188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2562 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2562  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 500 aa  1006    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0520371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2200  outer membrane efflux protein  26.82 
 
 		 495 aa  166  6.9999999999999995e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2126  hypothetical protein  25.94 
 
 		 508 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2027  outer membrane efflux protein  28.54 
 
 		 495 aa  163  8.000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000179084 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1600  outer membrane efflux protein  26.73 
 
 		 499 aa  152  1e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.174043  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1609  outer membrane efflux protein  24.74 
 
 		 499 aa  145  1e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.184768  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0025  outer membrane efflux protein  28.21 
 
 		 486 aa  145  1e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.245374  normal  0.08145 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1126  outer membrane efflux protein  26.41 
 
 		 514 aa  145  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1650  Outer membrane efflux protein  25.63 
 
 		 499 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0374464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0749  outer membrane efflux protein  26.8 
 
 		 490 aa  130  7.000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1351  outer membrane efflux protein  27.65 
 
 		 528 aa  124  5e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.225814  normal  0.0380363 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0615  Outer membrane protein-like  25.77 
 
 		 577 aa  123  8e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00243369  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4093  outer membrane efflux protein  28.13 
 
 		 514 aa  110  6e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.66979 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6409  outer membrane efflux protein  29.19 
 
 		 537 aa  110  8.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1733  outer membrane efflux protein  26 
 
 		 559 aa  105  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5198  outer efflux pump domain-containing protein  25.1 
 
 		 522 aa  105  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0545953 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1875  outer membrane efflux protein  27.94 
 
 		 506 aa  104  3e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2471  outer membrane efflux protein  25.71 
 
 		 481 aa  102  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0651  outer membrane efflux protein  25.31 
 
 		 524 aa  103  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.703393  normal  0.0209094 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0162  outer membrane efflux protein  26.6 
 
 		 433 aa  97.8  4e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1445  outer membrane efflux protein  24.63 
 
 		 690 aa  97.1  7e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.757577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2221  outer membrane efflux protein  23.12 
 
 		 590 aa  96.7  8e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000846233  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4026  outer membrane efflux protein  25.29 
 
 		 486 aa  96.3  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3981  outer membrane efflux protein  26.84 
 
 		 493 aa  95.9  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2020  outer membrane efflux protein  23.75 
 
 		 491 aa  95.9  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0936605  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0533  outer membrane efflux protein  25.32 
 
 		 762 aa  95.9  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3733  outer membrane efflux protein  27.43 
 
 		 488 aa  94  5e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3801  outer membrane efflux protein  29.14 
 
 		 449 aa  92  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233057 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2517  Outer membrane efflux protein  29.87 
 
 		 455 aa  90.9  5e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0940003  normal  0.677218 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0814  outer membrane efflux protein  27.21 
 
 		 460 aa  86.7  8e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2551  outer membrane efflux protein  24.19 
 
 		 647 aa  86.3  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0894  outer membrane efflux protein  26.69 
 
 		 487 aa  85.1  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0373  outer membrane efflux protein  24.19 
 
 		 662 aa  82.4  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.540248 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1190  Outer membrane efflux protein  23.4 
 
 		 510 aa  77.4  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2441  outer membrane efflux protein  25.86 
 
 		 453 aa  77.4  0.0000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5232  hypothetical protein  26.03 
 
 		 493 aa  77.4  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60770  putative outer membrane protein  26.72 
 
 		 493 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0954  outer membrane efflux protein  24.93 
 
 		 463 aa  75.5  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  27.74 
 
 		 1496 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4923  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.99 
 
 		 477 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1617  outer membrane efflux protein  22.68 
 
 		 467 aa  72.8  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2010  outer membrane efflux family protein  22.05 
 
 		 509 aa  72.8  0.00000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0733  outer membrane efflux protein, putative  24.71 
 
 		 463 aa  72.4  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1761  hypothetical protein  27.09 
 
 		 576 aa  70.9  0.00000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0627  outer membrane efflux protein, putative  23.86 
 
 		 470 aa  70.5  0.00000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.173588  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4447  outer membrane efflux protein  28.24 
 
 		 459 aa  70.9  0.00000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4799  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.75 
 
 		 477 aa  70.5  0.00000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.125067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4976  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.69 
 
 		 478 aa  70.5  0.00000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4715  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.75 
 
 		 477 aa  70.5  0.00000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.133912 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3096  outer membrane efflux protein  23.74 
 
 		 497 aa  70.1  0.00000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2201  outer membrane efflux protein  22.41 
 
 		 587 aa  70.1  0.00000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.854853  normal  0.28263 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  27.24 
 
 		 1470 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1884  outer membrane efflux protein  22.9 
 
 		 483 aa  67.8  0.0000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  24.06 
 
 		 441 aa  68.2  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0040  type I secretion outer membrane protein  22.14 
 
 		 507 aa  67.4  0.0000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.99479  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0543  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.23 
 
 		 479 aa  67  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.991736 
 
 
-
 
NC_003296  RS03082  hypothetical protein  25.19 
 
 		 492 aa  66.6  0.0000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.208658  normal  0.984334 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2992  hypothetical protein  23.11 
 
 		 542 aa  66.6  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2852  hypothetical protein  23.11 
 
 		 542 aa  66.6  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1727  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.09 
 
 		 452 aa  66.2  0.000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000826676  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0837  outer membrane efflux protein  23.93 
 
 		 462 aa  64.3  0.000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0762  outer membrane efflux protein  23.61 
 
 		 446 aa  63.5  0.000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0833  outer membrane efflux protein  22.8 
 
 		 496 aa  63.2  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4977  outer membrane efflux protein TolC, putative  24.01 
 
 		 479 aa  60.8  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0491  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.23 
 
 		 477 aa  60.8  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00611692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0381  type I secretion outer membrane protein, TolC family  26.01 
 
 		 445 aa  60.8  0.00000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0230254  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0961  Outer membrane protein-like  23.26 
 
 		 491 aa  58.5  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0234127  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7078  putative outer membrane protein  24.93 
 
 		 491 aa  59.3  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0823525  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2028  Outer membrane protein-like protein  22.62 
 
 		 617 aa  58.9  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.950233  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1970  integral outer membrane protein TolC, efflux pump component  24.09 
 
 		 487 aa  58.2  0.0000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000188791  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0384  outer membrane efflux protein  22.03 
 
 		 444 aa  56.6  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.895564  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0283  outer membrane efflux protein  24.16 
 
 		 439 aa  56.6  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2899  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.08 
 
 		 504 aa  55.5  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2704  outer membrane efflux protein  21.29 
 
 		 423 aa  55.8  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3298  outer membrane efflux protein  23.03 
 
 		 418 aa  55.1  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000531453  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0863  outer membrane efflux protein  22.29 
 
 		 476 aa  55.1  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0409869  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1177  outer membrane efflux protein  20.9 
 
 		 427 aa  54.7  0.000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0094  outer membrane efflux protein, putative  22.81 
 
 		 501 aa  53.9  0.000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0379352 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1376  Outer membrane efflux protein  23.68 
 
 		 435 aa  53.9  0.000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.109779  hitchhiker  0.00244241 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003047  type I secretion TolC precursor  23.5 
 
 		 423 aa  53.5  0.000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1990  outer membrane efflux protein  22.41 
 
 		 471 aa  53.5  0.000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.154832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4182  outer membrane efflux protein  25.57 
 
 		 471 aa  53.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4184  outer membrane efflux protein  25.57 
 
 		 471 aa  53.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.236948 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3333  outer membrane efflux protein  25.44 
 
 		 438 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3997  Outer membrane protein-like protein  22.66 
 
 		 486 aa  52.4  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000837564 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2180  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.13 
 
 		 874 aa  51.6  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000461522  normal  0.954774 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1841  outer membrane efflux protein  26.07 
 
 		 471 aa  51.2  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.285879 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0171  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  23.23 
 
 		 490 aa  51.2  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0499  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.57 
 
 		 546 aa  51.2  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.16116  normal  0.32958 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0388  RND efflux system, outer membrane lipoprotein CmeC  23.73 
 
 		 492 aa  51.2  0.00004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3926  Type I secretion outer membrane protein, TolC  27.17 
 
 		 441 aa  51.2  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2682  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.83 
 
 		 451 aa  51.2  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.829421  hitchhiker  0.000293137 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3853  outer membrane efflux protein  24.89 
 
 		 447 aa  50.8  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2805  outer membrane efflux protein  21.27 
 
 		 685 aa  50.4  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.977623  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3937  outer membrane efflux protein  24.53 
 
 		 447 aa  50.4  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00157367 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1407  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.71 
 
 		 488 aa  50.1  0.00008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.380774 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3811  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.71 
 
 		 476 aa  49.7  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.521708  normal  0.399123 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0516  outer membrane efflux protein  26.56 
 
 		 413 aa  49.3  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1759  outer membrane efflux protein  25.95 
 
 		 738 aa  49.7  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0881  outer membrane efflux protein  22.49 
 
 		 535 aa  50.1  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.705042  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>