More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4505 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_4505  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 972 aa  1939    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.300614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1015  Outer membrane efflux protein  50 
 
 		 731 aa  419  9.999999999999999e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0127212 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5078  outer membrane efflux protein  46.5 
 
 		 635 aa  394  1e-108  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.851054  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3625  outer membrane efflux protein  47.05 
 
 		 525 aa  377  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.262442  normal  0.276667 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3496  outer membrane efflux protein  46.17 
 
 		 565 aa  351  4e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3626  outer membrane efflux protein  51.83 
 
 		 627 aa  326  1e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0887926  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0515  outer membrane efflux protein  39.4 
 
 		 578 aa  311  2.9999999999999997e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0532  outer membrane efflux protein  39.4 
 
 		 578 aa  311  2.9999999999999997e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.52231  normal  0.0114882 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1761  hypothetical protein  42.08 
 
 		 576 aa  294  7e-78  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0360  RND family outer membrane efflux protein  36.44 
 
 		 574 aa  241  4e-62  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02231  RND family outer membrane efflux protein  35.67 
 
 		 577 aa  236  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2330  RND family outer membrane efflux protein  36.08 
 
 		 594 aa  236  2.0000000000000002e-60  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01101  RND family outer membrane efflux protein  29.91 
 
 		 505 aa  166  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1465  outer membrane efflux protein  31.62 
 
 		 526 aa  158  6e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.505044  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01671  RND family outer membrane efflux protein  31.07 
 
 		 526 aa  151  7e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01091  RND family outer membrane efflux protein  24.38 
 
 		 476 aa  124  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01131  RND family outer membrane efflux protein  24.41 
 
 		 475 aa  117  7.999999999999999e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.245379  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01121  RND family outer membrane efflux protein  25.73 
 
 		 475 aa  112  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0101  RND family outer membrane efflux protein-like  25.77 
 
 		 477 aa  111  6e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.87226  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1181  Outer membrane protein-like  27.51 
 
 		 606 aa  95.9  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1177  outer membrane efflux protein  24.42 
 
 		 427 aa  92  4e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2724  outer membrane efflux protein  24.61 
 
 		 440 aa  91.3  8e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.190068  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1990  outer membrane efflux protein  25.17 
 
 		 471 aa  90.5  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.154832  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2154  outer membrane protein CyaE, putative  24.31 
 
 		 453 aa  89.7  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1376  Outer membrane efflux protein  25.34 
 
 		 435 aa  89.7  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.109779  hitchhiker  0.00244241 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2001  LipD protein, putative  24.38 
 
 		 445 aa  87.4  0.000000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.538795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1650  Outer membrane efflux protein  25 
 
 		 499 aa  86.7  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0374464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1633  outer membrane efflux protein  25.47 
 
 		 420 aa  87  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.159543  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1606  outer membrane efflux protein  28.82 
 
 		 421 aa  86.7  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  23.33 
 
 		 441 aa  84.7  0.000000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1967  outer membrane efflux protein  26.71 
 
 		 443 aa  84.7  0.000000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000399706  normal  0.35271 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2799  outer membrane efflux protein  24.14 
 
 		 435 aa  84  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000194078  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2629  outer membrane efflux protein  28.65 
 
 		 421 aa  84  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111539  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0162  outer membrane efflux protein  25.83 
 
 		 433 aa  82.4  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  26.43 
 
 		 1470 aa  82.8  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1617  outer membrane efflux protein  21.93 
 
 		 467 aa  82.4  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1475  outer membrane efflux protein  26.33 
 
 		 449 aa  81.3  0.00000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.236212  normal  0.298581 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0096  outer membrane efflux protein  24.84 
 
 		 441 aa  80.9  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0881  outer membrane efflux protein  25.24 
 
 		 535 aa  78.6  0.0000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.705042  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0627  outer membrane efflux protein, putative  22.97 
 
 		 470 aa  78.6  0.0000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.173588  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3096  outer membrane efflux protein  26.27 
 
 		 497 aa  78.2  0.0000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0310  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  20.73 
 
 		 461 aa  77.8  0.0000000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0728642  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2704  outer membrane efflux protein  29.6 
 
 		 423 aa  77.8  0.0000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0961  Outer membrane protein-like  35.77 
 
 		 491 aa  77  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0234127  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3627  outer membrane efflux protein  27.18 
 
 		 461 aa  77.4  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.433273  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2350  outer membrane efflux protein  24.22 
 
 		 441 aa  77.4  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3801  outer membrane efflux protein  27.39 
 
 		 449 aa  76.6  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233057 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2365  outer membrane efflux protein  29.41 
 
 		 482 aa  75.5  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.316372 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  27.36 
 
 		 1496 aa  74.7  0.000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1749  outer membrane efflux protein  22.08 
 
 		 458 aa  74.7  0.000000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4230  outer membrane efflux protein  24.38 
 
 		 458 aa  74.3  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0431504  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0954  outer membrane efflux protein  23.87 
 
 		 463 aa  73.9  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0833  outer membrane efflux protein  23.95 
 
 		 496 aa  73.2  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2441  outer membrane efflux protein  25.54 
 
 		 453 aa  73.2  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0733  outer membrane efflux protein, putative  21.86 
 
 		 463 aa  72.4  0.00000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0183  outer membrane efflux protein  24.26 
 
 		 441 aa  72.8  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0837  outer membrane efflux protein  23.88 
 
 		 462 aa  72.4  0.00000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0391  Outer membrane efflux family protein  26.17 
 
 		 437 aa  71.6  0.00000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2560  outer membrane efflux protein  23.66 
 
 		 438 aa  71.2  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0066  outer membrane efflux protein  23.34 
 
 		 443 aa  71.2  0.00000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3124  outer membrane efflux protein  25.6 
 
 		 448 aa  70.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0066  outer membrane efflux protein  25.74 
 
 		 436 aa  70.5  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0814  outer membrane efflux protein  24.37 
 
 		 460 aa  70.5  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1723  outer membrane efflux protein  23.41 
 
 		 436 aa  70.5  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1609  outer membrane efflux protein  24.63 
 
 		 499 aa  69.3  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.184768  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1884  outer membrane efflux protein  23.62 
 
 		 483 aa  69.3  0.0000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0863  outer membrane efflux protein  23.73 
 
 		 476 aa  68.6  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0409869  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1482  outer membrane efflux protein  24.55 
 
 		 426 aa  68.6  0.0000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.979092  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6770  outer membrane efflux protein  22.68 
 
 		 488 aa  67.8  0.0000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1165  Outer membrane efflux protein  25.41 
 
 		 462 aa  67.8  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0071  outer membrane efflux protein  24.84 
 
 		 441 aa  67.4  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2027  outer membrane efflux protein  23.35 
 
 		 495 aa  66.6  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000179084 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15731  hypothetical protein  22.69 
 
 		 391 aa  65.9  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3937  outer membrane efflux protein  23.28 
 
 		 447 aa  65.1  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00157367 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2173  outer membrane efflux protein  22.65 
 
 		 448 aa  65.5  0.000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5578  outer membrane efflux protein  19.23 
 
 		 451 aa  65.5  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.46516 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0224  outer membrane efflux protein  25.62 
 
 		 419 aa  64.7  0.000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000720591  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0007  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  20.73 
 
 		 465 aa  64.7  0.000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000120725  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0207  outer membrane efflux protein  24.32 
 
 		 523 aa  64.3  0.000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4447  outer membrane efflux protein  27.14 
 
 		 459 aa  63.9  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3129  Outer membrane efflux protein  25.28 
 
 		 446 aa  64.3  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000215977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1027  outer membrane efflux protein  23.56 
 
 		 452 aa  63.9  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3853  outer membrane efflux protein  22.12 
 
 		 447 aa  63.9  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03674  putative outer membrane CHANEL lipoprotein  22.93 
 
 		 488 aa  63.9  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.119855 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2001  outer membrane efflux protein  23.52 
 
 		 473 aa  63.2  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.612283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0057  outer membrane protein, putative  27.27 
 
 		 470 aa  63.5  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  22.17 
 
 		 419 aa  63.2  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2517  Outer membrane efflux protein  26.54 
 
 		 455 aa  63.9  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0940003  normal  0.677218 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2368  outer membrane efflux protein  23.52 
 
 		 473 aa  63.2  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0254327  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2200  outer membrane efflux protein  22.8 
 
 		 495 aa  63.5  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3444  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.52 
 
 		 495 aa  63.2  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.960604 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1600  outer membrane efflux protein  22.57 
 
 		 499 aa  62.8  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.174043  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0278  outer membrane efflux protein  21.44 
 
 		 441 aa  62.4  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000626538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0762  outer membrane efflux protein  24.73 
 
 		 446 aa  62.4  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0283  outer membrane efflux protein  26.13 
 
 		 439 aa  62  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1525  outer membrane efflux protein  26.73 
 
 		 442 aa  62  0.00000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000580745  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0242  outer membrane efflux protein  25.86 
 
 		 444 aa  62  0.00000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.231209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3710  outer membrane efflux protein  21.73 
 
 		 419 aa  61.6  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2126  hypothetical protein  24.46 
 
 		 508 aa  61.6  0.00000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0453  Outer membrane efflux protein  21.37 
 
 		 470 aa  61.6  0.00000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>