More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1380 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1380  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 425 aa  843    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0849  outer membrane efflux protein  27.34 
 
 		 417 aa  144  4e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000450472  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1749  outer membrane efflux protein  27.83 
 
 		 458 aa  134  3e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1990  outer membrane efflux protein  21.33 
 
 		 471 aa  103  7e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.154832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2441  outer membrane efflux protein  22.74 
 
 		 453 aa  100  7e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2633  outer membrane efflux protein  21.92 
 
 		 424 aa  97.8  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3378  outer membrane efflux protein  23.31 
 
 		 498 aa  97.4  5e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.106709 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4182  outer membrane efflux protein  22.14 
 
 		 431 aa  94  5e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4260  outer membrane efflux protein  24.53 
 
 		 438 aa  92  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5561  outer membrane efflux protein  21.71 
 
 		 431 aa  90.5  5e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2629  outer membrane efflux protein  21.36 
 
 		 421 aa  90.5  5e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111539  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1606  outer membrane efflux protein  20.91 
 
 		 421 aa  90.1  6e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1376  Outer membrane efflux protein  23.58 
 
 		 435 aa  90.1  7e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.109779  hitchhiker  0.00244241 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0961  Outer membrane protein-like  20.24 
 
 		 491 aa  89.7  8e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0234127  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1482  outer membrane efflux protein  23.33 
 
 		 426 aa  89.4  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.979092  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1633  outer membrane efflux protein  22.33 
 
 		 420 aa  89  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.159543  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2799  outer membrane efflux protein  21.14 
 
 		 435 aa  87  5e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000194078  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0575  type I secretion outer membrane protein, TolC family  22.95 
 
 		 444 aa  84.7  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0729  type I secretion outer membrane protein, TolC family  22.95 
 
 		 444 aa  84.7  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000668163 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2704  outer membrane efflux protein  22.58 
 
 		 423 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1177  outer membrane efflux protein  22.55 
 
 		 427 aa  82.8  0.00000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3627  outer membrane efflux protein  21.19 
 
 		 461 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.433273  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0605  outer membrane efflux protein  22.08 
 
 		 470 aa  82  0.00000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  21.51 
 
 		 441 aa  80.5  0.00000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1727  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.73 
 
 		 452 aa  80.5  0.00000000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000826676  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0559  outer membrane efflux protein  24.15 
 
 		 455 aa  79.7  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0057  outer membrane protein, putative  21.96 
 
 		 470 aa  79.7  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3096  outer membrane efflux protein  20.96 
 
 		 497 aa  78.2  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05030  outer membrane efflux protein  21.97 
 
 		 471 aa  77.8  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.691581  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3129  Outer membrane efflux protein  22.67 
 
 		 446 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000215977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1415  Type I secretion outer membrane protein, TolC  20.16 
 
 		 472 aa  77.8  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000596226  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2154  outer membrane protein CyaE, putative  22.56 
 
 		 453 aa  75.9  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2021  outer membrane efflux protein  24 
 
 		 437 aa  76.3  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0186  Type I secretion outer membrane protein, TolC  21.79 
 
 		 485 aa  75.9  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1282  outer membrane efflux protein  22.12 
 
 		 446 aa  75.9  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0406152  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2365  outer membrane efflux protein  20 
 
 		 482 aa  75.1  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.316372 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1353  outer membrane efflux protein  23.6 
 
 		 451 aa  75.1  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.678572  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0863  outer membrane efflux protein  22.22 
 
 		 476 aa  73.9  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0409869  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0207  outer membrane efflux protein  19.44 
 
 		 523 aa  73.9  0.000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0283  outer membrane efflux protein  24.12 
 
 		 439 aa  73.6  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2001  outer membrane efflux protein  22.74 
 
 		 473 aa  72.8  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.612283  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  20.25 
 
 		 419 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1217  outer membrane efflux protein  22.22 
 
 		 438 aa  72.8  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.87899  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2368  outer membrane efflux protein  22.74 
 
 		 473 aa  72.8  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0254327  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0391  Outer membrane efflux family protein  22.67 
 
 		 437 aa  72  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0574  outer membrane efflux protein  24.92 
 
 		 427 aa  72  0.00000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000581742  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0762  outer membrane efflux protein  19.58 
 
 		 446 aa  71.6  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1384  outer membrane efflux protein  21.91 
 
 		 435 aa  71.2  0.00000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.642492  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0790  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.18 
 
 		 440 aa  70.9  0.00000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000109355  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1390  outer membrane efflux protein  23.36 
 
 		 463 aa  70.5  0.00000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0182398  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2692  outer membrane efflux protein  20.86 
 
 		 469 aa  70.5  0.00000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0120  outer membrane efflux protein  18.72 
 
 		 448 aa  70.5  0.00000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000165447  hitchhiker  0.000000000000561163 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4090  outer membrane efflux protein  22.25 
 
 		 473 aa  70.1  0.00000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3730  outer membrane efflux protein  23.82 
 
 		 477 aa  70.1  0.00000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1826  Type I secretion outer membrane protein, TolC  20.33 
 
 		 487 aa  70.1  0.00000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3814  outer membrane efflux protein  21.59 
 
 		 493 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000440013  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3845  outer membrane efflux protein  20.15 
 
 		 437 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4230  outer membrane efflux protein  23.57 
 
 		 458 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0431504  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3464  outer membrane efflux protein  22.25 
 
 		 489 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0487  outer membrane efflux protein  22.25 
 
 		 489 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3640  outer membrane efflux protein  22.25 
 
 		 489 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2692  outer membrane efflux protein  23.32 
 
 		 442 aa  68.6  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922433  normal  0.254416 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0580  putative outer membrane transport protein  22.84 
 
 		 451 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2262  Type I secretion outer membrane protein, TolC  26.94 
 
 		 497 aa  68.9  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0148702  normal  0.873765 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1978  TolC family type I secretion outer membrane protein  18.54 
 
 		 456 aa  68.9  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.143142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0582  outer membrane efflux protein  22.25 
 
 		 464 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3853  outer membrane efflux protein  21.33 
 
 		 447 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3318  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.35 
 
 		 470 aa  68.2  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4902  outer membrane efflux protein  22.14 
 
 		 439 aa  67.4  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3746  outer membrane efflux protein  22.03 
 
 		 463 aa  67  0.0000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.622366  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4686  outer membrane efflux protein  20.15 
 
 		 439 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.432562  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1967  outer membrane efflux protein  21.41 
 
 		 443 aa  67.4  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000399706  normal  0.35271 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3677  outer membrane efflux protein  20.15 
 
 		 439 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.621392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3710  outer membrane efflux protein  22.3 
 
 		 419 aa  67.4  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0505  outer membrane efflux protein  21.31 
 
 		 489 aa  67  0.0000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0526  outer membrane efflux protein  21.31 
 
 		 489 aa  67  0.0000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00662182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0706  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.9 
 
 		 636 aa  66.6  0.0000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0676668 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0530  outer membrane efflux protein  21.31 
 
 		 473 aa  66.6  0.0000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.40399  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3937  outer membrane efflux protein  21.72 
 
 		 447 aa  65.9  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00157367 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1759  outer membrane efflux protein  22.69 
 
 		 738 aa  65.9  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3945  putative outer membrane protein tolC precursor  21.24 
 
 		 461 aa  65.9  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.8738  normal  0.222307 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2148  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.14 
 
 		 497 aa  65.1  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.400858  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01115  putative outer membrane transport/efflux protein  26.37 
 
 		 443 aa  65.1  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2583  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.88 
 
 		 497 aa  65.1  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.655757 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0562  type I secretion outer membrane protein, TolC family  19.61 
 
 		 450 aa  65.1  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0634  type I secretion outer membrane protein, TolC family  21.3 
 
 		 467 aa  64.7  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000541353  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3298  outer membrane efflux protein  23.57 
 
 		 418 aa  64.7  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000531453  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4162  outer membrane efflux protein  25.84 
 
 		 443 aa  64.7  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000533026  normal  0.288124 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0162  outer membrane efflux protein  23.34 
 
 		 433 aa  64.7  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0242  outer membrane efflux protein  24.31 
 
 		 444 aa  64.7  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.231209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3409  outer membrane efflux protein  22.05 
 
 		 419 aa  64.3  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000155286  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6770  outer membrane efflux protein  20.65 
 
 		 488 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4801  Outer membrane efflux protein  21.04 
 
 		 408 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00249818 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1165  Outer membrane efflux protein  22.75 
 
 		 462 aa  64.3  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5970  Type I secretion outer membrane protein, TolC  21.51 
 
 		 442 aa  64.3  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0384  outer membrane efflux protein  23.61 
 
 		 444 aa  64.3  0.000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.895564  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0566  outer membrane efflux protein  22.41 
 
 		 473 aa  64.3  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.151183 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0888  ComEC/Rec2 family protein  20.42 
 
 		 559 aa  64.3  0.000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00289662  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1174  outer membrane efflux protein  21.14 
 
 		 457 aa  63.9  0.000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.89041 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3623  Outer membrane efflux protein  20.89 
 
 		 415 aa  63.2  0.000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>