21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_15731 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_15731  hypothetical protein  100 
 
 		 391 aa  795    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4505  outer membrane efflux protein  22.59 
 
 		 972 aa  72.8  0.000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.300614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02231  RND family outer membrane efflux protein  23.36 
 
 		 577 aa  71.2  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01671  RND family outer membrane efflux protein  23.48 
 
 		 526 aa  70.9  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1465  outer membrane efflux protein  22.97 
 
 		 526 aa  70.5  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.505044  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0360  RND family outer membrane efflux protein  24.59 
 
 		 574 aa  69.3  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1761  hypothetical protein  24.23 
 
 		 576 aa  69.3  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3625  outer membrane efflux protein  20.53 
 
 		 525 aa  66.6  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.262442  normal  0.276667 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01101  RND family outer membrane efflux protein  22.12 
 
 		 505 aa  64.7  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2330  RND family outer membrane efflux protein  20.93 
 
 		 594 aa  63.2  0.000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0101  RND family outer membrane efflux protein-like  21.19 
 
 		 477 aa  60.8  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.87226  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3626  outer membrane efflux protein  23.37 
 
 		 627 aa  57.4  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0887926  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01131  RND family outer membrane efflux protein  22.48 
 
 		 475 aa  55.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.245379  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01121  RND family outer membrane efflux protein  23.15 
 
 		 475 aa  55.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5078  outer membrane efflux protein  22.5 
 
 		 635 aa  53.1  0.000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.851054  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01091  RND family outer membrane efflux protein  22.74 
 
 		 476 aa  53.1  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4182  outer membrane efflux protein  24.05 
 
 		 431 aa  48.9  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5561  outer membrane efflux protein  24.05 
 
 		 431 aa  47  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3496  outer membrane efflux protein  21.61 
 
 		 565 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2799  outer membrane efflux protein  22.44 
 
 		 435 aa  44.3  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000194078  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1818  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  23.78 
 
 		 482 aa  43.5  0.006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.332659  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>