94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1445 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_1445  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 690 aa  1405    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.757577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0373  outer membrane efflux protein  47.54 
 
 		 662 aa  450  1e-125  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.540248 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2551  outer membrane efflux protein  35.92 
 
 		 647 aa  323  6e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1650  Outer membrane efflux protein  25.99 
 
 		 499 aa  127  6e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0374464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1126  outer membrane efflux protein  26.04 
 
 		 514 aa  125  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2027  outer membrane efflux protein  25.44 
 
 		 495 aa  123  9e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000179084 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2200  outer membrane efflux protein  24.83 
 
 		 495 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1609  outer membrane efflux protein  25.87 
 
 		 499 aa  120  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.184768  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0025  outer membrane efflux protein  24.12 
 
 		 486 aa  115  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.245374  normal  0.08145 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1733  outer membrane efflux protein  23.8 
 
 		 559 aa  110  8.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1351  outer membrane efflux protein  25.62 
 
 		 528 aa  108  3e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.225814  normal  0.0380363 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1600  outer membrane efflux protein  22.74 
 
 		 499 aa  106  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.174043  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2126  hypothetical protein  21.88 
 
 		 508 aa  100  7e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2020  outer membrane efflux protein  22.91 
 
 		 491 aa  97.4  8e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0936605  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2562  outer membrane efflux protein  24.8 
 
 		 500 aa  95.1  4e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0520371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1875  outer membrane efflux protein  24.44 
 
 		 506 aa  90.9  8e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0651  outer membrane efflux protein  24.93 
 
 		 524 aa  89.7  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.703393  normal  0.0209094 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2221  outer membrane efflux protein  26.21 
 
 		 590 aa  79.3  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000846233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2010  outer membrane efflux family protein  25.96 
 
 		 509 aa  77.8  0.0000000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3981  outer membrane efflux protein  23.12 
 
 		 493 aa  77.4  0.0000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4093  outer membrane efflux protein  22.54 
 
 		 514 aa  75.9  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.66979 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60770  putative outer membrane protein  22.36 
 
 		 493 aa  74.3  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3733  outer membrane efflux protein  23.58 
 
 		 488 aa  73.6  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0615  Outer membrane protein-like  22.51 
 
 		 577 aa  73.6  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00243369  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0040  type I secretion outer membrane protein  25.34 
 
 		 507 aa  73.9  0.00000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.99479  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0749  outer membrane efflux protein  21.87 
 
 		 490 aa  72.4  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0533  outer membrane efflux protein  20.26 
 
 		 762 aa  69.3  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5232  hypothetical protein  22.94 
 
 		 493 aa  68.9  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4026  outer membrane efflux protein  23.75 
 
 		 486 aa  67.4  0.0000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0066  outer membrane efflux protein  26.71 
 
 		 436 aa  65.9  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2992  hypothetical protein  23.57 
 
 		 542 aa  65.5  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2852  hypothetical protein  23.57 
 
 		 542 aa  65.1  0.000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2471  outer membrane efflux protein  21.8 
 
 		 481 aa  64.7  0.000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0090  hypothetical protein  23.65 
 
 		 731 aa  64.7  0.000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2441  outer membrane efflux protein  23.8 
 
 		 453 aa  63.5  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1671  outer membrane efflux protein  23.66 
 
 		 461 aa  62.8  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4505  outer membrane efflux protein  23.54 
 
 		 972 aa  61.2  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.300614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6409  outer membrane efflux protein  20.63 
 
 		 537 aa  60.1  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3626  outer membrane efflux protein  23.63 
 
 		 627 aa  58.2  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0887926  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3343  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.78 
 
 		 452 aa  57.8  0.0000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3004  putative outer TolC membrane protein  23.61 
 
 		 469 aa  57.4  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.833992 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2805  outer membrane efflux protein  22.16 
 
 		 685 aa  57.4  0.0000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.977623  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0954  outer membrane efflux protein  21.93 
 
 		 463 aa  56.6  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1190  Outer membrane efflux protein  22.9 
 
 		 510 aa  55.1  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2818  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.67 
 
 		 469 aa  54.3  0.000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.282777  normal  0.979363 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3959  Outer membrane protein-like protein  21.84 
 
 		 472 aa  53.5  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1126  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.09 
 
 		 450 aa  53.5  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0652  TolC family type I secretion outer membrane protein  25 
 
 		 428 aa  52  0.00003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000458305  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1738  putative outer membrane protein TolC  23.12 
 
 		 521 aa  51.6  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1822  putative outer membrane protein TolC  23.12 
 
 		 476 aa  50.4  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1064  outer membrane efflux protein  22.44 
 
 		 443 aa  50.8  0.00009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0269  putative outer membrane protein TolC  23.12 
 
 		 476 aa  50.4  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0165015  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0370  putative outer membrane protein TolC  23.12 
 
 		 446 aa  50.1  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00192444  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1327  putative outer membrane protein TolC  23.12 
 
 		 446 aa  50.1  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.345184  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0894  outer membrane efflux protein  23.61 
 
 		 487 aa  50.4  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3723  type I secretion outer membrane protein, TolC family  21.36 
 
 		 512 aa  50.4  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0605  outer membrane efflux protein  23.15 
 
 		 470 aa  50.4  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0997  putative outer membrane protein TolC  23.12 
 
 		 476 aa  50.4  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.471122  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0364  outer membrane channel protein  25 
 
 		 500 aa  50.1  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1835  type I secretion outer membrane protein, TolC family  22.3 
 
 		 447 aa  50.1  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.211257  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0296  outer membrane protein TolC, putative  23.12 
 
 		 476 aa  50.4  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.618695  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0881  outer membrane efflux protein  20.75 
 
 		 535 aa  49.3  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.705042  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2028  Outer membrane protein-like protein  21.24 
 
 		 617 aa  49.7  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.950233  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02621  outer membrane protein required for AvrXa21 activity C (raxC)  24.32 
 
 		 443 aa  48.9  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1761  hypothetical protein  22.01 
 
 		 576 aa  48.9  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4142  outer membrane efflux protein  22.73 
 
 		 497 aa  48.5  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.958426  hitchhiker  0.00365026 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5330  outer membrane efflux protein  23.73 
 
 		 429 aa  48.5  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.757466 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3219  outer membrane efflux protein  27.54 
 
 		 440 aa  48.1  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3304  outer membrane efflux protein  27.54 
 
 		 440 aa  48.1  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.85963  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1203  outer membrane efflux protein  24.14 
 
 		 497 aa  48.1  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1135  outer membrane protein TolC, putative  22.58 
 
 		 480 aa  48.5  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.196284  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0814  outer membrane efflux protein  21.71 
 
 		 460 aa  47.8  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0837  outer membrane efflux protein  20.6 
 
 		 462 aa  47.8  0.0007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1591  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  28.65 
 
 		 481 aa  47.4  0.0008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000292967 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1021  outer membrane efflux protein  23.36 
 
 		 528 aa  47.4  0.0009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2026  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.15 
 
 		 405 aa  47.4  0.0009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.341805  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01590  putative outer membrane protein TolC  25.39 
 
 		 451 aa  46.6  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.29548  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4447  outer membrane efflux protein  25.98 
 
 		 459 aa  47  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1296  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  23.68 
 
 		 479 aa  47  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3558  Type I secretion outer membrane protein, TolC  26.03 
 
 		 472 aa  46.6  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.445028  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1600  RND efflux system outer membrane lipoprotein  22.73 
 
 		 483 aa  46.2  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.375157 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3116  outer membrane efflux protein  23.55 
 
 		 465 aa  46.2  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000967263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2659  outer membrane efflux protein  21.11 
 
 		 436 aa  46.2  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4769  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.47 
 
 		 485 aa  45.4  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.482827  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1522  RND efflux system outer membrane lipoprotein  22.81 
 
 		 485 aa  45.4  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2013  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.38 
 
 		 472 aa  45.4  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.226354  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2831  putative outer membrane protein  19.87 
 
 		 483 aa  45.4  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000620867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3563  outer membrane channel protein  24.16 
 
 		 434 aa  45.1  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000135514  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  20.68 
 
 		 441 aa  45.4  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2262  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.1 
 
 		 497 aa  44.7  0.006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0148702  normal  0.873765 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1545  RND efflux system outer membrane lipoprotein  22.81 
 
 		 485 aa  44.3  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.355658 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3904  outer membrane channel protein  23.84 
 
 		 435 aa  44.3  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1041  type I secretion outer membrane efflux protein  22.68 
 
 		 451 aa  44.3  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3004  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.15 
 
 		 464 aa  43.9  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.599739 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>