157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1126 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1126  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 514 aa  1041    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1609  outer membrane efflux protein  60.52 
 
 		 499 aa  615  1e-175  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.184768  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1650  Outer membrane efflux protein  63.62 
 
 		 499 aa  612  9.999999999999999e-175  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0374464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2200  outer membrane efflux protein  57.37 
 
 		 495 aa  572  1.0000000000000001e-162  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2027  outer membrane efflux protein  58.64 
 
 		 495 aa  566  1e-160  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000179084 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1600  outer membrane efflux protein  49.01 
 
 		 499 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.174043  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2020  outer membrane efflux protein  47.76 
 
 		 491 aa  456  1e-127  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0936605  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0533  outer membrane efflux protein  35.8 
 
 		 762 aa  292  1e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2126  hypothetical protein  33.67 
 
 		 508 aa  266  7e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1190  Outer membrane efflux protein  33.62 
 
 		 510 aa  263  6.999999999999999e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2562  outer membrane efflux protein  25.63 
 
 		 500 aa  143  9e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0520371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5198  outer efflux pump domain-containing protein  27.71 
 
 		 522 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0545953 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0749  outer membrane efflux protein  27.27 
 
 		 490 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1445  outer membrane efflux protein  26.04 
 
 		 690 aa  126  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.757577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0615  Outer membrane protein-like  25.82 
 
 		 577 aa  121  3e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00243369  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0025  outer membrane efflux protein  24.68 
 
 		 486 aa  118  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.245374  normal  0.08145 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2551  outer membrane efflux protein  25.76 
 
 		 647 aa  113  8.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60770  putative outer membrane protein  24.06 
 
 		 493 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0373  outer membrane efflux protein  24.5 
 
 		 662 aa  110  8.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.540248 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3733  outer membrane efflux protein  24.09 
 
 		 488 aa  109  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5232  hypothetical protein  24.27 
 
 		 493 aa  108  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1351  outer membrane efflux protein  24.95 
 
 		 528 aa  103  6e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.225814  normal  0.0380363 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3981  outer membrane efflux protein  22.55 
 
 		 493 aa  99.4  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1875  outer membrane efflux protein  27.52 
 
 		 506 aa  99  2e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0894  outer membrane efflux protein  24.49 
 
 		 487 aa  97.4  5e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0651  outer membrane efflux protein  24.48 
 
 		 524 aa  92.8  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.703393  normal  0.0209094 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1733  outer membrane efflux protein  24.17 
 
 		 559 aa  90.1  8e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4026  outer membrane efflux protein  22.91 
 
 		 486 aa  89  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4093  outer membrane efflux protein  24.29 
 
 		 514 aa  87.4  6e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.66979 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2201  outer membrane efflux protein  24.47 
 
 		 587 aa  81.6  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.854853  normal  0.28263 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2805  outer membrane efflux protein  25.06 
 
 		 685 aa  79.3  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.977623  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  28.96 
 
 		 441 aa  78.2  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6409  outer membrane efflux protein  22.82 
 
 		 537 aa  77.4  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2992  hypothetical protein  25.27 
 
 		 542 aa  75.1  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2852  hypothetical protein  25.27 
 
 		 542 aa  75.1  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2221  outer membrane efflux protein  21.38 
 
 		 590 aa  73.2  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000846233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0954  outer membrane efflux protein  22.46 
 
 		 463 aa  73.2  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1617  outer membrane efflux protein  21.74 
 
 		 467 aa  72.4  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2365  outer membrane efflux protein  23.58 
 
 		 482 aa  72  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.316372 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2471  outer membrane efflux protein  24.37 
 
 		 481 aa  72  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0733  outer membrane efflux protein, putative  22.47 
 
 		 463 aa  71.6  0.00000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2441  outer membrane efflux protein  23.82 
 
 		 453 aa  70.5  0.00000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3801  outer membrane efflux protein  25.36 
 
 		 449 aa  70.5  0.00000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233057 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0627  outer membrane efflux protein, putative  27.46 
 
 		 470 aa  66.2  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.173588  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0360  RND family outer membrane efflux protein  26.83 
 
 		 574 aa  65.9  0.000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2517  Outer membrane efflux protein  25.63 
 
 		 455 aa  65.5  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0940003  normal  0.677218 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0961  Outer membrane protein-like  26.05 
 
 		 491 aa  65.5  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0234127  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1177  outer membrane efflux protein  24.42 
 
 		 427 aa  65.1  0.000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0837  outer membrane efflux protein  22.59 
 
 		 462 aa  64.7  0.000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0090  hypothetical protein  22.24 
 
 		 731 aa  63.9  0.000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1884  outer membrane efflux protein  23.43 
 
 		 483 aa  63.9  0.000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  25.47 
 
 		 1496 aa  62.8  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2010  outer membrane efflux family protein  23.6 
 
 		 509 aa  63.2  0.00000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0162  outer membrane efflux protein  24.69 
 
 		 433 aa  62.4  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4505  outer membrane efflux protein  22.98 
 
 		 972 aa  62.8  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.300614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0122  LipD protein, putative  24.45 
 
 		 413 aa  61.6  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3096  outer membrane efflux protein  22.66 
 
 		 497 aa  62  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  24.68 
 
 		 1470 aa  60.5  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1761  hypothetical protein  24.1 
 
 		 576 aa  60.5  0.00000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0283  outer membrane efflux protein  22.87 
 
 		 439 aa  60.5  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0938  outer membrane efflux family protein  25.45 
 
 		 452 aa  58.2  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5078  outer membrane efflux protein  25.57 
 
 		 635 aa  58.2  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.851054  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0945  outer membrane efflux family protein  24.77 
 
 		 456 aa  57.8  0.0000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.681331  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0040  type I secretion outer membrane protein  23.29 
 
 		 507 aa  57.4  0.0000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.99479  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4447  outer membrane efflux protein  26.76 
 
 		 459 aa  57  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0762  outer membrane efflux protein  25.67 
 
 		 446 aa  57  0.0000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2799  outer membrane efflux protein  21.81 
 
 		 435 aa  56.2  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000194078  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0071  outer membrane efflux protein  24.2 
 
 		 441 aa  56.2  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  22.38 
 
 		 419 aa  55.8  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5561  outer membrane efflux protein  26.1 
 
 		 431 aa  55.5  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0814  outer membrane efflux protein  24.44 
 
 		 460 aa  55.8  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1149  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.78 
 
 		 456 aa  55.8  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.435165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0863  outer membrane efflux protein  19.93 
 
 		 476 aa  55.1  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0409869  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1475  outer membrane efflux protein  22.29 
 
 		 449 aa  55.1  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.236212  normal  0.298581 
 
 
-
 
NC_003296  RS03082  hypothetical protein  23.58 
 
 		 492 aa  53.9  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.208658  normal  0.984334 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2686  Outer membrane secretion protein  20.68 
 
 		 472 aa  54.3  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.553025  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2028  Outer membrane protein-like protein  27.13 
 
 		 617 aa  52.4  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.950233  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2001  LipD protein, putative  22.38 
 
 		 445 aa  52.4  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.538795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4182  outer membrane efflux protein  29.9 
 
 		 431 aa  52.4  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1015  Outer membrane efflux protein  23.84 
 
 		 731 aa  51.6  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0127212 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6215  outer membrane efflux protein  25.5 
 
 		 493 aa  52  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.811282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2243  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.98 
 
 		 455 aa  51.6  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0101  RND family outer membrane efflux protein-like  24.78 
 
 		 477 aa  51.6  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.87226  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0057  outer membrane protein, putative  26.28 
 
 		 470 aa  51.2  0.00005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0096  outer membrane efflux protein  23.74 
 
 		 441 aa  51.2  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4072  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  23.23 
 
 		 464 aa  49.7  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0516  outer membrane efflux protein  24.76 
 
 		 413 aa  48.9  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2330  RND family outer membrane efflux protein  24.77 
 
 		 594 aa  48.9  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2106  Outer membrane efflux protein  22.83 
 
 		 471 aa  48.9  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.343125  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1671  outer membrane efflux protein  23.89 
 
 		 461 aa  49.3  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3945  putative outer membrane protein tolC precursor  23.68 
 
 		 461 aa  48.9  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.8738  normal  0.222307 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0881  outer membrane efflux protein  24.1 
 
 		 535 aa  48.9  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.705042  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1841  outer membrane efflux protein  21.97 
 
 		 471 aa  48.5  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.285879 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4315  NodT family outer membrane lipoprotein  23.39 
 
 		 504 aa  48.5  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2659  outer membrane efflux protein  21.19 
 
 		 436 aa  48.5  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3710  outer membrane efflux protein  26.32 
 
 		 419 aa  48.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1293  outer membrane efflux protein  23.61 
 
 		 442 aa  48.5  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.803504 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0833  outer membrane efflux protein  23.51 
 
 		 496 aa  48.1  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0891  outer membrane efflux protein  25.88 
 
 		 508 aa  47.8  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.116406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2692  outer membrane efflux protein  23.96 
 
 		 442 aa  48.1  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922433  normal  0.254416 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>