213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1875 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_1875  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 506 aa  983    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0651  outer membrane efflux protein  53.21 
 
 		 524 aa  408  1e-113  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.703393  normal  0.0209094 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1733  outer membrane efflux protein  44.83 
 
 		 559 aa  324  2e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1351  outer membrane efflux protein  41.68 
 
 		 528 aa  286  5e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.225814  normal  0.0380363 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2027  outer membrane efflux protein  29.46 
 
 		 495 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000179084 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2200  outer membrane efflux protein  27.84 
 
 		 495 aa  125  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1609  outer membrane efflux protein  27.44 
 
 		 499 aa  118  3e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.184768  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1600  outer membrane efflux protein  26.93 
 
 		 499 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.174043  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2562  outer membrane efflux protein  27.85 
 
 		 500 aa  113  8.000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0520371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0749  outer membrane efflux protein  29.44 
 
 		 490 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1126  outer membrane efflux protein  26.77 
 
 		 514 aa  107  7e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1650  Outer membrane efflux protein  26.38 
 
 		 499 aa  106  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0374464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1445  outer membrane efflux protein  25.2 
 
 		 690 aa  99.4  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.757577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0373  outer membrane efflux protein  27.15 
 
 		 662 aa  98.2  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.540248 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2126  hypothetical protein  26.33 
 
 		 508 aa  97.1  7e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2551  outer membrane efflux protein  29.38 
 
 		 647 aa  92.4  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0025  outer membrane efflux protein  26.5 
 
 		 486 aa  88.2  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.245374  normal  0.08145 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5198  outer efflux pump domain-containing protein  25.6 
 
 		 522 aa  82.4  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0545953 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1190  Outer membrane efflux protein  24.66 
 
 		 510 aa  80.1  0.00000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3126  outer membrane efflux protein  24.6 
 
 		 444 aa  78.6  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0533  outer membrane efflux protein  24.34 
 
 		 762 aa  77.4  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0615  Outer membrane protein-like  24.07 
 
 		 577 aa  73.9  0.000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00243369  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2201  outer membrane efflux protein  23.88 
 
 		 587 aa  73.6  0.000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.854853  normal  0.28263 
 
 
-
 
NC_003296  RS03082  hypothetical protein  28.12 
 
 		 492 aa  73.2  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.208658  normal  0.984334 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  26.72 
 
 		 419 aa  72  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2020  outer membrane efflux protein  24 
 
 		 491 aa  72.8  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0936605  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3997  Outer membrane protein-like protein  23.54 
 
 		 486 aa  71.6  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000837564 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1690  type I secretion outer membrane protein, TolC family  26.97 
 
 		 478 aa  70.9  0.00000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.522729 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3801  outer membrane efflux protein  27.46 
 
 		 449 aa  70.1  0.00000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233057 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2577  Type I secretion outer membrane protein, TolC  22.67 
 
 		 522 aa  70.1  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00589159 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1453  type I secretion outer membrane protein, TolC family  26.69 
 
 		 480 aa  69.7  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1761  hypothetical protein  28.27 
 
 		 576 aa  68.2  0.0000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6409  outer membrane efflux protein  26.46 
 
 		 537 aa  66.2  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2457  type I secretion outer membrane protein, TolC family  26.55 
 
 		 449 aa  64.7  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4205  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.36 
 
 		 431 aa  65.1  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.668787  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4942  outer membrane efflux protein  30 
 
 		 449 aa  64.3  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.755187  normal  0.782486 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0381  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.07 
 
 		 445 aa  62.8  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0230254  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2851  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.09 
 
 		 463 aa  62.4  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2583  Type I secretion outer membrane protein, TolC  26.4 
 
 		 497 aa  62  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.655757 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0979  outer membrane efflux protein  25.95 
 
 		 375 aa  62  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.2318 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1177  outer membrane efflux protein  21.78 
 
 		 427 aa  61.6  0.00000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4447  outer membrane efflux protein  25.3 
 
 		 459 aa  61.6  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1990  TolC family type I secretion outer membrane protein  29.07 
 
 		 498 aa  61.6  0.00000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0090  hypothetical protein  22.7 
 
 		 731 aa  59.7  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1725  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.6 
 
 		 489 aa  59.7  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.736299  normal  0.0102072 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0649  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.92 
 
 		 496 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.814679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5505  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.92 
 
 		 496 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.130053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1338  type I secretion outer membrane protein, TolC family  22.52 
 
 		 456 aa  58.5  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0728783  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3231  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.4 
 
 		 483 aa  58.2  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2894  Type I secretion outer membrane protein, TolC  20.65 
 
 		 460 aa  57.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1434  type I secretion outer membrane protein, TolC  25.69 
 
 		 490 aa  57.8  0.0000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.44207  normal  0.675589 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1149  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.25 
 
 		 456 aa  57.4  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.435165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0309  outer membrane efflux protein  26.6 
 
 		 458 aa  57  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.729969 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0162  outer membrane efflux protein  26.07 
 
 		 433 aa  57  0.0000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1826  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25.09 
 
 		 487 aa  57  0.0000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3004  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.08 
 
 		 464 aa  55.8  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.599739 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1641  Outer membrane efflux protein  25.52 
 
 		 479 aa  55.5  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2221  outer membrane efflux protein  25.48 
 
 		 590 aa  55.5  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000846233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48090  alkaline protease secretion outer membrane protein AprF precursor  25.68 
 
 		 481 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0152412 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60770  putative outer membrane protein  25.99 
 
 		 493 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3811  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.12 
 
 		 476 aa  55.8  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.521708  normal  0.399123 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1041  type I secretion outer membrane efflux protein  24.85 
 
 		 451 aa  55.5  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4093  outer membrane efflux protein  23.23 
 
 		 514 aa  55.1  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.66979 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06470  hypothetical protein  21.54 
 
 		 469 aa  55.1  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.324894  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2243  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.85 
 
 		 455 aa  54.7  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0961  Outer membrane protein-like  28.5 
 
 		 491 aa  55.1  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0234127  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4640  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  24.31 
 
 		 481 aa  55.1  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.134009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1077  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.06 
 
 		 496 aa  55.1  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.512437  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2028  Outer membrane protein-like protein  22.83 
 
 		 617 aa  54.7  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.950233  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0690  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  26.93 
 
 		 474 aa  54.7  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0583  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25 
 
 		 477 aa  54.7  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.196176  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0802  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.66 
 
 		 453 aa  54.7  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3981  outer membrane efflux protein  25.32 
 
 		 493 aa  54.3  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1333  outer membrane efflux protein, putative  31.48 
 
 		 463 aa  53.9  0.000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0516  outer membrane efflux protein  27 
 
 		 413 aa  53.5  0.000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2692  outer membrane efflux protein  24.6 
 
 		 442 aa  53.5  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922433  normal  0.254416 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0682  Outer membrane protein-like  25.08 
 
 		 443 aa  52.8  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.111346  normal  0.263509 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0056  porin (omp) ABC transporter protein  26.5 
 
 		 460 aa  53.1  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3257  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25.45 
 
 		 462 aa  52.8  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.30122  normal  0.885594 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2568  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.03 
 
 		 464 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1096  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.45 
 
 		 494 aa  52.8  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.739146 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1022  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.78 
 
 		 489 aa  53.1  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.15714  normal  0.470087 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4144  alkaline protease secretion protein AprF  25.34 
 
 		 477 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0485622  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1671  outer membrane efflux protein  19.63 
 
 		 461 aa  53.1  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0179  RND efflux transporter  25.25 
 
 		 472 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1099  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.73 
 
 		 460 aa  52  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0200  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.03 
 
 		 472 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.844152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1726  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  21.1 
 
 		 478 aa  52.8  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.33067  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1617  outer membrane efflux protein  23.3 
 
 		 467 aa  52.8  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1456  RND efflux system outer membrane lipoprotein  29.1 
 
 		 480 aa  52.4  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000857275 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0652  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.61 
 
 		 428 aa  52.4  0.00002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000458305  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1198  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  25.38 
 
 		 492 aa  52  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0210872  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3496  outer membrane efflux protein  27.21 
 
 		 565 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0204  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.25 
 
 		 472 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2436  hypothetical protein  26.27 
 
 		 520 aa  51.2  0.00004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3945  putative outer membrane protein tolC precursor  22.98 
 
 		 461 aa  51.2  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.8738  normal  0.222307 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2441  outer membrane efflux protein  23.6 
 
 		 453 aa  50.8  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3096  outer membrane efflux protein  33.01 
 
 		 497 aa  50.8  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0954  outer membrane efflux protein  22.87 
 
 		 463 aa  51.2  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1665  outer membrane efflux protein  26.59 
 
 		 464 aa  51.2  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>