101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_01131 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0101  RND family outer membrane efflux protein-like  82.74 
 
 		 477 aa  790    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.87226  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01131  RND family outer membrane efflux protein  100 
 
 		 475 aa  935    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.245379  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01091  RND family outer membrane efflux protein  69.33 
 
 		 476 aa  635    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01121  RND family outer membrane efflux protein  92.84 
 
 		 475 aa  872    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01101  RND family outer membrane efflux protein  35.31 
 
 		 505 aa  216  8e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1465  outer membrane efflux protein  31.74 
 
 		 526 aa  192  8e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.505044  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01671  RND family outer membrane efflux protein  31.74 
 
 		 526 aa  191  2e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2330  RND family outer membrane efflux protein  26.76 
 
 		 594 aa  185  1.0000000000000001e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0360  RND family outer membrane efflux protein  26.92 
 
 		 574 aa  181  4e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1181  Outer membrane protein-like  31.31 
 
 		 606 aa  170  6e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02231  RND family outer membrane efflux protein  28.34 
 
 		 577 aa  169  8e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4505  outer membrane efflux protein  24.41 
 
 		 972 aa  117  3e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.300614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3625  outer membrane efflux protein  26.4 
 
 		 525 aa  117  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.262442  normal  0.276667 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3496  outer membrane efflux protein  23.87 
 
 		 565 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1761  hypothetical protein  26.57 
 
 		 576 aa  106  1e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3626  outer membrane efflux protein  27.15 
 
 		 627 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0887926  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0515  outer membrane efflux protein  25.61 
 
 		 578 aa  99  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0532  outer membrane efflux protein  25.61 
 
 		 578 aa  99  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.52231  normal  0.0114882 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1015  Outer membrane efflux protein  23.55 
 
 		 731 aa  92  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0127212 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5078  outer membrane efflux protein  24.7 
 
 		 635 aa  89.7  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.851054  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3801  outer membrane efflux protein  28.99 
 
 		 449 aa  59.7  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233057 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1727  type I secretion outer membrane protein, TolC family  26.97 
 
 		 452 aa  58.9  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000826676  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3157  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  25.87 
 
 		 480 aa  58.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  25.72 
 
 		 419 aa  56.2  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4447  outer membrane efflux protein  19.89 
 
 		 459 aa  55.1  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2724  outer membrane efflux protein  23.57 
 
 		 440 aa  55.5  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.190068  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2156  outer membrane export factor  22.79 
 
 		 452 aa  55.1  0.000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1600  outer membrane efflux protein  21.59 
 
 		 499 aa  54.7  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.174043  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3343  type I secretion outer membrane protein, TolC family  21.72 
 
 		 452 aa  54.3  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0063  outer membrane efflux protein  23.14 
 
 		 408 aa  54.3  0.000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0180654  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0224  outer membrane efflux protein  21.51 
 
 		 419 aa  54.3  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000720591  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1609  outer membrane efflux protein  23.48 
 
 		 499 aa  53.9  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.184768  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  25 
 
 		 441 aa  53.9  0.000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2069  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.79 
 
 		 452 aa  53.9  0.000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1165  Outer membrane efflux protein  21.43 
 
 		 462 aa  53.1  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3710  outer membrane efflux protein  25.08 
 
 		 419 aa  53.1  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2534  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25 
 
 		 468 aa  52  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3447  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  23.61 
 
 		 477 aa  52.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0120  outer membrane efflux protein  22.45 
 
 		 448 aa  51.2  0.00004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000165447  hitchhiker  0.000000000000561163 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1162  outer membrane efflux protein  28.12 
 
 		 515 aa  50.4  0.00006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000199135  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0617  outer membrane efflux protein  22.69 
 
 		 447 aa  50.4  0.00006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1650  Outer membrane efflux protein  25.71 
 
 		 499 aa  50.1  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0374464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2657  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  22.69 
 
 		 473 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0121184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2001  LipD protein, putative  24.82 
 
 		 445 aa  49.7  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.538795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4182  outer membrane efflux protein  23.39 
 
 		 431 aa  49.7  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2715  outer membrane protein precursor CzcC  21.54 
 
 		 428 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727923  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0122  LipD protein, putative  25.98 
 
 		 413 aa  49.3  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0961  Outer membrane protein-like  26.32 
 
 		 491 aa  48.9  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0234127  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0066  outer membrane efflux protein  21.53 
 
 		 443 aa  48.9  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0453  Outer membrane efflux protein  24.21 
 
 		 470 aa  48.5  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15731  hypothetical protein  22.66 
 
 		 391 aa  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1749  outer membrane efflux protein  21.2 
 
 		 458 aa  48.1  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0207  outer membrane efflux protein  23.47 
 
 		 523 aa  48.1  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2020  outer membrane efflux protein  21.66 
 
 		 491 aa  48.1  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0936605  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02621  outer membrane protein required for AvrXa21 activity C (raxC)  19.13 
 
 		 443 aa  48.1  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3298  outer membrane efflux protein  25.98 
 
 		 418 aa  47.4  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000531453  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2950  TolC family type I secretion outer membrane protein  19.51 
 
 		 479 aa  47.4  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31970  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  21 
 
 		 428 aa  47  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01590  putative outer membrane protein TolC  23.29 
 
 		 451 aa  46.6  0.0009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.29548  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1994  outer membrane efflux protein  23.37 
 
 		 495 aa  46.2  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.184092  normal  0.0261874 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0258  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.89 
 
 		 539 aa  46.2  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.17913  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1126  outer membrane efflux protein  22.97 
 
 		 514 aa  46.2  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3453  putative tolC outer membrane protein  23.81 
 
 		 438 aa  46.2  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.341393 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2159  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  20.27 
 
 		 529 aa  46.2  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3126  outer membrane efflux protein  24.79 
 
 		 444 aa  46.6  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2969  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  22.65 
 
 		 465 aa  45.8  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.678758  normal  0.17281 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0057  outer membrane protein, putative  22.99 
 
 		 470 aa  45.4  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0366  putative secretion protein  21.17 
 
 		 454 aa  45.8  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.676066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1665  outer membrane efflux protein  23.91 
 
 		 464 aa  45.8  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3409  outer membrane efflux protein  23.29 
 
 		 419 aa  45.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000155286  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1482  outer membrane efflux protein  21.71 
 
 		 471 aa  45.4  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.387043 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3627  outer membrane efflux protein  22.76 
 
 		 461 aa  44.7  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.433273  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5561  outer membrane efflux protein  23.39 
 
 		 431 aa  45.1  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2883  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.64 
 
 		 442 aa  45.1  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00170075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2350  outer membrane efflux protein  23.36 
 
 		 441 aa  44.7  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0283  outer membrane efflux protein  22.7 
 
 		 439 aa  44.3  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02379  hypothetical protein  22.06 
 
 		 436 aa  44.7  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1884  outer membrane efflux protein  21 
 
 		 483 aa  44.7  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04010  RND efflux system, outer membrane lipoprotein  23.48 
 
 		 504 aa  44.7  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.174506  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3619  outer membrane channel protein  22.3 
 
 		 469 aa  44.7  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3777  outer membrane channel protein  24.48 
 
 		 470 aa  44.7  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1475  outer membrane efflux protein  27.54 
 
 		 449 aa  44.7  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.236212  normal  0.298581 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003403  agglutination protein  21.23 
 
 		 436 aa  44.3  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000998881  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2126  hypothetical protein  19.95 
 
 		 508 aa  44.3  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3186  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.45 
 
 		 502 aa  44.3  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.753905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0242  outer membrane efflux protein  25.83 
 
 		 444 aa  44.3  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.231209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4942  outer membrane efflux protein  29.79 
 
 		 449 aa  44.3  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.755187  normal  0.782486 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2822  TolC family type I secretion outer membrane protein  19.59 
 
 		 479 aa  43.9  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.390937  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3628  TolC family type I secretion outer membrane protein  19.59 
 
 		 479 aa  43.9  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.93917  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0046  TolC family type I secretion outer membrane protein  19.59 
 
 		 471 aa  43.9  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1721  TolC family type I secretion outer membrane protein  19.59 
 
 		 482 aa  44.3  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.456925  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3620  TolC family type I secretion outer membrane protein  19.59 
 
 		 482 aa  43.9  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3155  TolC family type I secretion outer membrane protein  19.59 
 
 		 482 aa  44.3  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.267117  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1376  Outer membrane efflux protein  24.17 
 
 		 435 aa  43.5  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.109779  hitchhiker  0.00244241 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2885  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23 
 
 		 495 aa  43.5  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.183945  normal  0.24109 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3444  RND efflux system outer membrane lipoprotein  21.45 
 
 		 495 aa  43.5  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.960604 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2799  outer membrane efflux protein  25.66 
 
 		 435 aa  43.5  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000194078  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1177  outer membrane efflux protein  27.03 
 
 		 427 aa  43.5  0.009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3468  outer membrane channel protein  23.38 
 
 		 495 aa  43.1  0.01  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0175451  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0849  outer membrane efflux protein  22.31 
 
 		 417 aa  43.1  0.01  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000450472  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>