265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0025 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0025  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 486 aa  972    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.245374  normal  0.08145 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2562  outer membrane efflux protein  27.91 
 
 		 500 aa  148  2.0000000000000003e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0520371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2126  hypothetical protein  26.55 
 
 		 508 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1609  outer membrane efflux protein  24.65 
 
 		 499 aa  129  8.000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.184768  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2027  outer membrane efflux protein  26.62 
 
 		 495 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000179084 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0615  Outer membrane protein-like  27.68 
 
 		 577 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00243369  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2200  outer membrane efflux protein  26 
 
 		 495 aa  125  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1445  outer membrane efflux protein  24.5 
 
 		 690 aa  123  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.757577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0749  outer membrane efflux protein  26.84 
 
 		 490 aa  121  3e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1650  Outer membrane efflux protein  24.32 
 
 		 499 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0374464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1126  outer membrane efflux protein  24.55 
 
 		 514 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1600  outer membrane efflux protein  24.9 
 
 		 499 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.174043  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0373  outer membrane efflux protein  25.95 
 
 		 662 aa  112  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.540248 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4093  outer membrane efflux protein  26.64 
 
 		 514 aa  109  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.66979 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2992  hypothetical protein  25.43 
 
 		 542 aa  108  2e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2852  hypothetical protein  25.43 
 
 		 542 aa  108  2e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0040  type I secretion outer membrane protein  24.68 
 
 		 507 aa  108  3e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.99479  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2010  outer membrane efflux family protein  24.15 
 
 		 509 aa  107  4e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2551  outer membrane efflux protein  25.54 
 
 		 647 aa  105  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3733  outer membrane efflux protein  27.27 
 
 		 488 aa  106  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2020  outer membrane efflux protein  24.07 
 
 		 491 aa  101  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0936605  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1190  Outer membrane efflux protein  25.71 
 
 		 510 aa  100  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5198  outer efflux pump domain-containing protein  25.52 
 
 		 522 aa  99  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0545953 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4026  outer membrane efflux protein  26.61 
 
 		 486 aa  97.8  4e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3981  outer membrane efflux protein  26.18 
 
 		 493 aa  96.7  8e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0533  outer membrane efflux protein  26.36 
 
 		 762 aa  94.7  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60770  putative outer membrane protein  25.21 
 
 		 493 aa  90.5  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1733  outer membrane efflux protein  24.74 
 
 		 559 aa  87  7e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2201  outer membrane efflux protein  24.75 
 
 		 587 aa  85.5  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.854853  normal  0.28263 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5232  hypothetical protein  25 
 
 		 493 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0651  outer membrane efflux protein  25.47 
 
 		 524 aa  85.1  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.703393  normal  0.0209094 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2805  outer membrane efflux protein  24.9 
 
 		 685 aa  84  0.000000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.977623  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0162  outer membrane efflux protein  24.05 
 
 		 433 aa  83.2  0.000000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2471  outer membrane efflux protein  23.61 
 
 		 481 aa  82.8  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1875  outer membrane efflux protein  26.54 
 
 		 506 aa  81.6  0.00000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1351  outer membrane efflux protein  26.69 
 
 		 528 aa  81.3  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.225814  normal  0.0380363 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1453  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.79 
 
 		 480 aa  74.7  0.000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1690  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.21 
 
 		 478 aa  74.3  0.000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.522729 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6409  outer membrane efflux protein  24.94 
 
 		 537 aa  71.2  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0627  outer membrane efflux protein, putative  22.99 
 
 		 470 aa  70.9  0.00000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.173588  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0733  outer membrane efflux protein, putative  22.78 
 
 		 463 aa  70.5  0.00000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0938  outer membrane efflux family protein  26.19 
 
 		 452 aa  70.5  0.00000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6495  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.4 
 
 		 518 aa  70.5  0.00000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0945  outer membrane efflux family protein  25.89 
 
 		 456 aa  68.9  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.681331  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4696  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.2 
 
 		 497 aa  68.9  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5161  type I secretion outer membrane protein, TolC family  26.2 
 
 		 488 aa  68.9  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.451764  normal  0.264948 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5432  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.39 
 
 		 553 aa  68.9  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.199925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5239  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.16 
 
 		 488 aa  68.9  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2851  type I secretion outer membrane protein, TolC family  26.12 
 
 		 463 aa  68.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0903  outer membrane efflux protein  23.99 
 
 		 436 aa  68.2  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.331424  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03082  hypothetical protein  28.02 
 
 		 492 aa  67.8  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.208658  normal  0.984334 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0814  outer membrane efflux protein  24.63 
 
 		 460 aa  67.4  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1617  outer membrane efflux protein  22.24 
 
 		 467 aa  67.4  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2577  Type I secretion outer membrane protein, TolC  26.22 
 
 		 522 aa  67.4  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00589159 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2026  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.88 
 
 		 405 aa  67  0.0000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.341805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1725  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.62 
 
 		 489 aa  67  0.0000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.736299  normal  0.0102072 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  25.16 
 
 		 441 aa  66.6  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1761  hypothetical protein  23.14 
 
 		 576 aa  65.5  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1665  outer membrane efflux protein  23.53 
 
 		 464 aa  65.9  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2243  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.27 
 
 		 455 aa  64.7  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1835  type I secretion outer membrane protein, TolC family  26.56 
 
 		 447 aa  64.3  0.000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.211257  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3945  putative outer membrane protein tolC precursor  25.19 
 
 		 461 aa  64.3  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.8738  normal  0.222307 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0954  outer membrane efflux protein  21.04 
 
 		 463 aa  63.9  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2894  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.25 
 
 		 460 aa  63.5  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0833  outer membrane efflux protein  23.55 
 
 		 496 aa  63.5  0.000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5878  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.16 
 
 		 463 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.539647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  23.46 
 
 		 1470 aa  63.2  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4306  outer membrane efflux protein  25.83 
 
 		 447 aa  62.4  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2568  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25.84 
 
 		 464 aa  62  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0652  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.61 
 
 		 428 aa  62  0.00000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000458305  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0498  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.31 
 
 		 494 aa  62.4  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2818  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.02 
 
 		 469 aa  61.2  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.282777  normal  0.979363 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01115  putative outer membrane transport/efflux protein  21.03 
 
 		 443 aa  62  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1569  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.29 
 
 		 461 aa  61.6  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.151598  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0881  outer membrane efflux protein  23.53 
 
 		 535 aa  61.2  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.705042  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2352  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.86 
 
 		 446 aa  61.2  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0943  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.49 
 
 		 481 aa  61.2  0.00000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.359214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003047  type I secretion TolC precursor  25.19 
 
 		 423 aa  61.2  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05030  outer membrane efflux protein  20.75 
 
 		 471 aa  60.8  0.00000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.691581  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1826  Type I secretion outer membrane protein, TolC  26.35 
 
 		 487 aa  60.1  0.00000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2262  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25.21 
 
 		 497 aa  60.1  0.00000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0148702  normal  0.873765 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4284  outer membrane efflux protein  25.96 
 
 		 447 aa  59.7  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2221  outer membrane efflux protein  23.14 
 
 		 590 aa  59.7  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000846233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1380  outer membrane efflux protein  19.77 
 
 		 425 aa  59.3  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1482  outer membrane efflux protein  22.99 
 
 		 471 aa  59.3  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.387043 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1641  Outer membrane efflux protein  27.18 
 
 		 479 aa  58.9  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4008  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.4 
 
 		 562 aa  58.9  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1633  outer membrane efflux protein  23.33 
 
 		 470 aa  58.9  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.788464  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0090  hypothetical protein  22.88 
 
 		 731 aa  58.2  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1990  outer membrane efflux protein  23.06 
 
 		 471 aa  58.5  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.154832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1434  type I secretion outer membrane protein, TolC  24.34 
 
 		 490 aa  57.4  0.0000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.44207  normal  0.675589 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  23.1 
 
 		 1496 aa  57  0.0000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0894  outer membrane efflux protein  22.9 
 
 		 487 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1041  type I secretion outer membrane efflux protein  24.32 
 
 		 451 aa  56.6  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0837  outer membrane efflux protein  22.97 
 
 		 462 aa  56.2  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02837  hypothetical protein  27.41 
 
 		 423 aa  56.2  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1598  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.81 
 
 		 459 aa  56.6  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.538573  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0066  outer membrane efflux protein  23.81 
 
 		 436 aa  55.5  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2127  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  23.78 
 
 		 513 aa  55.1  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3723  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.75 
 
 		 512 aa  54.7  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>