa  147  4.0000000000000006e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0520371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5198  outer efflux pump domain-containing protein  28.33 
 
 		 522 aa  127  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0545953 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0749  outer membrane efflux protein  25.83 
 
 		 490 aa  125  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0615  Outer membrane protein-like  23.91 
 
 		 577 aa  120  6e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00243369  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0651  outer membrane efflux protein  27.8 
 
 		 524 aa  118  3e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.703393  normal  0.0209094 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3733  outer membrane efflux protein  25.54 
 
 		 488 aa  109  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0025  outer membrane efflux protein  24.63 
 
 		 486 aa  108  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.245374  normal  0.08145 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3981  outer membrane efflux protein  25.64 
 
 		 493 aa  108  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2551  outer membrane efflux protein  24.09 
 
 		 647 aa  106  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1875  outer membrane efflux protein  26.15 
 
 		 506 aa  105  3e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1445  outer membrane efflux protein  22.52 
 
 		 690 aa  104  4e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.757577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1351  outer membrane efflux protein  25.26 
 
 		 528 aa  103  5e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.225814  normal  0.0380363 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0373  outer membrane efflux protein  24.8 
 
 		 662 aa  97.4  5e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.540248 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1733  outer membrane efflux protein  25.93 
 
 		 559 aa  97.4  5e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6409  outer membrane efflux protein  23.99 
 
 		 537 aa  94  6e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2221  outer membrane efflux protein  28.12 
 
 		 590 aa  89  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000846233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5232  hypothetical protein  22.99 
 
 		 493 aa  87.4  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2201  outer membrane efflux protein  22.9 
 
 		 587 aa  86.7  9e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.854853  normal  0.28263 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0894  outer membrane efflux protein  23.91 
 
 		 487 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60770  putative outer membrane protein  22.53 
 
 		 493 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0066  outer membrane efflux protein  24.87 
 
 		 436 aa  76.6  0.0000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3801  outer membrane efflux protein  26.75 
 
 		 449 aa  75.9  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233057 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4093  outer membrane efflux protein  24.79 
 
 		 514 aa  72  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.66979 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2471  outer membrane efflux protein  24.48 
 
 		 481 aa  70.5  0.00000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2805  outer membrane efflux protein  22.38 
 
 		 685 aa  69.7  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.977623  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0881  outer membrane efflux protein  27.06 
 
 		 535 aa  68.9  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.705042  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2365  outer membrane efflux protein  26.49 
 
 		 482 aa  68.2  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.316372 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4447  outer membrane efflux protein  26.44 
 
 		 459 aa  67.4  0.0000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  25.45 
 
 		 1496 aa  67  0.0000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  27.13 
 
 		 441 aa  65.9  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3627  outer membrane efflux protein  23.75 
 
 		 461 aa  65.9  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.433273  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2441  outer membrane efflux protein  24.35 
 
 		 453 aa  65.5  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4505  outer membrane efflux protein  22.57 
 
 		 972 aa  62.8  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.300614  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0090  hypothetical protein  23.53 
 
 		 731 aa  62.8  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0057  outer membrane protein, putative  25.36 
 
 		 470 aa  62  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0872  Outer membrane protein-like  23.37 
 
 		 517 aa  61.2  0.00000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0283  outer membrane efflux protein  26.82 
 
 		 439 aa  60.5  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01121  RND family outer membrane efflux protein  22.59 
 
 		 475 aa  60.1  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0101  RND family outer membrane efflux protein-like  22.68 
 
 		 477 aa  59.7  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.87226  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3626  outer membrane efflux protein  25.5 
 
 		 627 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0887926  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3093  outer membrane protein  24.07 
 
 		 503 aa  59.3  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1761  hypothetical protein  25.33 
 
 		 576 aa  57.8  0.0000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0162  outer membrane efflux protein  24.12 
 
 		 433 aa  57.8  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01091  RND family outer membrane efflux protein  22.41 
 
 		 476 aa  57.8  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2992  hypothetical protein  21.94 
 
 		 542 aa  56.6  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2852  hypothetical protein  21.94 
 
 		 542 aa  56.6  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2517  Outer membrane efflux protein  26.21 
 
 		 455 aa  56.2  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0940003  normal  0.677218 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05030  outer membrane efflux protein  23.78 
 
 		 471 aa  55.8  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.691581  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2173  outer membrane efflux protein  22.54 
 
 		 448 aa  54.7  0.000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01131  RND family outer membrane efflux protein  21.59 
 
 		 475 aa  54.7  0.000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.245379  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1266  outer membrane efflux protein  23.89 
 
 		 444 aa  54.3  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1177  outer membrane efflux protein  22.35 
 
 		 427 aa  54.3  0.000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03082  hypothetical protein  23.95 
 
 		 492 aa  53.9  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.208658  normal  0.984334 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0391  Outer membrane efflux family protein  24.73 
 
 		 437 aa  53.9  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2899  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.01 
 
 		 504 aa  53.5  0.000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02231  RND family outer membrane efflux protein  23.7 
 
 		 577 aa  53.5  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0791  outer membrane efflux protein  24.1 
 
 		 454 aa  53.5  0.000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.670065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4486  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  25.21 
 
 		 512 aa  52.8  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2941  outer membrane efflux protein  23.03 
 
 		 436 aa  53.1  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0140963  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3706  outer membrane efflux protein  24.87 
 
 		 447 aa  53.1  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0837  outer membrane efflux protein  26.58 
 
 		 462 aa  53.1  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  23.22 
 
 		 1470 aa  52.8  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3625  outer membrane efflux protein  22.51 
 
 		 525 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.262442  normal  0.276667 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0040  type I secretion outer membrane protein  19.7 
 
 		 507 aa  52.4  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.99479  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2010  outer membrane efflux family protein  19.87 
 
 		 509 aa  52.4  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2692  outer membrane efflux protein  23.85 
 
 		 442 aa  51.6  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922433  normal  0.254416 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0291  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  24.83 
 
 		 465 aa  51.6  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.33434  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0094  outer membrane efflux protein, putative  24.34 
 
 		 501 aa  51.2  0.00004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0379352 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1338  type I secretion outer membrane protein, TolC family  22.37 
 
 		 456 aa  51.2  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0728783  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0610  outer membrane efflux protein  21.5 
 
 		 453 aa  50.8  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0397  outer membrane efflux protein  25.87 
 
 		 473 aa  50.8  0.00006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1170  putative outer membrane protein TolC  22.19 
 
 		 419 aa  50.8  0.00006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.109696  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0814  outer membrane efflux protein  24.76 
 
 		 460 aa  50.4  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1475  outer membrane efflux protein  22.13 
 
 		 449 aa  50.4  0.00008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.236212  normal  0.298581 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5078  outer membrane efflux protein  25.84 
 
 		 635 aa  50.4  0.00008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.851054  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1941  outer membrane efflux protein  23.05 
 
 		 432 aa  50.4  0.00008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5506  outer membrane efflux protein  21.28 
 
 		 451 aa  50.1  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.307266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0954  outer membrane efflux protein  24.11 
 
 		 463 aa  49.3  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0733  outer membrane efflux protein, putative  21.44 
 
 		 463 aa  49.3  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0096  outer membrane efflux protein  23.26 
 
 		 441 aa  48.9  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1671  outer membrane efflux protein  20.04 
 
 		 461 aa  49.3  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1397  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  24.92 
 
 		 483 aa  48.9  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0470639  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0427  outer membrane efflux protein  24.87 
 
 		 455 aa  48.5  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.410338  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1203  outer membrane efflux protein  23.22 
 
 		 497 aa  47.8  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1482  outer membrane efflux protein  24.38 
 
 		 471 aa  48.1  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.387043 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1884  outer membrane efflux protein  22.76 
 
 		 483 aa  47.8  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0828  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  30.74 
 
 		 428 aa  47.4  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.885444  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0863  outer membrane efflux protein  22.19 
 
 		 476 aa  47.4  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0409869  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1015  Outer membrane efflux protein  23.83 
 
 		 731 aa  47.4  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0127212 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3096  outer membrane efflux protein  24.51 
 
 		 497 aa  47  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>