75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5198 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5198  outer efflux pump domain-containing protein  100 
 
 		 522 aa  1037    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0545953 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3733  outer membrane efflux protein  46.86 
 
 		 488 aa  358  9e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3981  outer membrane efflux protein  46.76 
 
 		 493 aa  358  9.999999999999999e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4093  outer membrane efflux protein  46.46 
 
 		 514 aa  338  9.999999999999999e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.66979 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60770  putative outer membrane protein  45.07 
 
 		 493 aa  324  2e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5232  hypothetical protein  44.64 
 
 		 493 aa  318  2e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4026  outer membrane efflux protein  40.28 
 
 		 486 aa  314  1.9999999999999998e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0894  outer membrane efflux protein  42.95 
 
 		 487 aa  300  5e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0749  outer membrane efflux protein  38.58 
 
 		 490 aa  283  7.000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2471  outer membrane efflux protein  35.43 
 
 		 481 aa  241  2.9999999999999997e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2992  hypothetical protein  30.46 
 
 		 542 aa  176  7e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2852  hypothetical protein  30.46 
 
 		 542 aa  176  7e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2010  outer membrane efflux family protein  25.75 
 
 		 509 aa  161  2e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0040  type I secretion outer membrane protein  25.86 
 
 		 507 aa  162  2e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.99479  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2027  outer membrane efflux protein  26.43 
 
 		 495 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000179084 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2200  outer membrane efflux protein  26.26 
 
 		 495 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1600  outer membrane efflux protein  28.33 
 
 		 499 aa  127  3e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.174043  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1126  outer membrane efflux protein  27.53 
 
 		 514 aa  125  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03082  hypothetical protein  29.2 
 
 		 492 aa  120  6e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.208658  normal  0.984334 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1650  Outer membrane efflux protein  25.63 
 
 		 499 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0374464  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1609  outer membrane efflux protein  22.49 
 
 		 499 aa  101  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.184768  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2562  outer membrane efflux protein  26.58 
 
 		 500 aa  99.8  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0520371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2020  outer membrane efflux protein  25.22 
 
 		 491 aa  99  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0936605  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0025  outer membrane efflux protein  25.52 
 
 		 486 aa  94.4  4e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.245374  normal  0.08145 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0615  Outer membrane protein-like  26.49 
 
 		 577 aa  93.2  1e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00243369  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2551  outer membrane efflux protein  25.41 
 
 		 647 aa  90.9  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0533  outer membrane efflux protein  24.41 
 
 		 762 aa  87  8e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2126  hypothetical protein  23.55 
 
 		 508 aa  73.6  0.000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0954  outer membrane efflux protein  22.78 
 
 		 463 aa  72.4  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1875  outer membrane efflux protein  25.6 
 
 		 506 aa  72.8  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1190  Outer membrane efflux protein  23.63 
 
 		 510 aa  71.6  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1884  outer membrane efflux protein  23.7 
 
 		 483 aa  71.2  0.00000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0373  outer membrane efflux protein  22.62 
 
 		 662 aa  70.1  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.540248 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0651  outer membrane efflux protein  24.85 
 
 		 524 aa  69.3  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.703393  normal  0.0209094 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2201  outer membrane efflux protein  24.83 
 
 		 587 aa  67.8  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.854853  normal  0.28263 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1617  outer membrane efflux protein  22.94 
 
 		 467 aa  67.4  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  24.5 
 
 		 441 aa  66.2  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0627  outer membrane efflux protein, putative  24.4 
 
 		 470 aa  64.7  0.000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.173588  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0833  outer membrane efflux protein  24.32 
 
 		 496 aa  64.7  0.000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0733  outer membrane efflux protein, putative  23.49 
 
 		 463 aa  64.3  0.000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0162  outer membrane efflux protein  23.91 
 
 		 433 aa  63.2  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0364  outer membrane channel protein  24.82 
 
 		 500 aa  62.4  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0837  outer membrane efflux protein  24.28 
 
 		 462 aa  62.4  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1177  outer membrane efflux protein  20.6 
 
 		 427 aa  61.6  0.00000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0066  outer membrane efflux protein  23.45 
 
 		 436 aa  57.8  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6409  outer membrane efflux protein  24.55 
 
 		 537 aa  56.6  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3202  hypothetical protein  27.08 
 
 		 223 aa  56.6  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.413653  normal  0.147493 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2221  outer membrane efflux protein  21.7 
 
 		 590 aa  55.8  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000846233  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01970  outer membrane efflux protein, putative  22.4 
 
 		 456 aa  54.7  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.154405  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4284  outer membrane efflux protein  24.93 
 
 		 447 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2517  Outer membrane efflux protein  21.99 
 
 		 455 aa  52.8  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0940003  normal  0.677218 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1064  outer membrane efflux protein  24.25 
 
 		 443 aa  51.6  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4306  outer membrane efflux protein  24.93 
 
 		 447 aa  51.2  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2365  outer membrane efflux protein  25 
 
 		 482 aa  50.8  0.00006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.316372 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0302  outer membrane efflux protein  23.68 
 
 		 431 aa  50.4  0.00008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.019197  normal  0.0220531 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2137  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  26.92 
 
 		 437 aa  50.4  0.00009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0881  outer membrane efflux protein  22.96 
 
 		 535 aa  49.7  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.705042  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3409  outer membrane efflux protein  27.45 
 
 		 419 aa  49.3  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000155286  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1733  outer membrane efflux protein  24.47 
 
 		 559 aa  48.5  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2841  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  24.76 
 
 		 482 aa  47.4  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.114938  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0722  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.88 
 
 		 449 aa  47.4  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.278359  normal  0.698539 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3398  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  24.78 
 
 		 434 aa  47  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05030  outer membrane efflux protein  22.59 
 
 		 471 aa  46.2  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.691581  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  22.97 
 
 		 1470 aa  45.8  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2441  outer membrane efflux protein  26.7 
 
 		 453 aa  45.8  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3539  outer membrane channel protein  23.36 
 
 		 489 aa  45.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.735558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0366  outer membrane efflux protein  22.25 
 
 		 437 aa  45.1  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3367  outer membrane channel protein  23.66 
 
 		 489 aa  44.3  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3444  outer membrane channel protein  23.66 
 
 		 489 aa  44.3  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.606184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3437  outer membrane channel protein  23.66 
 
 		 489 aa  44.3  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3372  outer membrane channel protein  23.66 
 
 		 489 aa  44.3  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.258775 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0719  hypothetical protein  23.87 
 
 		 479 aa  43.5  0.009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01590  putative outer membrane protein TolC  24.19 
 
 		 451 aa  43.5  0.009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.29548  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1376  Outer membrane efflux protein  23.29 
 
 		 435 aa  43.5  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.109779  hitchhiker  0.00244241 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0699  hypothetical protein  23.87 
 
 		 489 aa  43.5  0.01  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>