68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2201 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2201  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 587 aa  1198    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.854853  normal  0.28263 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0615  Outer membrane protein-like  22.8 
 
 		 577 aa  114  6e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00243369  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2200  outer membrane efflux protein  24.08 
 
 		 495 aa  102  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0533  outer membrane efflux protein  25.1 
 
 		 762 aa  102  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2027  outer membrane efflux protein  23.38 
 
 		 495 aa  96.3  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000179084 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2126  hypothetical protein  22.48 
 
 		 508 aa  90.9  6e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1600  outer membrane efflux protein  22.9 
 
 		 499 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.174043  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1190  Outer membrane efflux protein  25.05 
 
 		 510 aa  84.3  0.000000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0025  outer membrane efflux protein  25.33 
 
 		 486 aa  83.2  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.245374  normal  0.08145 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2551  outer membrane efflux protein  24.94 
 
 		 647 aa  77  0.0000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1126  outer membrane efflux protein  24.47 
 
 		 514 aa  75.1  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03082  hypothetical protein  25.99 
 
 		 492 aa  74.3  0.000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.208658  normal  0.984334 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4294  outer membrane efflux protein  26.77 
 
 		 448 aa  73.2  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0190007  normal  0.396606 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2020  outer membrane efflux protein  22.54 
 
 		 491 aa  72  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0936605  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1733  outer membrane efflux protein  25.49 
 
 		 559 aa  71.6  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1650  Outer membrane efflux protein  25.81 
 
 		 499 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0374464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5198  outer efflux pump domain-containing protein  24.83 
 
 		 522 aa  67.8  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0545953 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1609  outer membrane efflux protein  20.84 
 
 		 499 aa  64.7  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.184768  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2562  outer membrane efflux protein  22.53 
 
 		 500 aa  64.3  0.000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0520371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0651  outer membrane efflux protein  22.75 
 
 		 524 aa  63.9  0.000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.703393  normal  0.0209094 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1064  outer membrane efflux protein  25.65 
 
 		 443 aa  62.4  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1875  outer membrane efflux protein  24.18 
 
 		 506 aa  61.6  0.00000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  22.57 
 
 		 1496 aa  59.7  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1351  outer membrane efflux protein  22.83 
 
 		 528 aa  57.8  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.225814  normal  0.0380363 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60770  putative outer membrane protein  23.04 
 
 		 493 aa  57  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0162  outer membrane efflux protein  25.46 
 
 		 433 aa  57.4  0.0000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1058  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.84 
 
 		 511 aa  57.4  0.0000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.712242  normal  0.943186 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5232  hypothetical protein  23.58 
 
 		 493 aa  57  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2471  outer membrane efflux protein  22.81 
 
 		 481 aa  55.5  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4153  outer membrane efflux protein  25.38 
 
 		 447 aa  55.1  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2992  hypothetical protein  23.39 
 
 		 542 aa  53.9  0.000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2852  hypothetical protein  23 
 
 		 542 aa  53.9  0.000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3486  RND efflux system outer membrane lipoprotein  21.48 
 
 		 500 aa  52.4  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0233233 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4284  outer membrane efflux protein  25 
 
 		 447 aa  52  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0373  outer membrane efflux protein  21.11 
 
 		 662 aa  51.6  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.540248 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4093  outer membrane efflux protein  23.6 
 
 		 514 aa  51.6  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.66979 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4306  outer membrane efflux protein  25 
 
 		 447 aa  50.8  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1440  outer membrane efflux protein  23.38 
 
 		 503 aa  50.1  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3093  outer membrane protein  22.62 
 
 		 503 aa  49.7  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0828  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  23.71 
 
 		 428 aa  48.9  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.885444  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0814  outer membrane efflux protein  22.66 
 
 		 460 aa  48.9  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0538  outer membrane efflux protein  22.67 
 
 		 432 aa  48.1  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.355565  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1918  outer membrane efflux protein  24.72 
 
 		 489 aa  48.1  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.812724 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27410  putative outer membrane protein precursor  21.45 
 
 		 479 aa  47.4  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.721932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2756  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  21.9 
 
 		 469 aa  46.2  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0415066  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3981  outer membrane efflux protein  31.63 
 
 		 493 aa  46.6  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03144  putative outer membrane CHANEL lipoprotein transmembrane  21.57 
 
 		 508 aa  46.2  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.330645 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0388  RND efflux system, outer membrane lipoprotein CmeC  20.61 
 
 		 492 aa  47  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1627  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  24.19 
 
 		 538 aa  47  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4026  outer membrane efflux protein  27.93 
 
 		 486 aa  45.8  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3306  RND efflux system outer membrane lipoprotein  21.73 
 
 		 474 aa  46.2  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1970  integral outer membrane protein TolC, efflux pump component  23.26 
 
 		 487 aa  46.2  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000188791  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0414  RND efflux system, outer membrane lipoprotein CmeC  20.3 
 
 		 492 aa  45.8  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0309  outer membrane efflux protein  20.92 
 
 		 458 aa  45.4  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.729969 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4021  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.92 
 
 		 483 aa  45.4  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.227062  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3733  outer membrane efflux protein  23.66 
 
 		 488 aa  45.4  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1177  outer membrane efflux protein  23.5 
 
 		 427 aa  45.1  0.004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3931  multidrug efflux system outer membrane subunit  20.59 
 
 		 507 aa  44.7  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.436202 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2517  Outer membrane efflux protein  21.96 
 
 		 455 aa  44.7  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0940003  normal  0.677218 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2318  outer membrane protein  21.18 
 
 		 479 aa  44.3  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.510391  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2145  outer membrane efflux protein  24.51 
 
 		 472 aa  44.3  0.007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0192834 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3627  outer membrane efflux protein  25.43 
 
 		 461 aa  43.9  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.433273  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0894  outer membrane efflux protein  21.54 
 
 		 487 aa  44.3  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0395  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  21.74 
 
 		 464 aa  43.9  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3371  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  26.92 
 
 		 484 aa  43.9  0.009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00556392  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2841  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  22.51 
 
 		 482 aa  43.9  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.114938  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3002  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  21.89 
 
 		 516 aa  43.5  0.01  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2905  type I secretion outer membrane protein, TolC family  26.05 
 
 		 455 aa  43.5  0.01  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>