101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1190 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_1190  Outer membrane efflux protein  100 
 
 
510 aa  1053    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0533  outer membrane efflux protein  66.17 
 
 
762 aa  644    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1650  Outer membrane efflux protein  35.13 
 
 
499 aa  283  8.000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0374464  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1609  outer membrane efflux protein  35.76 
 
 
499 aa  280  6e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.184768  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2027  outer membrane efflux protein  35.39 
 
 
495 aa  277  3e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000179084 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2200  outer membrane efflux protein  34.85 
 
 
495 aa  271  2e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1126  outer membrane efflux protein  33.62 
 
 
514 aa  263  6.999999999999999e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1600  outer membrane efflux protein  33.12 
 
 
499 aa  241  2e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.174043  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2020  outer membrane efflux protein  32.98 
 
 
491 aa  232  1e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0936605  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2126  hypothetical protein  25.59 
 
 
508 aa  147  5e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0025  outer membrane efflux protein  25.11 
 
 
486 aa  98.6  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.245374  normal  0.08145 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2201  outer membrane efflux protein  25.05 
 
 
587 aa  92.8  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.854853  normal  0.28263 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0749  outer membrane efflux protein  23.88 
 
 
490 aa  90.1  8e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1351  outer membrane efflux protein  24.79 
 
 
528 aa  88.2  3e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.225814  normal  0.0380363 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2562  outer membrane efflux protein  24.04 
 
 
500 aa  87  8e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0520371  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0615  Outer membrane protein-like  22.67 
 
 
577 aa  82.4  0.00000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00243369  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5198  outer efflux pump domain-containing protein  23.63 
 
 
522 aa  79.7  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0545953 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2551  outer membrane efflux protein  23.98 
 
 
647 aa  79.3  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1875  outer membrane efflux protein  24.01 
 
 
506 aa  71.6  0.00000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2221  outer membrane efflux protein  21.3 
 
 
590 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000846233  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60770  putative outer membrane protein  21.63 
 
 
493 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5432  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.85 
 
 
553 aa  66.2  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.199925  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3733  outer membrane efflux protein  22.49 
 
 
488 aa  66.2  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5239  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.72 
 
 
488 aa  64.7  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2992  hypothetical protein  21.77 
 
 
542 aa  63.9  0.000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2852  hypothetical protein  21.77 
 
 
542 aa  63.5  0.000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5232  hypothetical protein  20.91 
 
 
493 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0651  outer membrane efflux protein  23.88 
 
 
524 aa  62.4  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.703393  normal  0.0209094 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1725  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.82 
 
 
489 aa  62  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.736299  normal  0.0102072 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6409  outer membrane efflux protein  21.79 
 
 
537 aa  62  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1733  outer membrane efflux protein  22.83 
 
 
559 aa  60.8  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0373  outer membrane efflux protein  21.08 
 
 
662 aa  60.5  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.540248 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2577  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.08 
 
 
522 aa  59.7  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00589159 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1445  outer membrane efflux protein  21.93 
 
 
690 aa  58.9  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.757577  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4093  outer membrane efflux protein  23.13 
 
 
514 aa  58.5  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.66979 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0872  Outer membrane protein-like  23.4 
 
 
517 aa  58.2  0.0000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1826  Type I secretion outer membrane protein, TolC  22.64 
 
 
487 aa  56.2  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2851  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.78 
 
 
463 aa  56.6  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6495  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.16 
 
 
518 aa  56.6  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1054  outer membrane efflux protein  24.74 
 
 
514 aa  55.5  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000452487  normal  0.217723 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4696  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.88 
 
 
497 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5161  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.88 
 
 
488 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.451764  normal  0.264948 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2568  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.43 
 
 
464 aa  55.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3945  putative outer membrane protein tolC precursor  23.1 
 
 
461 aa  55.5  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.8738  normal  0.222307 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0066  outer membrane efflux protein  23.81 
 
 
443 aa  55.1  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1453  type I secretion outer membrane protein, TolC family  22.9 
 
 
480 aa  55.1  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1690  type I secretion outer membrane protein, TolC family  22.61 
 
 
478 aa  55.1  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.522729 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3484  Outer membrane protein-like protein  21.84 
 
 
1139 aa  55.1  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1434  type I secretion outer membrane protein, TolC  22.64 
 
 
490 aa  54.7  0.000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.44207  normal  0.675589 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0364  outer membrane channel protein  21.75 
 
 
500 aa  54.7  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0278  outer membrane efflux protein  25.3 
 
 
441 aa  54.7  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000626538  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  22.84 
 
 
441 aa  54.3  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4235  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.22 
 
 
463 aa  54.3  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.902691  normal  0.529157 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2010  outer membrane efflux family protein  23.65 
 
 
509 aa  54.3  0.000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1761  hypothetical protein  24.89 
 
 
576 aa  52  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3645  outer membrane efflux protein  25 
 
 
514 aa  52.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.784148  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4722  outer membrane efflux protein  25 
 
 
514 aa  52.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0674524  decreased coverage  0.00195148 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0954  outer membrane efflux protein  22.9 
 
 
463 aa  52  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2818  TolC family type I secretion outer membrane protein  25 
 
 
469 aa  52.4  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.282777  normal  0.979363 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0040  type I secretion outer membrane protein  23.8 
 
 
507 aa  52.4  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.99479  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5578  outer membrane efflux protein  25 
 
 
514 aa  52.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0232692  hitchhiker  0.00628536 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3973  outer membrane efflux protein  24.5 
 
 
513 aa  50.8  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0704049 
 
 
-
 
NC_004310  BR0945  outer membrane efflux family protein  23.1 
 
 
456 aa  50.1  0.00009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.681331  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  21.12 
 
 
419 aa  50.1  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2805  outer membrane efflux protein  29.77 
 
 
685 aa  50.1  0.00009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.977623  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2893  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.82 
 
 
516 aa  50.1  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0160  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  21.65 
 
 
566 aa  49.3  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.213741  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0289  outer membrane protein OmpK  21.18 
 
 
474 aa  47.8  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2583  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.51 
 
 
497 aa  47.8  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.655757 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0938  outer membrane efflux family protein  22.82 
 
 
452 aa  48.1  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3981  outer membrane efflux protein  19.78 
 
 
493 aa  48.1  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03082  hypothetical protein  22.87 
 
 
492 aa  47.8  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.208658  normal  0.984334 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3298  outer membrane efflux protein  21.49 
 
 
418 aa  47.4  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000531453  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4162  outer membrane efflux protein  18.36 
 
 
443 aa  47  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000533026  normal  0.288124 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3453  putative tolC outer membrane protein  24.46 
 
 
438 aa  46.6  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.341393 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1941  outer membrane efflux protein  18.75 
 
 
432 aa  46.6  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1165  Outer membrane efflux protein  24.89 
 
 
462 aa  45.8  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3623  Outer membrane efflux protein  22.37 
 
 
415 aa  45.8  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2894  Type I secretion outer membrane protein, TolC  21.7 
 
 
460 aa  45.8  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386257  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0309  outer membrane efflux protein  24.57 
 
 
458 aa  45.8  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.729969 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2259  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.2 
 
 
508 aa  45.8  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.324035  normal  0.22709 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0574  outer membrane efflux protein  23.05 
 
 
427 aa  45.8  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000581742  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2338  efflux ABC transporter outer membrane protein  23.73 
 
 
470 aa  45.1  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1875  type I secretion outer membrane protein, TolC family  20.27 
 
 
476 aa  45.1  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1878  type I secretion outer membrane protein, TolC family  21.79 
 
 
475 aa  45.4  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.660542  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1384  outer membrane efflux protein  23.45 
 
 
435 aa  45.1  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.642492  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02379  hypothetical protein  22.46 
 
 
436 aa  44.7  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4150  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  23.78 
 
 
472 aa  44.3  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1380  outer membrane efflux protein  19.23 
 
 
425 aa  44.3  0.005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0122  LipD protein, putative  21.62 
 
 
413 aa  43.9  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2883  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.82 
 
 
442 aa  44.3  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00170075  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5878  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.99 
 
 
463 aa  43.9  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.539647  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0837  outer membrane efflux protein  20.77 
 
 
462 aa  43.9  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0057  outer membrane protein, putative  22.74 
 
 
470 aa  43.9  0.007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1641  Outer membrane efflux protein  24.34 
 
 
479 aa  43.9  0.007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4358  RND efflux system outer membrane lipoprotein  22.4 
 
 
482 aa  43.9  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4512  outer membrane efflux protein  24.87 
 
 
520 aa  43.9  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0572559 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0162  outer membrane efflux protein  22.27 
 
 
433 aa  43.5  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2662  outer membrane efflux protein  22.64 
 
 
445 aa  43.5  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0733  outer membrane efflux protein, putative  20.84 
 
 
463 aa  43.5  0.01  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>