174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1650 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1609  outer membrane efflux protein  70.94 
 
 		 499 aa  738    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.184768  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1650  Outer membrane efflux protein  100 
 
 		 499 aa  1020    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0374464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1126  outer membrane efflux protein  62.83 
 
 		 514 aa  611  1e-173  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2200  outer membrane efflux protein  54.14 
 
 		 495 aa  512  1e-144  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1600  outer membrane efflux protein  53.29 
 
 		 499 aa  503  1e-141  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.174043  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2027  outer membrane efflux protein  54.17 
 
 		 495 aa  500  1e-140  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000179084 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2020  outer membrane efflux protein  51.73 
 
 		 491 aa  482  1e-135  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0936605  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0533  outer membrane efflux protein  37.02 
 
 		 762 aa  300  4e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1190  Outer membrane efflux protein  35.26 
 
 		 510 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2126  hypothetical protein  35.85 
 
 		 508 aa  265  1e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2562  outer membrane efflux protein  25.69 
 
 		 500 aa  147  5e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0520371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0615  Outer membrane protein-like  26.82 
 
 		 577 aa  138  3.0000000000000003e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00243369  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0749  outer membrane efflux protein  25.75 
 
 		 490 aa  134  3e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5198  outer efflux pump domain-containing protein  25.63 
 
 		 522 aa  127  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0545953 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0651  outer membrane efflux protein  27.43 
 
 		 524 aa  126  9e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.703393  normal  0.0209094 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1445  outer membrane efflux protein  25.99 
 
 		 690 aa  124  4e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.757577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0373  outer membrane efflux protein  25.54 
 
 		 662 aa  117  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.540248 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0025  outer membrane efflux protein  24.16 
 
 		 486 aa  115  1.0000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.245374  normal  0.08145 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3733  outer membrane efflux protein  25.15 
 
 		 488 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2551  outer membrane efflux protein  26.3 
 
 		 647 aa  110  5e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5232  hypothetical protein  22.72 
 
 		 493 aa  107  5e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1351  outer membrane efflux protein  25.82 
 
 		 528 aa  106  9e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.225814  normal  0.0380363 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60770  putative outer membrane protein  22.72 
 
 		 493 aa  105  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6409  outer membrane efflux protein  24.48 
 
 		 537 aa  101  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2805  outer membrane efflux protein  24.6 
 
 		 685 aa  99.4  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.977623  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1875  outer membrane efflux protein  26.38 
 
 		 506 aa  98.2  3e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0894  outer membrane efflux protein  25.24 
 
 		 487 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3981  outer membrane efflux protein  23.38 
 
 		 493 aa  95.1  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4093  outer membrane efflux protein  24.29 
 
 		 514 aa  94.7  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.66979 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1733  outer membrane efflux protein  25.51 
 
 		 559 aa  90.5  7e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4505  outer membrane efflux protein  25 
 
 		 972 aa  87.4  6e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.300614  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4026  outer membrane efflux protein  23.8 
 
 		 486 aa  86.7  9e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2852  hypothetical protein  22.73 
 
 		 542 aa  85.5  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2992  hypothetical protein  22.73 
 
 		 542 aa  85.1  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2365  outer membrane efflux protein  24.87 
 
 		 482 aa  80.1  0.00000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.316372 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2221  outer membrane efflux protein  23.86 
 
 		 590 aa  79  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000846233  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2471  outer membrane efflux protein  24.04 
 
 		 481 aa  76.6  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0090  hypothetical protein  21.93 
 
 		 731 aa  73.6  0.000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2441  outer membrane efflux protein  25.65 
 
 		 453 aa  72.8  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2201  outer membrane efflux protein  25.81 
 
 		 587 aa  68.9  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.854853  normal  0.28263 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0283  outer membrane efflux protein  22.88 
 
 		 439 aa  68.9  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1338  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.36 
 
 		 456 aa  67.8  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0728783  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0837  outer membrane efflux protein  25.37 
 
 		 462 aa  67.4  0.0000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3096  outer membrane efflux protein  24.07 
 
 		 497 aa  65.5  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3627  outer membrane efflux protein  22.45 
 
 		 461 aa  63.9  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.433273  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0096  outer membrane efflux protein  23.06 
 
 		 441 aa  63.9  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2010  outer membrane efflux family protein  20.35 
 
 		 509 aa  63.2  0.00000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1761  hypothetical protein  22.6 
 
 		 576 aa  61.6  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0040  type I secretion outer membrane protein  20.2 
 
 		 507 aa  62  0.00000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.99479  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0733  outer membrane efflux protein, putative  24.29 
 
 		 463 aa  61.2  0.00000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0954  outer membrane efflux protein  23.58 
 
 		 463 aa  61.2  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1970  integral outer membrane protein TolC, efflux pump component  23.22 
 
 		 487 aa  61.2  0.00000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000188791  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0066  outer membrane efflux protein  25.55 
 
 		 443 aa  60.5  0.00000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3801  outer membrane efflux protein  24.08 
 
 		 449 aa  60.1  0.00000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233057 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2818  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.59 
 
 		 469 aa  59.7  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.282777  normal  0.979363 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4268  outer membrane channel protein  25.26 
 
 		 497 aa  60.1  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0102816 
 
 
-
 
NC_004310  BR0945  outer membrane efflux family protein  24.32 
 
 		 456 aa  58.9  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.681331  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  22.87 
 
 		 419 aa  59.3  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2659  outer membrane efflux protein  20.71 
 
 		 436 aa  58.2  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0938  outer membrane efflux family protein  24.32 
 
 		 452 aa  58.2  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03082  hypothetical protein  24.1 
 
 		 492 aa  57.8  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.208658  normal  0.984334 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4447  outer membrane efflux protein  25.46 
 
 		 459 aa  57.8  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1884  outer membrane efflux protein  22.57 
 
 		 483 aa  57.4  0.0000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1177  outer membrane efflux protein  21.86 
 
 		 427 aa  57  0.0000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3298  outer membrane efflux protein  21.59 
 
 		 418 aa  56.6  0.0000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000531453  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0101  RND family outer membrane efflux protein-like  23.99 
 
 		 477 aa  56.2  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.87226  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0381  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.29 
 
 		 445 aa  55.5  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0230254  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  23.6 
 
 		 441 aa  55.5  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0066  outer membrane efflux protein  25.55 
 
 		 436 aa  55.5  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2173  outer membrane efflux protein  22.56 
 
 		 448 aa  55.8  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0057  outer membrane protein, putative  23.99 
 
 		 470 aa  54.7  0.000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0605  outer membrane efflux protein  24.51 
 
 		 470 aa  54.3  0.000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3723  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.87 
 
 		 512 aa  53.9  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1170  putative outer membrane protein TolC  22.11 
 
 		 419 aa  53.9  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.109696  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0360  RND family outer membrane efflux protein  21.96 
 
 		 574 aa  53.9  0.000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3448  outer membrane channel protein  26.09 
 
 		 494 aa  53.9  0.000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.203909 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0863  outer membrane efflux protein  22.8 
 
 		 476 aa  53.5  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0409869  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0768  outer membrane channel protein  22.85 
 
 		 435 aa  53.5  0.000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000309945  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2001  LipD protein, putative  23.32 
 
 		 445 aa  53.1  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.538795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2330  RND family outer membrane efflux protein  21.73 
 
 		 594 aa  52.8  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2517  Outer membrane efflux protein  24.62 
 
 		 455 aa  52.8  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0940003  normal  0.677218 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2026  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.46 
 
 		 405 aa  52.8  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.341805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01121  RND family outer membrane efflux protein  24.09 
 
 		 475 aa  52.8  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3626  outer membrane efflux protein  23.15 
 
 		 627 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0887926  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1835  type I secretion outer membrane protein, TolC family  26.72 
 
 		 447 aa  52.8  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.211257  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1562  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.69 
 
 		 478 aa  52.8  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4130  RND efflux system outer membrane lipoprotein  21.14 
 
 		 468 aa  52.4  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3003  outer membrane efflux protein  21.5 
 
 		 816 aa  51.6  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2604  Type I secretion outer membrane protein, TolC  28.31 
 
 		 442 aa  51.6  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1482  outer membrane efflux protein  21.97 
 
 		 471 aa  51.6  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.387043 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1266  outer membrane efflux protein  20.33 
 
 		 444 aa  51.6  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3563  outer membrane channel protein  21.86 
 
 		 434 aa  51.6  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000135514  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  26.16 
 
 		 1470 aa  51.6  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2830  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.22 
 
 		 455 aa  50.8  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0538261  hitchhiker  0.00247347 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2692  outer membrane efflux protein  23.88 
 
 		 442 aa  50.8  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922433  normal  0.254416 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2686  Outer membrane secretion protein  21.32 
 
 		 472 aa  51.2  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.553025  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0872  Outer membrane protein-like  22.13 
 
 		 517 aa  50.8  0.00006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3625  outer membrane efflux protein  22.59 
 
 		 525 aa  50.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.262442  normal  0.276667 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0397  outer membrane efflux protein  23.1 
 
 		 473 aa  50.1  0.00008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01131  RND family outer membrane efflux protein  25.16 
 
 		 475 aa  50.1  0.00009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.245379  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>