73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl2852 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lpp2992  hypothetical protein  99.82 
 
 		 542 aa  1085    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2852  hypothetical protein  100 
 
 		 542 aa  1087    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2010  outer membrane efflux family protein  31.73 
 
 		 509 aa  219  8.999999999999998e-56  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0040  type I secretion outer membrane protein  31.17 
 
 		 507 aa  214  3.9999999999999995e-54  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.99479  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5198  outer efflux pump domain-containing protein  30.46 
 
 		 522 aa  176  7e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0545953 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3981  outer membrane efflux protein  31.37 
 
 		 493 aa  161  3e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3733  outer membrane efflux protein  30.7 
 
 		 488 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0894  outer membrane efflux protein  27.85 
 
 		 487 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5232  hypothetical protein  28.35 
 
 		 493 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4026  outer membrane efflux protein  28.57 
 
 		 486 aa  141  3e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60770  putative outer membrane protein  28.63 
 
 		 493 aa  140  7e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0749  outer membrane efflux protein  27.57 
 
 		 490 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2471  outer membrane efflux protein  26.95 
 
 		 481 aa  131  3e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4093  outer membrane efflux protein  26.67 
 
 		 514 aa  127  5e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.66979 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0025  outer membrane efflux protein  25.43 
 
 		 486 aa  105  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.245374  normal  0.08145 
 
 
-
 
NC_003296  RS03082  hypothetical protein  27.72 
 
 		 492 aa  99.8  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.208658  normal  0.984334 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1650  Outer membrane efflux protein  23.43 
 
 		 499 aa  81.3  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0374464  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1609  outer membrane efflux protein  22.01 
 
 		 499 aa  76.6  0.0000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.184768  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1126  outer membrane efflux protein  25.27 
 
 		 514 aa  71.2  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6409  outer membrane efflux protein  22.25 
 
 		 537 aa  69.7  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2027  outer membrane efflux protein  22.87 
 
 		 495 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000179084 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2551  outer membrane efflux protein  22.46 
 
 		 647 aa  65.1  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2200  outer membrane efflux protein  21.75 
 
 		 495 aa  64.7  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1445  outer membrane efflux protein  22.86 
 
 		 690 aa  62  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.757577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2562  outer membrane efflux protein  22.67 
 
 		 500 aa  61.6  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0520371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1195  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.59 
 
 		 482 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000171892  normal  0.38657 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1600  outer membrane efflux protein  21.94 
 
 		 499 aa  56.6  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.174043  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  21.62 
 
 		 441 aa  54.3  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2201  outer membrane efflux protein  23 
 
 		 587 aa  53.9  0.000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.854853  normal  0.28263 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3004  putative outer TolC membrane protein  24.51 
 
 		 469 aa  53.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.833992 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2126  hypothetical protein  20.85 
 
 		 508 aa  52.4  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1190  Outer membrane efflux protein  20.77 
 
 		 510 aa  52  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2221  outer membrane efflux protein  24.62 
 
 		 590 aa  50.8  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000846233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2035  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.38 
 
 		 486 aa  50.8  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.152355  normal  0.152355 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2020  outer membrane efflux protein  22.04 
 
 		 491 aa  50.8  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0936605  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1346  aromatic acid efflux system, outer membrane lipoprotein  26.15 
 
 		 514 aa  50.1  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.65009 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1907  Type I secretion outer membrane protein, TolC  22.8 
 
 		 472 aa  50.1  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0533  outer membrane efflux protein  21.09 
 
 		 762 aa  50.1  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0162  outer membrane efflux protein  22.25 
 
 		 433 aa  50.1  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3558  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.04 
 
 		 472 aa  50.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.445028  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1994  outer membrane efflux protein  24.71 
 
 		 495 aa  50.1  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.184092  normal  0.0261874 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3497  RND efflux system outer membrane lipoprotein  30.07 
 
 		 470 aa  48.9  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1941  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25 
 
 		 497 aa  49.7  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.211357  normal  0.0401761 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0615  Outer membrane protein-like  20.27 
 
 		 577 aa  48.5  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00243369  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0329  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.76 
 
 		 474 aa  48.5  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6465  RND efflux system outer membrane lipoprotein  29.08 
 
 		 475 aa  48.5  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0283455 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3444  RND efflux system outer membrane lipoprotein  22.73 
 
 		 495 aa  47.4  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.960604 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1359  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  27.88 
 
 		 462 aa  47.4  0.0007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1759  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  23.74 
 
 		 600 aa  47  0.0008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000901075  normal  0.0327712 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2781  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  25.64 
 
 		 604 aa  47  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.193053  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1851  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  24.16 
 
 		 474 aa  46.6  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.170655 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2365  outer membrane efflux protein  21.63 
 
 		 482 aa  46.2  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.316372 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5432  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.14 
 
 		 553 aa  46.2  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.199925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0962  outer membrane efflux protein  25.47 
 
 		 464 aa  45.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000066626  normal  0.118679 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1671  outer membrane efflux protein  27.97 
 
 		 461 aa  45.8  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0814  outer membrane efflux protein  22.77 
 
 		 460 aa  46.2  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  23.26 
 
 		 1496 aa  44.7  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3584  outer membrane protein oprM  32.11 
 
 		 468 aa  44.7  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05030  outer membrane efflux protein  22.88 
 
 		 471 aa  44.7  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.691581  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3442  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  28.27 
 
 		 496 aa  45.1  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.811835  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3717  RND efflux system outer membrane lipoprotein  32.11 
 
 		 468 aa  44.7  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1941  outer membrane efflux protein  23.94 
 
 		 432 aa  44.7  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4897  outer membrane efflux protein  29.46 
 
 		 437 aa  44.7  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0861249  normal  0.15922 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3590  RND efflux system outer membrane lipoprotein NodT  28.8 
 
 		 491 aa  44.3  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2023  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  21.34 
 
 		 514 aa  44.3  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1450  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  23.95 
 
 		 471 aa  44.3  0.006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0364  outer membrane channel protein  19.48 
 
 		 500 aa  43.5  0.009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0708  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  22.19 
 
 		 483 aa  43.5  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00245457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5601  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  26.24 
 
 		 475 aa  43.5  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5965  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.24 
 
 		 475 aa  43.5  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.037067 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0283  outer membrane efflux protein  26.71 
 
 		 439 aa  43.5  0.009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4008  outer membrane protein oprM  31.65 
 
 		 468 aa  43.5  0.009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2026  RND efflux system outer membrane lipoprotein NodT  23.35 
 
 		 519 aa  43.5  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.192262 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>