More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4447 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_4447  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 459 aa  915    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3801  outer membrane efflux protein  55.69 
 
 		 449 aa  410  1e-113  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233057 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  32.44 
 
 		 1496 aa  146  8.000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  29.84 
 
 		 1470 aa  127  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0814  outer membrane efflux protein  28.88 
 
 		 460 aa  124  4e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0954  outer membrane efflux protein  26.33 
 
 		 463 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2517  Outer membrane efflux protein  28.77 
 
 		 455 aa  113  6e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0940003  normal  0.677218 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2441  outer membrane efflux protein  29.26 
 
 		 453 aa  113  9e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1617  outer membrane efflux protein  26.11 
 
 		 467 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0627  outer membrane efflux protein, putative  27.7 
 
 		 470 aa  110  6e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.173588  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0162  outer membrane efflux protein  26.14 
 
 		 433 aa  109  9.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0733  outer membrane efflux protein, putative  26.94 
 
 		 463 aa  109  1e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1884  outer membrane efflux protein  26.69 
 
 		 483 aa  107  4e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3627  outer membrane efflux protein  29.36 
 
 		 461 aa  103  6e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.433273  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2799  outer membrane efflux protein  25.5 
 
 		 435 aa  102  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000194078  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0833  outer membrane efflux protein  26.53 
 
 		 496 aa  100  4e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0837  outer membrane efflux protein  28.98 
 
 		 462 aa  98.6  2e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0066  outer membrane efflux protein  26.91 
 
 		 443 aa  93.2  8e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0961  Outer membrane protein-like  25 
 
 		 491 aa  93.2  9e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0234127  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1177  outer membrane efflux protein  23.11 
 
 		 427 aa  92.8  1e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0120  outer membrane efflux protein  22.43 
 
 		 448 aa  90.1  7e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000165447  hitchhiker  0.000000000000561163 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3157  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  26.73 
 
 		 480 aa  90.1  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1994  outer membrane efflux protein  25.89 
 
 		 495 aa  89.7  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.184092  normal  0.0261874 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1384  outer membrane efflux protein  25.06 
 
 		 435 aa  88.2  3e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.642492  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05030  outer membrane efflux protein  23.33 
 
 		 471 aa  88.2  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.691581  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2035  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.63 
 
 		 486 aa  87.4  4e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.152355  normal  0.152355 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1941  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.88 
 
 		 497 aa  86.7  7e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.211357  normal  0.0401761 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0762  outer membrane efflux protein  25 
 
 		 446 aa  85.5  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0283  outer membrane efflux protein  26.38 
 
 		 439 aa  83.6  0.000000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1165  Outer membrane efflux protein  29.3 
 
 		 462 aa  82.8  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2173  outer membrane efflux protein  25.11 
 
 		 448 aa  83.2  0.00000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1633  outer membrane efflux protein  25.71 
 
 		 420 aa  82  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.159543  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1174  outer membrane efflux protein  28 
 
 		 457 aa  82.4  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.89041 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1761  hypothetical protein  26.84 
 
 		 576 aa  82.4  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1482  outer membrane efflux protein  25.22 
 
 		 471 aa  82.4  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.387043 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1665  outer membrane efflux protein  24.89 
 
 		 464 aa  80.5  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0863  outer membrane efflux protein  27.17 
 
 		 476 aa  80.1  0.00000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0409869  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3093  outer membrane protein  27.15 
 
 		 503 aa  79.7  0.00000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0096  outer membrane efflux protein  23.67 
 
 		 441 aa  79.7  0.00000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  26.77 
 
 		 419 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2194  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.12 
 
 		 518 aa  79  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0247365  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1482  outer membrane efflux protein  26.56 
 
 		 426 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.979092  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1990  outer membrane efflux protein  25.68 
 
 		 471 aa  78.2  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.154832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0605  outer membrane efflux protein  23 
 
 		 470 aa  78.2  0.0000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1949  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.91 
 
 		 459 aa  77.8  0.0000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1015  Outer membrane efflux protein  25.64 
 
 		 731 aa  77  0.0000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0127212 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5078  outer membrane efflux protein  26.3 
 
 		 635 aa  77  0.0000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.851054  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3626  outer membrane efflux protein  26.97 
 
 		 627 aa  77  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0887926  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0224  outer membrane efflux protein  26.2 
 
 		 419 aa  76.6  0.0000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000720591  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  23.76 
 
 		 441 aa  75.9  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0881  outer membrane efflux protein  28.03 
 
 		 535 aa  75.5  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.705042  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3496  outer membrane efflux protein  27.29 
 
 		 565 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3625  outer membrane efflux protein  26.11 
 
 		 525 aa  75.1  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.262442  normal  0.276667 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0071  outer membrane efflux protein  23.84 
 
 		 441 aa  74.7  0.000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0291  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  27.65 
 
 		 465 aa  74.3  0.000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.33434  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3409  outer membrane efflux protein  26.02 
 
 		 419 aa  74.3  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000155286  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3710  outer membrane efflux protein  25.75 
 
 		 419 aa  73.2  0.000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1203  outer membrane efflux protein  22.27 
 
 		 497 aa  72.4  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2154  outer membrane protein CyaE, putative  26.83 
 
 		 453 aa  73.2  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3126  outer membrane efflux protein  22.35 
 
 		 444 aa  72.4  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2283  outer membrane efflux protein  25.12 
 
 		 501 aa  72  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0628456 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02434  hypothetical protein  23.72 
 
 		 463 aa  72  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2562  outer membrane efflux protein  28.24 
 
 		 500 aa  71.2  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0520371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1376  Outer membrane efflux protein  24.14 
 
 		 435 aa  71.6  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.109779  hitchhiker  0.00244241 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3447  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  24.72 
 
 		 477 aa  70.9  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0057  outer membrane protein, putative  25.85 
 
 		 470 aa  70.9  0.00000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1600  outer membrane efflux protein  26.07 
 
 		 499 aa  70.9  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.174043  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3362  outer membrane efflux protein  24.71 
 
 		 431 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0611  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.17 
 
 		 464 aa  68.6  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0651  outer membrane efflux protein  26.63 
 
 		 524 aa  68.9  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.703393  normal  0.0209094 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3730  outer membrane efflux protein  23.68 
 
 		 477 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1725  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.49 
 
 		 489 aa  68.2  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.736299  normal  0.0102072 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2362  outer membrane efflux protein  21.91 
 
 		 446 aa  68.6  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.451057 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1562  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.29 
 
 		 478 aa  67.8  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6027  nodulation protein T precursor  25.81 
 
 		 483 aa  67.8  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2162  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  24.53 
 
 		 475 aa  67  0.0000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0722212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2148  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.39 
 
 		 497 aa  67  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.400858  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1727  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.67 
 
 		 452 aa  67  0.0000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000826676  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2663  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.21 
 
 		 496 aa  67  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2577  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.15 
 
 		 522 aa  67  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00589159 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0532  outer membrane efflux protein  25.53 
 
 		 578 aa  66.6  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.52231  normal  0.0114882 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0427  outer membrane efflux protein  26.3 
 
 		 455 aa  67  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.410338  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0515  outer membrane efflux protein  25.53 
 
 		 578 aa  66.6  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2365  outer membrane efflux protein  25 
 
 		 482 aa  66.6  0.0000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.316372 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4505  outer membrane efflux protein  27.14 
 
 		 972 aa  66.6  0.0000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.300614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4942  outer membrane efflux protein  25.24 
 
 		 449 aa  65.9  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.755187  normal  0.782486 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0582  outer membrane efflux protein  23.45 
 
 		 464 aa  66.2  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2433  outer membrane efflux protein  25.76 
 
 		 440 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6170  outer membrane efflux protein  27.76 
 
 		 435 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.446847 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5878  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.88 
 
 		 463 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.539647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4508  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  24.77 
 
 		 505 aa  65.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0567962 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0456  outer membrane efflux protein  26.45 
 
 		 456 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0455  outer membrane efflux protein  26.45 
 
 		 463 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.236814  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3814  outer membrane efflux protein  24.85 
 
 		 493 aa  65.1  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000440013  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0526  outer membrane efflux protein  24.85 
 
 		 489 aa  64.7  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00662182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4394  outer membrane efflux protein  25.97 
 
 		 465 aa  65.1  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000587559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2568  outer membrane efflux protein  27.59 
 
 		 438 aa  64.7  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.316597 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0530  outer membrane efflux protein  24.85 
 
 		 473 aa  64.7  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.40399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0908  RND efflux system outer membrane lipoprotein  22.84 
 
 		 455 aa  64.7  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1217  outer membrane efflux protein  25.12 
 
 		 438 aa  64.3  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.87899  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>