185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1351 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1351  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 528 aa  1021    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.225814  normal  0.0380363 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1733  outer membrane efflux protein  57.68 
 
 		 559 aa  503  1e-141  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0651  outer membrane efflux protein  47.27 
 
 		 524 aa  326  6e-88  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.703393  normal  0.0209094 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1875  outer membrane efflux protein  41.68 
 
 		 506 aa  276  7e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2200  outer membrane efflux protein  27.16 
 
 		 495 aa  123  7e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2027  outer membrane efflux protein  26.6 
 
 		 495 aa  117  6e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000179084 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2562  outer membrane efflux protein  27.38 
 
 		 500 aa  117  6.9999999999999995e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0520371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1445  outer membrane efflux protein  25.62 
 
 		 690 aa  109  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.757577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1600  outer membrane efflux protein  25.26 
 
 		 499 aa  103  6e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.174043  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1609  outer membrane efflux protein  26.39 
 
 		 499 aa  103  8e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.184768  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1650  Outer membrane efflux protein  25.73 
 
 		 499 aa  102  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0374464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2020  outer membrane efflux protein  25.95 
 
 		 491 aa  99.4  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0936605  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1126  outer membrane efflux protein  24.95 
 
 		 514 aa  98.6  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0373  outer membrane efflux protein  24.89 
 
 		 662 aa  89  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.540248 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2126  hypothetical protein  25.1 
 
 		 508 aa  87.8  4e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0533  outer membrane efflux protein  25.48 
 
 		 762 aa  87.4  6e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2221  outer membrane efflux protein  26.57 
 
 		 590 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000846233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1190  Outer membrane efflux protein  24.79 
 
 		 510 aa  84  0.000000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2551  outer membrane efflux protein  25.86 
 
 		 647 aa  83.6  0.000000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6409  outer membrane efflux protein  27 
 
 		 537 aa  80.9  0.00000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3126  outer membrane efflux protein  23.12 
 
 		 444 aa  80.1  0.00000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2441  outer membrane efflux protein  26.86 
 
 		 453 aa  77.4  0.0000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3801  outer membrane efflux protein  27.47 
 
 		 449 aa  75.9  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233057 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0025  outer membrane efflux protein  27.01 
 
 		 486 aa  73.9  0.000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.245374  normal  0.08145 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0749  outer membrane efflux protein  24.26 
 
 		 490 aa  72  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01115  putative outer membrane transport/efflux protein  26.23 
 
 		 443 aa  71.6  0.00000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1177  outer membrane efflux protein  20.93 
 
 		 427 aa  69.7  0.0000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0762  outer membrane efflux protein  27.11 
 
 		 446 aa  68.2  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0120  outer membrane efflux protein  22.27 
 
 		 448 aa  66.6  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000165447  hitchhiker  0.000000000000561163 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0162  outer membrane efflux protein  25.97 
 
 		 433 aa  65.9  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0881  outer membrane efflux protein  26.64 
 
 		 535 aa  64.7  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.705042  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0615  Outer membrane protein-like  23.37 
 
 		 577 aa  64.3  0.000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00243369  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3997  Outer membrane protein-like protein  23.17 
 
 		 486 aa  63.5  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000837564 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  27.01 
 
 		 1496 aa  63.5  0.000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0710  outer membrane protein-like protein  22.98 
 
 		 475 aa  63.2  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000000105718  normal  0.231109 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1345  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25.52 
 
 		 455 aa  62.8  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1482  outer membrane efflux protein  23.14 
 
 		 471 aa  63.2  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.387043 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0872  Outer membrane protein-like  26.51 
 
 		 517 aa  62  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0066  outer membrane efflux protein  27.13 
 
 		 436 aa  61.6  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0814  outer membrane efflux protein  26.94 
 
 		 460 aa  60.8  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3398  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  29 
 
 		 434 aa  60.8  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0544  outer membrane channel protein  24.18 
 
 		 448 aa  60.5  0.00000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000576987  normal  0.601769 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4447  outer membrane efflux protein  27.46 
 
 		 459 aa  59.7  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2028  Outer membrane protein-like protein  23.02 
 
 		 617 aa  59.7  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.950233  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0364  outer membrane channel protein  27.3 
 
 		 500 aa  58.9  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2534  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.06 
 
 		 468 aa  58.9  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0538  outer membrane efflux protein  27.08 
 
 		 432 aa  59.3  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.355565  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2201  outer membrane efflux protein  22.83 
 
 		 587 aa  58.9  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.854853  normal  0.28263 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  24.62 
 
 		 1470 aa  59.3  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60770  putative outer membrane protein  27.33 
 
 		 493 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3904  outer membrane channel protein  22.76 
 
 		 435 aa  58.2  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2352  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.07 
 
 		 446 aa  57.8  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3981  outer membrane efflux protein  29.41 
 
 		 493 aa  57.4  0.0000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5232  hypothetical protein  25.8 
 
 		 493 aa  57.4  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2457  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.18 
 
 		 449 aa  57.4  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3362  outer membrane efflux protein  38.75 
 
 		 431 aa  56.6  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2026  RND efflux system outer membrane lipoprotein NodT  28.66 
 
 		 519 aa  55.5  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.192262 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  23.55 
 
 		 419 aa  55.1  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00634  outer membrane component of multidrug efflux pump  22.45 
 
 		 476 aa  55.1  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.253495  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03690  outer membrane channel precursor protein  22.42 
 
 		 462 aa  54.7  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000344286  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3048  outer membrane channel protein  22.8 
 
 		 432 aa  54.3  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000973822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1941  outer membrane efflux protein  21.65 
 
 		 432 aa  54.3  0.000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0774  outer membrane channel protein  23.12 
 
 		 441 aa  54.3  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000983275  unclonable  0.000000000104798 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3578  outer membrane channel protein  21.79 
 
 		 435 aa  54.3  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000408694  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0768  outer membrane channel protein  22.58 
 
 		 435 aa  54.3  0.000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000309945  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0781  outer membrane channel protein  21.79 
 
 		 435 aa  54.3  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000184345  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0813  outer membrane channel protein  21.79 
 
 		 435 aa  54.3  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000621601  normal  0.257824 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1338  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.91 
 
 		 456 aa  53.9  0.000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0728783  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1475  outer membrane efflux protein  23.68 
 
 		 449 aa  53.9  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.236212  normal  0.298581 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0806  outer membrane channel protein  21.79 
 
 		 435 aa  53.9  0.000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000113836  hitchhiker  0.0000000000882186 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0725  outer membrane channel protein  22.44 
 
 		 435 aa  53.5  0.000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000245313  hitchhiker  0.000963429 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3563  outer membrane channel protein  22.42 
 
 		 434 aa  53.9  0.000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000135514  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3236  outer membrane channel protein  22.44 
 
 		 435 aa  53.5  0.000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000456355  hitchhiker  0.0000511139 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0753  outer membrane channel protein  22.44 
 
 		 435 aa  53.5  0.000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000555232  normal  0.0190145 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4162  outer membrane efflux protein  20.69 
 
 		 443 aa  53.5  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000533026  normal  0.288124 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2517  Outer membrane efflux protein  27.79 
 
 		 455 aa  53.5  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0940003  normal  0.677218 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  23.34 
 
 		 441 aa  53.1  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0961  Outer membrane protein-like  23.68 
 
 		 491 aa  53.1  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0234127  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2471  outer membrane efflux protein  23.29 
 
 		 481 aa  53.1  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4195  outer membrane channel protein  21.88 
 
 		 443 aa  52.4  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000611538  hitchhiker  0.000431125 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2154  outer membrane protein CyaE, putative  25.94 
 
 		 453 aa  52.4  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0943  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.02 
 
 		 481 aa  52  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.359214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0549  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  25.38 
 
 		 501 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.569542  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2148  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.32 
 
 		 497 aa  52.4  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.400858  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0627  outer membrane efflux protein, putative  25.08 
 
 		 470 aa  51.2  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.173588  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2831  putative outer membrane protein  21.69 
 
 		 483 aa  51.2  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000620867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5330  outer membrane efflux protein  20.94 
 
 		 429 aa  50.8  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.757466 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3225  outer membrane channel protein  21.81 
 
 		 432 aa  50.4  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000929322  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2692  outer membrane efflux protein  25 
 
 		 469 aa  50.4  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3330  outer membrane channel protein  22.1 
 
 		 493 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0733  outer membrane efflux protein, putative  22.92 
 
 		 463 aa  49.7  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05030  outer membrane efflux protein  21.97 
 
 		 471 aa  49.7  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.691581  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1403  Outer membrane protein-like protein  24.41 
 
 		 506 aa  49.7  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.438484 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4026  outer membrane efflux protein  31.03 
 
 		 486 aa  50.1  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1723  outer membrane efflux protein  22.16 
 
 		 436 aa  48.9  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0105  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  26.97 
 
 		 457 aa  48.9  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.265235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1761  hypothetical protein  23.91 
 
 		 576 aa  49.3  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2035  RND efflux system outer membrane lipoprotein  29.08 
 
 		 486 aa  48.9  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.152355  normal  0.152355 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06470  hypothetical protein  19.5 
 
 		 469 aa  48.9  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.324894  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1203  outer membrane efflux protein  26.34 
 
 		 497 aa  48.9  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>