35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2805 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2805  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 685 aa  1398    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.977623  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0090  hypothetical protein  34.3 
 
 		 731 aa  391  1e-107  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1650  Outer membrane efflux protein  24.6 
 
 		 499 aa  93.2  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0374464  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1609  outer membrane efflux protein  22.91 
 
 		 499 aa  88.6  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.184768  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0025  outer membrane efflux protein  24.29 
 
 		 486 aa  79.7  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.245374  normal  0.08145 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2126  hypothetical protein  22.25 
 
 		 508 aa  77  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6409  outer membrane efflux protein  24.48 
 
 		 537 aa  76.3  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1126  outer membrane efflux protein  24.66 
 
 		 514 aa  75.1  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1600  outer membrane efflux protein  22.38 
 
 		 499 aa  69.7  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.174043  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2027  outer membrane efflux protein  21.44 
 
 		 495 aa  65.1  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000179084 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2020  outer membrane efflux protein  21.18 
 
 		 491 aa  64.7  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0936605  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2200  outer membrane efflux protein  22.14 
 
 		 495 aa  63.2  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2010  outer membrane efflux family protein  23.43 
 
 		 509 aa  56.6  0.000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3236  outer membrane channel protein  23.1 
 
 		 435 aa  56.6  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000456355  hitchhiker  0.0000511139 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0753  outer membrane channel protein  23.1 
 
 		 435 aa  56.2  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000555232  normal  0.0190145 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0725  outer membrane channel protein  23.26 
 
 		 435 aa  55.8  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000245313  hitchhiker  0.000963429 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1445  outer membrane efflux protein  21.88 
 
 		 690 aa  54.3  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.757577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0373  outer membrane efflux protein  22.36 
 
 		 662 aa  53.9  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.540248 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0781  outer membrane channel protein  22.92 
 
 		 435 aa  52.8  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000184345  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0813  outer membrane channel protein  22.92 
 
 		 435 aa  52.8  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000621601  normal  0.257824 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3578  outer membrane channel protein  22.92 
 
 		 435 aa  52.8  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000408694  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0806  outer membrane channel protein  22.57 
 
 		 435 aa  52.8  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000113836  hitchhiker  0.0000000000882186 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2221  outer membrane efflux protein  21.39 
 
 		 590 aa  52.4  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000846233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0040  type I secretion outer membrane protein  22.98 
 
 		 507 aa  52  0.00004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.99479  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0768  outer membrane channel protein  22.44 
 
 		 435 aa  50.8  0.00008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000309945  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2551  outer membrane efflux protein  25.87 
 
 		 647 aa  50.4  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3563  outer membrane channel protein  22.41 
 
 		 434 aa  50.1  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000135514  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1875  outer membrane efflux protein  24.78 
 
 		 506 aa  48.9  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2562  outer membrane efflux protein  21.27 
 
 		 500 aa  48.1  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0520371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1351  outer membrane efflux protein  24.9 
 
 		 528 aa  48.1  0.0006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.225814  normal  0.0380363 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3904  outer membrane channel protein  22.22 
 
 		 435 aa  47.8  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3225  outer membrane channel protein  23.03 
 
 		 432 aa  45.1  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000929322  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5588  putative outer membrane efflux protein MdtP  24.12 
 
 		 488 aa  45.1  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4162  outer membrane efflux protein  20.64 
 
 		 443 aa  44.7  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000533026  normal  0.288124 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0615  Outer membrane protein-like  20.99 
 
 		 577 aa  44.3  0.008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00243369  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>