101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4093 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_4093  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 514 aa  1011    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.66979 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5198  outer efflux pump domain-containing protein  44.69 
 
 		 522 aa  374  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0545953 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3733  outer membrane efflux protein  44.29 
 
 		 488 aa  358  9.999999999999999e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4026  outer membrane efflux protein  45.67 
 
 		 486 aa  347  3e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3981  outer membrane efflux protein  43.72 
 
 		 493 aa  343  4e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60770  putative outer membrane protein  42.91 
 
 		 493 aa  326  7e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5232  hypothetical protein  43.31 
 
 		 493 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0894  outer membrane efflux protein  40.85 
 
 		 487 aa  295  2e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2471  outer membrane efflux protein  39.27 
 
 		 481 aa  286  9e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0749  outer membrane efflux protein  36.6 
 
 		 490 aa  264  3e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2010  outer membrane efflux family protein  26.51 
 
 		 509 aa  152  1e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0040  type I secretion outer membrane protein  26.83 
 
 		 507 aa  152  2e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.99479  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2992  hypothetical protein  28.72 
 
 		 542 aa  145  1e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2852  hypothetical protein  28.72 
 
 		 542 aa  145  1e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2562  outer membrane efflux protein  27.93 
 
 		 500 aa  115  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0520371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0025  outer membrane efflux protein  27.62 
 
 		 486 aa  109  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.245374  normal  0.08145 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2200  outer membrane efflux protein  26.57 
 
 		 495 aa  106  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2551  outer membrane efflux protein  27.4 
 
 		 647 aa  104  4e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1650  Outer membrane efflux protein  24.05 
 
 		 499 aa  101  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0374464  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03082  hypothetical protein  29.89 
 
 		 492 aa  101  4e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.208658  normal  0.984334 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2027  outer membrane efflux protein  25.31 
 
 		 495 aa  95.1  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000179084 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1126  outer membrane efflux protein  24.64 
 
 		 514 aa  94.7  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0373  outer membrane efflux protein  25.62 
 
 		 662 aa  89.7  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.540248 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1445  outer membrane efflux protein  23.52 
 
 		 690 aa  86.3  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.757577  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1609  outer membrane efflux protein  23.5 
 
 		 499 aa  85.9  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.184768  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1600  outer membrane efflux protein  24.63 
 
 		 499 aa  83.6  0.000000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.174043  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0533  outer membrane efflux protein  25.26 
 
 		 762 aa  82  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0837  outer membrane efflux protein  25.81 
 
 		 462 aa  77.8  0.0000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2020  outer membrane efflux protein  24.56 
 
 		 491 aa  77.4  0.0000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0936605  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6409  outer membrane efflux protein  26.57 
 
 		 537 aa  73.9  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3625  outer membrane efflux protein  28.96 
 
 		 525 aa  73.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.262442  normal  0.276667 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3626  outer membrane efflux protein  28.33 
 
 		 627 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0887926  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1015  Outer membrane efflux protein  29.66 
 
 		 731 aa  71.2  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0127212 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0833  outer membrane efflux protein  25 
 
 		 496 aa  70.9  0.00000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5078  outer membrane efflux protein  24.42 
 
 		 635 aa  70.9  0.00000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.851054  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0364  outer membrane channel protein  26.48 
 
 		 500 aa  70.5  0.00000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0733  outer membrane efflux protein, putative  25.11 
 
 		 463 aa  70.5  0.00000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1617  outer membrane efflux protein  23.71 
 
 		 467 aa  70.5  0.00000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0954  outer membrane efflux protein  22.47 
 
 		 463 aa  70.1  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4505  outer membrane efflux protein  27.03 
 
 		 972 aa  70.1  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.300614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1761  hypothetical protein  27.68 
 
 		 576 aa  66.6  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2221  outer membrane efflux protein  24.61 
 
 		 590 aa  66.2  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000846233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0651  outer membrane efflux protein  24.03 
 
 		 524 aa  65.9  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.703393  normal  0.0209094 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0627  outer membrane efflux protein, putative  24.11 
 
 		 470 aa  65.5  0.000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.173588  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1190  Outer membrane efflux protein  22.91 
 
 		 510 aa  65.1  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2441  outer membrane efflux protein  23.28 
 
 		 453 aa  65.5  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1875  outer membrane efflux protein  24.56 
 
 		 506 aa  64.7  0.000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1884  outer membrane efflux protein  23.5 
 
 		 483 aa  64.7  0.000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3202  hypothetical protein  28.89 
 
 		 223 aa  64.3  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.413653  normal  0.147493 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0872  Outer membrane protein-like  26.93 
 
 		 517 aa  63.5  0.000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0615  Outer membrane protein-like  22.16 
 
 		 577 aa  63.2  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00243369  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  25.81 
 
 		 441 aa  62.8  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0066  outer membrane efflux protein  23.58 
 
 		 436 aa  61.6  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  26.51 
 
 		 1496 aa  61.2  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3627  outer membrane efflux protein  25.07 
 
 		 461 aa  60.8  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.433273  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2799  outer membrane efflux protein  22.79 
 
 		 435 aa  60.8  0.00000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000194078  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7078  putative outer membrane protein  26.32 
 
 		 491 aa  58.2  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0823525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1351  outer membrane efflux protein  25 
 
 		 528 aa  57  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.225814  normal  0.0380363 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2126  hypothetical protein  22.22 
 
 		 508 aa  57  0.0000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2686  Outer membrane secretion protein  26.07 
 
 		 472 aa  57  0.0000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.553025  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2201  outer membrane efflux protein  23.6 
 
 		 587 aa  55.8  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.854853  normal  0.28263 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2899  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.69 
 
 		 504 aa  56.2  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3801  outer membrane efflux protein  22.79 
 
 		 449 aa  55.8  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233057 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1641  Outer membrane efflux protein  24.93 
 
 		 479 aa  54.3  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4142  outer membrane efflux protein  24.84 
 
 		 497 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.958426  hitchhiker  0.00365026 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2365  outer membrane efflux protein  23.37 
 
 		 482 aa  52.8  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.316372 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4162  outer membrane efflux protein  23.69 
 
 		 443 aa  52.4  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000533026  normal  0.288124 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0567  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.42 
 
 		 483 aa  51.2  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1495  outer membrane efflux protein  33.17 
 
 		 442 aa  51.2  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.74284  normal  0.017078 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0961  Outer membrane protein-like  23.05 
 
 		 491 aa  50.8  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0234127  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5432  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.85 
 
 		 553 aa  50.1  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.199925  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1723  outer membrane efflux protein  24.41 
 
 		 436 aa  48.9  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5878  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.82 
 
 		 463 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.539647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3096  outer membrane efflux protein  25.2 
 
 		 497 aa  48.5  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2583  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.89 
 
 		 497 aa  48.1  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.655757 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3737  outer membrane efflux protein  22.91 
 
 		 437 aa  47.4  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.315415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1177  outer membrane efflux protein  21.09 
 
 		 427 aa  47.4  0.0007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4144  alkaline protease secretion protein AprF  24.31 
 
 		 477 aa  47  0.0009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0485622  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0559  outer membrane efflux protein  23.05 
 
 		 455 aa  47  0.0009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2262  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.41 
 
 		 497 aa  46.6  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0148702  normal  0.873765 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0583  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.33 
 
 		 477 aa  46.2  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.196176  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1919  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  24.78 
 
 		 482 aa  46.2  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.328582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1665  outer membrane efflux protein  23.94 
 
 		 464 aa  45.8  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2243  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.78 
 
 		 455 aa  45.8  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2148  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.37 
 
 		 497 aa  45.8  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.400858  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3496  outer membrane efflux protein  23.53 
 
 		 565 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1967  outer membrane efflux protein  22.22 
 
 		 443 aa  45.8  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000399706  normal  0.35271 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1203  outer membrane efflux protein  23.24 
 
 		 497 aa  45.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0679  outer membrane efflux protein  24.34 
 
 		 444 aa  45.4  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0368289 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1176  Outer membrane efflux protein  26.38 
 
 		 429 aa  45.1  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4447  outer membrane efflux protein  21.88 
 
 		 459 aa  45.4  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4306  outer membrane efflux protein  25.32 
 
 		 447 aa  45.1  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05030  outer membrane efflux protein  21.45 
 
 		 471 aa  45.1  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.691581  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1149  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.67 
 
 		 456 aa  44.7  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.435165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1598  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.78 
 
 		 459 aa  44.3  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.538573  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2682  Type I secretion outer membrane protein, TolC  22.45 
 
 		 451 aa  44.3  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.829421  hitchhiker  0.000293137 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2639  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.26 
 
 		 461 aa  43.9  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3165  outer membrane efflux protein  30.56 
 
 		 445 aa  43.9  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.391786  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4284  outer membrane efflux protein  25.32 
 
 		 447 aa  43.9  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4260  outer membrane efflux protein  24.72 
 
 		 438 aa  43.9  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>