76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_4026 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_4026  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 486 aa  965    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3981  outer membrane efflux protein  71.67 
 
 		 493 aa  663    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3733  outer membrane efflux protein  70.25 
 
 		 488 aa  654    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5232  hypothetical protein  61.32 
 
 		 493 aa  529  1e-149  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0894  outer membrane efflux protein  58.18 
 
 		 487 aa  526  1e-148  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60770  putative outer membrane protein  60.9 
 
 		 493 aa  521  1e-147  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4093  outer membrane efflux protein  46.25 
 
 		 514 aa  340  4e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.66979 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5198  outer efflux pump domain-containing protein  40.28 
 
 		 522 aa  335  1e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0545953 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2471  outer membrane efflux protein  41.24 
 
 		 481 aa  330  4e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0749  outer membrane efflux protein  34.92 
 
 		 490 aa  259  6e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0040  type I secretion outer membrane protein  27.1 
 
 		 507 aa  157  4e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.99479  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2852  hypothetical protein  28.57 
 
 		 542 aa  156  9e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2992  hypothetical protein  28.57 
 
 		 542 aa  156  1e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2010  outer membrane efflux family protein  27.14 
 
 		 509 aa  155  2e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2200  outer membrane efflux protein  23.39 
 
 		 495 aa  98.2  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1126  outer membrane efflux protein  22.91 
 
 		 514 aa  97.1  6e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0025  outer membrane efflux protein  26.65 
 
 		 486 aa  96.3  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.245374  normal  0.08145 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2027  outer membrane efflux protein  22.83 
 
 		 495 aa  95.5  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000179084 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2020  outer membrane efflux protein  24.89 
 
 		 491 aa  93.2  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0936605  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2562  outer membrane efflux protein  27.47 
 
 		 500 aa  92  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0520371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1650  Outer membrane efflux protein  23.91 
 
 		 499 aa  89.4  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0374464  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1609  outer membrane efflux protein  23.41 
 
 		 499 aa  84  0.000000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.184768  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1600  outer membrane efflux protein  22.73 
 
 		 499 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.174043  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03082  hypothetical protein  25 
 
 		 492 aa  82  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.208658  normal  0.984334 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2126  hypothetical protein  23.54 
 
 		 508 aa  81.3  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2551  outer membrane efflux protein  24.6 
 
 		 647 aa  80.1  0.00000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0373  outer membrane efflux protein  23.78 
 
 		 662 aa  77.4  0.0000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.540248 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1445  outer membrane efflux protein  22.61 
 
 		 690 aa  74.7  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.757577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0533  outer membrane efflux protein  21.99 
 
 		 762 aa  70.5  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0615  Outer membrane protein-like  20.4 
 
 		 577 aa  68.2  0.0000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00243369  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6409  outer membrane efflux protein  25.33 
 
 		 537 aa  63.9  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1641  Outer membrane efflux protein  27.1 
 
 		 479 aa  62  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0733  outer membrane efflux protein, putative  21.99 
 
 		 463 aa  58.9  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01890  outer membrane drug efflux lipoprotein  23.92 
 
 		 491 aa  57  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0642226  normal  0.753424 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2941  outer membrane efflux protein  23.05 
 
 		 436 aa  54.7  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0140963  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2647  outer membrane efflux protein  20.79 
 
 		 445 aa  53.9  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.910769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1177  outer membrane efflux protein  19.44 
 
 		 427 aa  53.9  0.000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0283  outer membrane efflux protein  24.17 
 
 		 439 aa  52.8  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1041  type I secretion outer membrane efflux protein  25.96 
 
 		 451 aa  52.4  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4294  outer membrane efflux protein  24.2 
 
 		 448 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0190007  normal  0.396606 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2659  outer membrane efflux protein  23.1 
 
 		 436 aa  51.6  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0627  outer membrane efflux protein, putative  21.54 
 
 		 470 aa  51.6  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.173588  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2201  outer membrane efflux protein  21.91 
 
 		 587 aa  51.6  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.854853  normal  0.28263 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0954  outer membrane efflux protein  23.71 
 
 		 463 aa  51.6  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0863  outer membrane efflux protein  22.25 
 
 		 476 aa  50.4  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0409869  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1143  outer membrane efflux protein  22.44 
 
 		 455 aa  49.7  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0286987  normal  0.128527 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1351  outer membrane efflux protein  31.03 
 
 		 528 aa  50.1  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.225814  normal  0.0380363 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0544  outer membrane channel protein  22.91 
 
 		 448 aa  48.5  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000576987  normal  0.601769 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0725  outer membrane channel protein  23.96 
 
 		 435 aa  48.9  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000245313  hitchhiker  0.000963429 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0753  outer membrane channel protein  23.96 
 
 		 435 aa  48.9  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000555232  normal  0.0190145 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3236  outer membrane channel protein  23.96 
 
 		 435 aa  48.9  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000456355  hitchhiker  0.0000511139 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1384  outer membrane efflux protein  25.07 
 
 		 435 aa  48.5  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.642492  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1967  outer membrane efflux protein  22.88 
 
 		 443 aa  47.8  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000399706  normal  0.35271 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4169  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.99 
 
 		 470 aa  47.4  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6770  outer membrane efflux protein  25.96 
 
 		 488 aa  47  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1282  outer membrane efflux protein  23.15 
 
 		 446 aa  47  0.0008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0406152  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1946  outer membrane efflux protein  26.06 
 
 		 431 aa  47  0.0008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7078  putative outer membrane protein  24.19 
 
 		 491 aa  46.6  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0823525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0543  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25.16 
 
 		 479 aa  46.2  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.991736 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3644  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  24.33 
 
 		 489 aa  46.6  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.44786  normal  0.0343549 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2072  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  22.15 
 
 		 495 aa  46.6  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0610186  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0096  outer membrane efflux protein  22.3 
 
 		 441 aa  46.2  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5506  outer membrane efflux protein  21.23 
 
 		 451 aa  45.8  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.307266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0066  outer membrane efflux protein  24.73 
 
 		 436 aa  45.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2818  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.37 
 
 		 469 aa  45.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.282777  normal  0.979363 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1598  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.53 
 
 		 459 aa  45.1  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.538573  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0364  outer membrane channel protein  25.1 
 
 		 500 aa  45.4  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0323  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  21.66 
 
 		 496 aa  45.1  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.501802  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2441  outer membrane efflux protein  22.02 
 
 		 453 aa  45.1  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2553  outer membrane efflux protein  23.42 
 
 		 421 aa  44.3  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2686  Outer membrane secretion protein  24.17 
 
 		 472 aa  43.9  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.553025  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4977  outer membrane efflux protein TolC, putative  24.53 
 
 		 479 aa  43.9  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0538  outer membrane efflux protein  18.69 
 
 		 462 aa  43.9  0.007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  27 
 
 		 1496 aa  43.9  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1407  type I secretion outer membrane protein, TolC family  26.27 
 
 		 451 aa  43.5  0.008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1190  Outer membrane efflux protein  21.08 
 
 		 510 aa  43.5  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>