275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_2330 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0360  RND family outer membrane efflux protein  73.04 
 
 		 574 aa  832    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2330  RND family outer membrane efflux protein  100 
 
 		 594 aa  1192    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02231  RND family outer membrane efflux protein  52.1 
 
 		 577 aa  546  1e-154  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1465  outer membrane efflux protein  40.55 
 
 		 526 aa  381  1e-104  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.505044  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01671  RND family outer membrane efflux protein  40.92 
 
 		 526 aa  377  1e-103  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01101  RND family outer membrane efflux protein  40.34 
 
 		 505 aa  343  8e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1761  hypothetical protein  38.35 
 
 		 576 aa  249  7e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4505  outer membrane efflux protein  36.08 
 
 		 972 aa  236  1.0000000000000001e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.300614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1015  Outer membrane efflux protein  33.61 
 
 		 731 aa  218  2e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0127212 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5078  outer membrane efflux protein  32.24 
 
 		 635 aa  204  3e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.851054  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3496  outer membrane efflux protein  34.61 
 
 		 565 aa  202  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0532  outer membrane efflux protein  33.07 
 
 		 578 aa  193  8e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.52231  normal  0.0114882 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0515  outer membrane efflux protein  33.07 
 
 		 578 aa  193  8e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01091  RND family outer membrane efflux protein  27.19 
 
 		 476 aa  188  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1181  Outer membrane protein-like  27.78 
 
 		 606 aa  188  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01131  RND family outer membrane efflux protein  26.76 
 
 		 475 aa  185  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.245379  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01121  RND family outer membrane efflux protein  26.53 
 
 		 475 aa  181  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3625  outer membrane efflux protein  36.42 
 
 		 525 aa  181  4e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.262442  normal  0.276667 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0101  RND family outer membrane efflux protein-like  26.33 
 
 		 477 aa  177  4e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.87226  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3626  outer membrane efflux protein  36.53 
 
 		 627 aa  177  5e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0887926  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0096  outer membrane efflux protein  25.6 
 
 		 441 aa  80.1  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3945  putative outer membrane protein tolC precursor  23.82 
 
 		 461 aa  80.1  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.8738  normal  0.222307 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0057  outer membrane protein, putative  24.64 
 
 		 470 aa  77.8  0.0000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0961  Outer membrane protein-like  33.33 
 
 		 491 aa  76.6  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0234127  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2365  outer membrane efflux protein  25.17 
 
 		 482 aa  75.1  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.316372 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1177  outer membrane efflux protein  24.47 
 
 		 427 aa  72.4  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2577  Type I secretion outer membrane protein, TolC  22.22 
 
 		 522 aa  72  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00589159 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2154  outer membrane protein CyaE, putative  23.83 
 
 		 453 aa  70.5  0.00000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0066  outer membrane efflux protein  25.16 
 
 		 443 aa  70.5  0.00000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2126  hypothetical protein  25.72 
 
 		 508 aa  69.7  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3710  outer membrane efflux protein  23.54 
 
 		 419 aa  69.7  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1617  outer membrane efflux protein  22.78 
 
 		 467 aa  69.7  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0837  outer membrane efflux protein  24.66 
 
 		 462 aa  68.6  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2568  Type I secretion outer membrane protein, TolC  22.7 
 
 		 464 aa  67.8  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3558  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.2 
 
 		 472 aa  66.6  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.445028  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1990  outer membrane efflux protein  21.18 
 
 		 471 aa  67  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.154832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2283  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.51 
 
 		 480 aa  66.2  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0791  outer membrane efflux protein  25.62 
 
 		 454 aa  65.1  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.670065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1826  Type I secretion outer membrane protein, TolC  21.99 
 
 		 487 aa  65.5  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0207  outer membrane efflux protein  24.14 
 
 		 523 aa  65.5  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0224  outer membrane efflux protein  24.39 
 
 		 419 aa  65.1  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000720591  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2894  Type I secretion outer membrane protein, TolC  21.51 
 
 		 460 aa  64.7  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0283  outer membrane efflux protein  25.97 
 
 		 439 aa  64.7  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1948  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.22 
 
 		 495 aa  64.3  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4142  outer membrane efflux protein  26.12 
 
 		 497 aa  63.9  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.958426  hitchhiker  0.00365026 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2851  type I secretion outer membrane protein, TolC family  22.93 
 
 		 463 aa  63.9  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1384  outer membrane efflux protein  27.27 
 
 		 435 aa  63.5  0.00000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.642492  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1884  outer membrane efflux protein  22.69 
 
 		 483 aa  63.2  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3093  outer membrane protein  21.52 
 
 		 503 aa  62.8  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  23.99 
 
 		 419 aa  62.4  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0071  outer membrane efflux protein  23.25 
 
 		 441 aa  61.2  0.00000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0814  outer membrane efflux protein  23.51 
 
 		 460 aa  61.2  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4636  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.52 
 
 		 521 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00362376  normal  0.387542 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3409  outer membrane efflux protein  23.71 
 
 		 419 aa  61.2  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000155286  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3627  outer membrane efflux protein  25.09 
 
 		 461 aa  61.2  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.433273  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5578  outer membrane efflux protein  22.1 
 
 		 451 aa  60.8  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.46516 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2713  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  28.77 
 
 		 477 aa  60.5  0.00000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.249401  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3444  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.93 
 
 		 495 aa  60.1  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.960604 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2098  putative outer membrane protein tolC  24.7 
 
 		 456 aa  59.7  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2013  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.38 
 
 		 472 aa  60.1  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.226354  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1907  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.57 
 
 		 472 aa  59.7  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  23.19 
 
 		 1470 aa  59.7  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0162  outer membrane efflux protein  25 
 
 		 433 aa  59.7  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0627  outer membrane efflux protein, putative  24.44 
 
 		 470 aa  59.3  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.173588  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1376  Outer membrane efflux protein  24.92 
 
 		 435 aa  59.7  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.109779  hitchhiker  0.00244241 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2441  outer membrane efflux protein  24.84 
 
 		 453 aa  59.3  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2893  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.54 
 
 		 516 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0849  outer membrane efflux protein  21.04 
 
 		 417 aa  59.7  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000450472  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3096  outer membrane efflux protein  29.66 
 
 		 497 aa  58.5  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2704  outer membrane efflux protein  24.55 
 
 		 423 aa  58.2  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1633  outer membrane efflux protein  26.18 
 
 		 420 aa  58.5  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.159543  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15731  hypothetical protein  20.93 
 
 		 391 aa  58.5  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0881  outer membrane efflux protein  22.5 
 
 		 535 aa  58.2  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.705042  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3004  putative outer TolC membrane protein  24.09 
 
 		 469 aa  58.2  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.833992 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2799  outer membrane efflux protein  25.5 
 
 		 435 aa  58.2  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000194078  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4182  outer membrane efflux protein  25.39 
 
 		 431 aa  58.2  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0954  outer membrane efflux protein  22.92 
 
 		 463 aa  58.2  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1606  outer membrane efflux protein  24.22 
 
 		 421 aa  57.8  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0722  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.5 
 
 		 449 aa  57.8  0.0000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.278359  normal  0.698539 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4235  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.58 
 
 		 463 aa  57.4  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.902691  normal  0.529157 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3360  type I secretion outer membrane protein, TolC family protein  25.14 
 
 		 444 aa  57.4  0.0000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.21716  normal  0.12144 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2629  outer membrane efflux protein  24.23 
 
 		 421 aa  57.4  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111539  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  23.74 
 
 		 1496 aa  56.6  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2200  outer membrane efflux protein  23.94 
 
 		 495 aa  56.6  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0544  outer membrane channel protein  23.81 
 
 		 448 aa  56.6  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000576987  normal  0.601769 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0733  outer membrane efflux protein, putative  21.04 
 
 		 463 aa  56.2  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  22.54 
 
 		 441 aa  56.2  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1064  outer membrane efflux protein  24.01 
 
 		 443 aa  55.8  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4294  outer membrane efflux protein  22.62 
 
 		 448 aa  56.2  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0190007  normal  0.396606 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2485  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  23.48 
 
 		 487 aa  55.5  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.072827  normal  0.13209 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5432  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.05 
 
 		 553 aa  55.5  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.199925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1450  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  27.57 
 
 		 471 aa  55.1  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3124  outer membrane efflux protein  26.61 
 
 		 448 aa  55.1  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6208  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.87 
 
 		 497 aa  54.3  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.842439  normal  0.408471 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2027  outer membrane efflux protein  24.1 
 
 		 495 aa  54.7  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000179084 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4268  outer membrane channel protein  23.56 
 
 		 497 aa  54.3  0.000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0102816 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4447  outer membrane efflux protein  28.7 
 
 		 459 aa  53.9  0.000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2616  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.64 
 
 		 450 aa  53.9  0.000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.930678  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1434  type I secretion outer membrane protein, TolC  20.94 
 
 		 490 aa  53.1  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.44207  normal  0.675589 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0169  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  20.85 
 
 		 493 aa  53.5  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000204876 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>