52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1181 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_1181  Outer membrane protein-like  100 
 
 		 606 aa  1189    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01101  RND family outer membrane efflux protein  33.65 
 
 		 505 aa  196  1e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2330  RND family outer membrane efflux protein  27.78 
 
 		 594 aa  188  2e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0360  RND family outer membrane efflux protein  28.34 
 
 		 574 aa  183  8.000000000000001e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01671  RND family outer membrane efflux protein  30.37 
 
 		 526 aa  178  3e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1465  outer membrane efflux protein  30.14 
 
 		 526 aa  177  7e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.505044  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01131  RND family outer membrane efflux protein  31.31 
 
 		 475 aa  170  8e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.245379  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0101  RND family outer membrane efflux protein-like  30.41 
 
 		 477 aa  166  8e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.87226  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02231  RND family outer membrane efflux protein  28.6 
 
 		 577 aa  162  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01121  RND family outer membrane efflux protein  30.1 
 
 		 475 aa  161  4e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01091  RND family outer membrane efflux protein  28.97 
 
 		 476 aa  160  8e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0515  outer membrane efflux protein  25.12 
 
 		 578 aa  106  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0532  outer membrane efflux protein  25.12 
 
 		 578 aa  106  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.52231  normal  0.0114882 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1761  hypothetical protein  26.8 
 
 		 576 aa  102  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3496  outer membrane efflux protein  26.22 
 
 		 565 aa  99  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4505  outer membrane efflux protein  27.51 
 
 		 972 aa  96.3  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.300614  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5078  outer membrane efflux protein  22.35 
 
 		 635 aa  90.1  9e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.851054  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1015  Outer membrane efflux protein  21.49 
 
 		 731 aa  89  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0127212 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3626  outer membrane efflux protein  25.17 
 
 		 627 aa  89  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0887926  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3625  outer membrane efflux protein  23.31 
 
 		 525 aa  77.4  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.262442  normal  0.276667 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2441  outer membrane efflux protein  20.7 
 
 		 453 aa  62  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0849  outer membrane efflux protein  24.14 
 
 		 417 aa  59.3  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000450472  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0096  outer membrane efflux protein  28.48 
 
 		 441 aa  55.1  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3096  outer membrane efflux protein  21.49 
 
 		 497 aa  54.3  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0744  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.23 
 
 		 449 aa  53.9  0.000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.291612  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5578  outer membrane efflux protein  19.56 
 
 		 451 aa  53.1  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.46516 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3056  outer membrane efflux protein  20.7 
 
 		 485 aa  52.4  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111107 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3801  outer membrane efflux protein  18.51 
 
 		 449 aa  51.6  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233057 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2169  outer membrane toxin secretion efflux protein, putative  27.72 
 
 		 496 aa  51.6  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1827  outer membrane efflux protein  27.72 
 
 		 496 aa  51.6  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.115006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2035  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.7 
 
 		 486 aa  50.8  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.152355  normal  0.152355 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1941  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.4 
 
 		 497 aa  50.8  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.211357  normal  0.0401761 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1994  outer membrane efflux protein  23.06 
 
 		 495 aa  48.9  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.184092  normal  0.0261874 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3124  outer membrane efflux protein  22.4 
 
 		 448 aa  47.8  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1990  outer membrane efflux protein  18.89 
 
 		 471 aa  47.4  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.154832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2950  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.08 
 
 		 479 aa  47  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3628  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.56 
 
 		 479 aa  45.4  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.93917  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2822  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.56 
 
 		 479 aa  45.4  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.390937  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0046  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.56 
 
 		 471 aa  45.4  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1721  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.11 
 
 		 482 aa  45.4  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.456925  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3620  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.11 
 
 		 482 aa  45.4  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3644  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.56 
 
 		 471 aa  45.4  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3627  outer membrane efflux protein  23.2 
 
 		 461 aa  45.4  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.433273  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3155  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.11 
 
 		 482 aa  45.4  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.267117  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0908  RND efflux system outer membrane lipoprotein  22.15 
 
 		 455 aa  44.7  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6770  outer membrane efflux protein  27.59 
 
 		 488 aa  44.7  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2629  outer membrane efflux protein  21.13 
 
 		 421 aa  44.3  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111539  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1955  outer membrane efflux protein  23.74 
 
 		 476 aa  44.3  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.223795  normal  0.557378 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2283  outer membrane efflux protein  22.25 
 
 		 501 aa  44.3  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0628456 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1606  outer membrane efflux protein  25.89 
 
 		 421 aa  43.9  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0979  outer membrane efflux protein  24.48 
 
 		 375 aa  43.9  0.009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.2318 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0881  outer membrane efflux protein  21.57 
 
 		 535 aa  43.5  0.01  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.705042  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>