105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_3981 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_4026  outer membrane efflux protein  71.67 
 
 		 486 aa  651    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3981  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 493 aa  986    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3733  outer membrane efflux protein  79.75 
 
 		 488 aa  747    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5232  hypothetical protein  63.09 
 
 		 493 aa  550  1e-155  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60770  putative outer membrane protein  62.45 
 
 		 493 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0894  outer membrane efflux protein  59.06 
 
 		 487 aa  535  1e-151  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5198  outer efflux pump domain-containing protein  46.76 
 
 		 522 aa  376  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0545953 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4093  outer membrane efflux protein  43.72 
 
 		 514 aa  330  4e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.66979 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2471  outer membrane efflux protein  40.13 
 
 		 481 aa  325  2e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0749  outer membrane efflux protein  38.18 
 
 		 490 aa  291  2e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2852  hypothetical protein  31.37 
 
 		 542 aa  172  9e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2992  hypothetical protein  31.37 
 
 		 542 aa  172  1e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0040  type I secretion outer membrane protein  26.02 
 
 		 507 aa  152  8.999999999999999e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.99479  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2010  outer membrane efflux family protein  25.81 
 
 		 509 aa  150  6e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2027  outer membrane efflux protein  27.22 
 
 		 495 aa  131  3e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000179084 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2200  outer membrane efflux protein  26.01 
 
 		 495 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1600  outer membrane efflux protein  25.75 
 
 		 499 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.174043  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03082  hypothetical protein  28.61 
 
 		 492 aa  101  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.208658  normal  0.984334 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2562  outer membrane efflux protein  28.02 
 
 		 500 aa  101  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0520371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1126  outer membrane efflux protein  22.55 
 
 		 514 aa  99  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2020  outer membrane efflux protein  24.15 
 
 		 491 aa  97.1  6e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0936605  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1650  Outer membrane efflux protein  23.31 
 
 		 499 aa  94.7  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0374464  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1609  outer membrane efflux protein  23.23 
 
 		 499 aa  94  6e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.184768  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0025  outer membrane efflux protein  26.5 
 
 		 486 aa  93.2  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.245374  normal  0.08145 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0373  outer membrane efflux protein  25 
 
 		 662 aa  87  7e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.540248 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1445  outer membrane efflux protein  23.12 
 
 		 690 aa  81.3  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.757577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2551  outer membrane efflux protein  24.46 
 
 		 647 aa  76.3  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2126  hypothetical protein  23.73 
 
 		 508 aa  72.4  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0651  outer membrane efflux protein  25.1 
 
 		 524 aa  72  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.703393  normal  0.0209094 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0615  Outer membrane protein-like  21.53 
 
 		 577 aa  70.9  0.00000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00243369  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0533  outer membrane efflux protein  21.49 
 
 		 762 aa  70.9  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3737  outer membrane efflux protein  23.89 
 
 		 437 aa  67.8  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.315415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6409  outer membrane efflux protein  24.14 
 
 		 537 aa  66.2  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1641  Outer membrane efflux protein  29.35 
 
 		 479 aa  65.5  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1733  outer membrane efflux protein  24.69 
 
 		 559 aa  62.8  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0627  outer membrane efflux protein, putative  23.7 
 
 		 470 aa  62.4  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.173588  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1351  outer membrane efflux protein  24.79 
 
 		 528 aa  58.9  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.225814  normal  0.0380363 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1941  outer membrane efflux protein  23.88 
 
 		 432 aa  58.9  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2201  outer membrane efflux protein  23.42 
 
 		 587 aa  57.4  0.0000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.854853  normal  0.28263 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0384  outer membrane efflux protein  22.26 
 
 		 444 aa  57  0.0000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.895564  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1617  outer membrane efflux protein  22.05 
 
 		 467 aa  56.6  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1761  hypothetical protein  24.67 
 
 		 576 aa  56.6  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3644  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  26.43 
 
 		 489 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.44786  normal  0.0343549 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0833  outer membrane efflux protein  22.38 
 
 		 496 aa  54.7  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2243  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.81 
 
 		 455 aa  53.9  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1875  outer membrane efflux protein  24.69 
 
 		 506 aa  53.9  0.000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2441  outer membrane efflux protein  21.4 
 
 		 453 aa  52.8  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0954  outer membrane efflux protein  21.91 
 
 		 463 aa  52  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05030  outer membrane efflux protein  24.26 
 
 		 471 aa  52.4  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.691581  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0066  outer membrane efflux protein  24.84 
 
 		 436 aa  52.4  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01890  outer membrane drug efflux lipoprotein  22.3 
 
 		 491 aa  51.6  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0642226  normal  0.753424 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1884  outer membrane efflux protein  20.67 
 
 		 483 aa  51.6  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0544  outer membrane channel protein  23.06 
 
 		 448 aa  50.8  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000576987  normal  0.601769 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1919  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  25.07 
 
 		 482 aa  50.8  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.328582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0549  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  23.97 
 
 		 501 aa  50.8  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.569542  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1190  Outer membrane efflux protein  19.34 
 
 		 510 aa  50.1  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0733  outer membrane efflux protein, putative  22.2 
 
 		 463 aa  49.7  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0388  RND efflux system, outer membrane lipoprotein CmeC  23.82 
 
 		 492 aa  49.7  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4195  outer membrane channel protein  24.13 
 
 		 443 aa  49.7  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000611538  hitchhiker  0.000431125 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1143  outer membrane efflux protein  22.62 
 
 		 455 aa  49.7  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0286987  normal  0.128527 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0414  RND efflux system, outer membrane lipoprotein CmeC  23.82 
 
 		 492 aa  48.9  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0945  outer membrane efflux family protein  25.7 
 
 		 456 aa  49.3  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.681331  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0283  outer membrane efflux protein  23.88 
 
 		 439 aa  48.9  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0881  outer membrane efflux protein  23.24 
 
 		 535 aa  48.5  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.705042  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0938  outer membrane efflux family protein  25.7 
 
 		 452 aa  48.5  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2072  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  24.42 
 
 		 495 aa  48.5  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0610186  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0516  outer membrane efflux protein  24.33 
 
 		 413 aa  47.8  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1450  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  25 
 
 		 471 aa  47.8  0.0005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0802  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.33 
 
 		 453 aa  47.8  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3578  outer membrane channel protein  23.15 
 
 		 435 aa  47.8  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000408694  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0781  outer membrane channel protein  23.15 
 
 		 435 aa  47.8  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000184345  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0813  outer membrane channel protein  23.15 
 
 		 435 aa  47.8  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000621601  normal  0.257824 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3997  Outer membrane protein-like protein  22.86 
 
 		 486 aa  47.4  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000837564 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2137  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  23.04 
 
 		 437 aa  47.4  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3362  outer membrane efflux protein  23.71 
 
 		 431 aa  47.4  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2148  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.32 
 
 		 497 aa  47.4  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.400858  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0323  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  23.97 
 
 		 496 aa  47.4  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.501802  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0364  outer membrane channel protein  22.25 
 
 		 500 aa  47.4  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01970  outer membrane efflux protein, putative  21.02 
 
 		 456 aa  47  0.0007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.154405  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3398  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  23.61 
 
 		 434 aa  47  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2639  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.51 
 
 		 461 aa  47  0.0008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2529  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.29 
 
 		 485 aa  47  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.918806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0516  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  24.38 
 
 		 500 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0482869  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2145  outer membrane efflux protein  25.65 
 
 		 472 aa  46.2  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0192834 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0545  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  23.93 
 
 		 470 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2866  outer membrane efflux protein  25.93 
 
 		 480 aa  46.6  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0685652 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3627  outer membrane efflux protein  22.48 
 
 		 461 aa  45.8  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.433273  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2647  outer membrane efflux protein  20.19 
 
 		 445 aa  45.4  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.910769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1041  type I secretion outer membrane efflux protein  26.08 
 
 		 451 aa  45.4  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0806  outer membrane channel protein  22.83 
 
 		 435 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000113836  hitchhiker  0.0000000000882186 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3360  type I secretion outer membrane protein, TolC family protein  23.44 
 
 		 444 aa  45.1  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.21716  normal  0.12144 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0768  outer membrane channel protein  22.37 
 
 		 435 aa  45.4  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000309945  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2365  outer membrane efflux protein  22.43 
 
 		 482 aa  45.1  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.316372 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0872  Outer membrane protein-like  22.32 
 
 		 517 aa  44.7  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0828  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  23.81 
 
 		 428 aa  44.3  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.885444  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2098  outer membrane efflux protein  27.06 
 
 		 421 aa  44.3  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2385  outer membrane efflux protein  27.06 
 
 		 421 aa  44.3  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00190513  normal  0.103604 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0258  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  24.44 
 
 		 517 aa  44.3  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.389882  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0662  outer membrane efflux protein  20.63 
 
 		 483 aa  44.3  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3429  outer membrane efflux protein  21.57 
 
 		 442 aa  43.9  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.437271  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>