274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1465 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1465  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 526 aa  1050    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.505044  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01671  RND family outer membrane efflux protein  97.15 
 
 		 526 aa  951    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2330  RND family outer membrane efflux protein  40.92 
 
 		 594 aa  426  1e-118  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01101  RND family outer membrane efflux protein  50.55 
 
 		 505 aa  419  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0360  RND family outer membrane efflux protein  44.76 
 
 		 574 aa  408  1.0000000000000001e-112  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02231  RND family outer membrane efflux protein  45.58 
 
 		 577 aa  365  1e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01091  RND family outer membrane efflux protein  33.33 
 
 		 476 aa  223  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01121  RND family outer membrane efflux protein  32.8 
 
 		 475 aa  222  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01131  RND family outer membrane efflux protein  31.98 
 
 		 475 aa  214  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.245379  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0101  RND family outer membrane efflux protein-like  32.92 
 
 		 477 aa  212  1e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.87226  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1761  hypothetical protein  32.89 
 
 		 576 aa  201  3.9999999999999996e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1181  Outer membrane protein-like  31 
 
 		 606 aa  200  7e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5078  outer membrane efflux protein  28.6 
 
 		 635 aa  181  2.9999999999999997e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.851054  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1015  Outer membrane efflux protein  28.15 
 
 		 731 aa  177  4e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0127212 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3625  outer membrane efflux protein  26.96 
 
 		 525 aa  173  7.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.262442  normal  0.276667 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4505  outer membrane efflux protein  28.39 
 
 		 972 aa  172  1e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.300614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3496  outer membrane efflux protein  27.64 
 
 		 565 aa  168  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0532  outer membrane efflux protein  27.29 
 
 		 578 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.52231  normal  0.0114882 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0515  outer membrane efflux protein  27.29 
 
 		 578 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3626  outer membrane efflux protein  31.09 
 
 		 627 aa  162  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0887926  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3093  outer membrane protein  23.34 
 
 		 503 aa  79  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1177  outer membrane efflux protein  24.78 
 
 		 427 aa  76.3  0.000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3226  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.76 
 
 		 503 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303935  normal  0.0862047 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4075  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  23.7 
 
 		 503 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.147604  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4291  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.7 
 
 		 503 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1728  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.25 
 
 		 509 aa  74.3  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.141114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3709  RND efflux system outer membrane lipoprotein  22.72 
 
 		 500 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1384  outer membrane efflux protein  23.54 
 
 		 435 aa  71.6  0.00000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.642492  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1967  outer membrane efflux protein  24.37 
 
 		 443 aa  71.2  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000399706  normal  0.35271 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4187  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.27 
 
 		 504 aa  71.2  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.164619  normal  0.718277 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1919  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  21.79 
 
 		 482 aa  69.3  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.328582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0961  Outer membrane protein-like  30.83 
 
 		 491 aa  68.2  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0234127  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15731  hypothetical protein  22.83 
 
 		 391 aa  67.4  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0096  outer membrane efflux protein  22.77 
 
 		 441 aa  67  0.0000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3801  outer membrane efflux protein  22.43 
 
 		 449 aa  66.6  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233057 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  25.6 
 
 		 419 aa  65.5  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1450  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  23.89 
 
 		 471 aa  65.5  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0881  outer membrane efflux protein  23.61 
 
 		 535 aa  64.3  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.705042  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3710  outer membrane efflux protein  24.68 
 
 		 419 aa  64.3  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0207  outer membrane efflux protein  22.14 
 
 		 523 aa  63.2  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2154  outer membrane protein CyaE, putative  22.41 
 
 		 453 aa  62.8  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0141  RND efflux system, outer membrane protein  25.31 
 
 		 506 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0169  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  26.07 
 
 		 493 aa  63.2  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000204876 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2774  Outer membrane protein  25.31 
 
 		 508 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1037  RND efflux system, outer membrane protein  25.31 
 
 		 508 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2441  outer membrane efflux protein  23.12 
 
 		 453 aa  62.8  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0168  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  25.31 
 
 		 508 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0618806  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1312  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  25.31 
 
 		 508 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1686  RND efflux system outer membrane lipoprotein NodT  23.93 
 
 		 516 aa  62.8  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.108559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2631  NodT family efflux transporter outer membrane lipoprotein  25.31 
 
 		 508 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2338  efflux ABC transporter outer membrane protein  24.11 
 
 		 470 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1362  outer membrane efflux family protein  22.32 
 
 		 558 aa  60.8  0.00000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4314  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.19 
 
 		 502 aa  60.1  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.488327 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2178  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  24.37 
 
 		 479 aa  59.7  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0224  outer membrane efflux protein  24.18 
 
 		 419 aa  59.3  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000720591  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31920  putative outer membrane protein  21.93 
 
 		 498 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.964531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2365  outer membrane efflux protein  21.97 
 
 		 482 aa  59.7  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.316372 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0455  outer membrane efflux protein  22.74 
 
 		 463 aa  58.2  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.236814  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0440  RND efflux system, outer membrane protein  25 
 
 		 509 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0456  outer membrane efflux protein  22.74 
 
 		 456 aa  58.2  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2885  RND efflux system outer membrane lipoprotein  22.57 
 
 		 495 aa  58.2  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.183945  normal  0.24109 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4142  outer membrane efflux protein  23.49 
 
 		 497 aa  58.2  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.958426  hitchhiker  0.00365026 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2724  outer membrane efflux protein  23.47 
 
 		 440 aa  58.2  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.190068  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2436  hypothetical protein  23.19 
 
 		 520 aa  57.8  0.0000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3627  outer membrane efflux protein  24.19 
 
 		 461 aa  57.4  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.433273  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0278  outer membrane efflux protein  22.22 
 
 		 441 aa  57  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000626538  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2582  hypothetical protein  22.94 
 
 		 520 aa  56.6  0.0000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2711  outer membrane lipoprotein precursor  21.88 
 
 		 499 aa  57  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.299078  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1948  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.79 
 
 		 495 aa  56.2  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0427  outer membrane efflux protein  22.04 
 
 		 455 aa  56.6  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.410338  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3811  RND efflux system outer membrane lipoprotein  22.78 
 
 		 476 aa  56.2  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.521708  normal  0.399123 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2899  RND efflux system outer membrane lipoprotein  20.44 
 
 		 504 aa  55.5  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3057  outer membrane efflux protein  25.44 
 
 		 440 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.969203  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3219  outer membrane efflux protein  24.06 
 
 		 440 aa  55.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0837  outer membrane efflux protein  23.25 
 
 		 462 aa  55.5  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1617  outer membrane efflux protein  22.83 
 
 		 467 aa  55.5  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3165  outer membrane efflux protein  25.44 
 
 		 445 aa  55.1  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.391786  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6520  RND efflux system outer membrane lipoprotein  19.8 
 
 		 500 aa  55.5  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.128206 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1562  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.4 
 
 		 478 aa  55.1  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2485  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  23.38 
 
 		 487 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.072827  normal  0.13209 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3129  Outer membrane efflux protein  22.99 
 
 		 446 aa  54.7  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000215977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5123  RND efflux system outer membrane lipoprotein  22.53 
 
 		 510 aa  54.7  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3712  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.88 
 
 		 478 aa  54.7  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0255068 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3124  outer membrane efflux protein  22.02 
 
 		 448 aa  54.7  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1231  RND efflux system outer membrane lipoprotein  21.78 
 
 		 486 aa  54.7  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0812696  normal  0.324306 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3096  outer membrane efflux protein  20.98 
 
 		 497 aa  54.7  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0627  outer membrane efflux protein, putative  20.37 
 
 		 470 aa  54.3  0.000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.173588  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2162  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  21.07 
 
 		 489 aa  54.3  0.000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3444  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.82 
 
 		 495 aa  53.9  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.960604 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1376  Outer membrane efflux protein  21.72 
 
 		 435 aa  53.9  0.000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.109779  hitchhiker  0.00244241 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0057  outer membrane protein, putative  21.46 
 
 		 470 aa  53.5  0.000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5856  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23 
 
 		 493 aa  53.9  0.000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01590  putative outer membrane protein TolC  25.75 
 
 		 451 aa  53.5  0.000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.29548  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2969  outer membrane efflux protein  24.91 
 
 		 443 aa  53.5  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.725894  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0582  outer membrane efflux protein  23.73 
 
 		 464 aa  53.5  0.000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2367  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  21.8 
 
 		 474 aa  53.5  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3409  outer membrane efflux protein  23.15 
 
 		 419 aa  53.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000155286  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004522  type I secretion TolC precursor  23.82 
 
 		 442 aa  53.1  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000301167  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1086  RND efflux system outer membrane lipoprotein  21.25 
 
 		 482 aa  53.1  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.981132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2064  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  21.7 
 
 		 499 aa  53.1  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>