90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CBUD_0040 on replicon NC_009727
Organism: Coxiella burnetii Dugway 5J108-111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010117  COXBURSA331_A2010  outer membrane efflux family protein  99.21 
 
 
509 aa  989    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0040  type I secretion outer membrane protein  100 
 
 
507 aa  1038    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.99479  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2852  hypothetical protein  31.8 
 
 
542 aa  224  3e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2992  hypothetical protein  31.8 
 
 
542 aa  224  4e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2471  outer membrane efflux protein  29.39 
 
 
481 aa  170  5e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5198  outer efflux pump domain-containing protein  27.05 
 
 
522 aa  169  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0545953 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60770  putative outer membrane protein  29.64 
 
 
493 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5232  hypothetical protein  29.64 
 
 
493 aa  164  3e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3733  outer membrane efflux protein  27.34 
 
 
488 aa  155  2e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0749  outer membrane efflux protein  28.12 
 
 
490 aa  152  2e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3981  outer membrane efflux protein  25.77 
 
 
493 aa  150  4e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4026  outer membrane efflux protein  27.1 
 
 
486 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4093  outer membrane efflux protein  27.14 
 
 
514 aa  144  3e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.66979 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0894  outer membrane efflux protein  26.74 
 
 
487 aa  143  6e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0025  outer membrane efflux protein  24.68 
 
 
486 aa  108  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.245374  normal  0.08145 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2551  outer membrane efflux protein  26.18 
 
 
647 aa  89.7  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1445  outer membrane efflux protein  25.61 
 
 
690 aa  80.9  0.00000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.757577  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03082  hypothetical protein  22.49 
 
 
492 aa  79.7  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.208658  normal  0.984334 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2200  outer membrane efflux protein  22.15 
 
 
495 aa  76.6  0.0000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2027  outer membrane efflux protein  23.18 
 
 
495 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000179084 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2562  outer membrane efflux protein  23.01 
 
 
500 aa  74.7  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0520371  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1725  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.41 
 
 
489 aa  72  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.736299  normal  0.0102072 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6409  outer membrane efflux protein  21.29 
 
 
537 aa  70.1  0.00000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1733  outer membrane efflux protein  24.14 
 
 
559 aa  67  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1650  Outer membrane efflux protein  21.45 
 
 
499 aa  65.9  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0374464  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0373  outer membrane efflux protein  22.25 
 
 
662 aa  66.6  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.540248 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0615  Outer membrane protein-like  23.01 
 
 
577 aa  66.6  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00243369  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1126  outer membrane efflux protein  23.84 
 
 
514 aa  64.3  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1600  outer membrane efflux protein  20.81 
 
 
499 aa  63.5  0.000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.174043  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1761  hypothetical protein  25.06 
 
 
576 aa  62  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1609  outer membrane efflux protein  20.81 
 
 
499 aa  61.2  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.184768  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0872  Outer membrane protein-like  20.75 
 
 
517 aa  58.2  0.0000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3904  outer membrane channel protein  21.02 
 
 
435 aa  57.8  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0627  outer membrane efflux protein, putative  21.36 
 
 
470 aa  57.8  0.0000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.173588  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2851  type I secretion outer membrane protein, TolC family  21.71 
 
 
463 aa  57.8  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0066  outer membrane efflux protein  23.37 
 
 
436 aa  56.6  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2805  outer membrane efflux protein  23.57 
 
 
685 aa  56.2  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.977623  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1190  Outer membrane efflux protein  24.22 
 
 
510 aa  55.1  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2977  outer membrane efflux protein  27.91 
 
 
454 aa  54.7  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2020  outer membrane efflux protein  19.66 
 
 
491 aa  54.3  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0936605  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1351  outer membrane efflux protein  23.99 
 
 
528 aa  54.3  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.225814  normal  0.0380363 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0652  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.04 
 
 
428 aa  53.9  0.000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000458305  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5432  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.16 
 
 
553 aa  53.9  0.000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.199925  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0768  outer membrane channel protein  20.51 
 
 
435 aa  53.9  0.000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000309945  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02372  hypothetical protein  27.6 
 
 
425 aa  53.5  0.000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3945  putative outer membrane protein tolC precursor  23.62 
 
 
461 aa  53.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.8738  normal  0.222307 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1054  outer membrane efflux protein  25.05 
 
 
514 aa  53.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000452487  normal  0.217723 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1064  outer membrane efflux protein  22.35 
 
 
443 aa  52.4  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0725  outer membrane channel protein  20.38 
 
 
435 aa  51.6  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000245313  hitchhiker  0.000963429 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0837  outer membrane efflux protein  20.37 
 
 
462 aa  51.6  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1671  outer membrane efflux protein  22.2 
 
 
461 aa  51.6  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3231  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.89 
 
 
483 aa  50.8  0.00006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02379  hypothetical protein  22.51 
 
 
436 aa  50.4  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2894  Type I secretion outer membrane protein, TolC  20.53 
 
 
460 aa  50.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386257  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0806  outer membrane channel protein  21.22 
 
 
435 aa  50.4  0.00008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000113836  hitchhiker  0.0000000000882186 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2148  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.6 
 
 
497 aa  50.1  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.400858  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0753  outer membrane channel protein  20.85 
 
 
435 aa  50.1  0.00009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000555232  normal  0.0190145 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3236  outer membrane channel protein  20.85 
 
 
435 aa  50.1  0.00009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000456355  hitchhiker  0.0000511139 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3578  outer membrane channel protein  21.55 
 
 
435 aa  50.1  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000408694  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6495  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.85 
 
 
518 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0813  outer membrane channel protein  21.55 
 
 
435 aa  50.1  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000621601  normal  0.257824 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0781  outer membrane channel protein  21.55 
 
 
435 aa  50.1  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000184345  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0954  outer membrane efflux protein  21.27 
 
 
463 aa  48.9  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3332  outer membrane channel protein  23.1 
 
 
431 aa  48.9  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0563453  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4195  outer membrane channel protein  20.05 
 
 
443 aa  48.1  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000611538  hitchhiker  0.000431125 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0651  outer membrane efflux protein  22.06 
 
 
524 aa  47.8  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.703393  normal  0.0209094 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1634  outer membrane efflux protein  23.47 
 
 
431 aa  47.8  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.194063  normal  0.997182 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0533  outer membrane efflux protein  24.43 
 
 
762 aa  47.8  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1759  outer membrane efflux protein  22.06 
 
 
738 aa  47.8  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3737  outer membrane efflux protein  23.83 
 
 
437 aa  47.4  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.315415  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4354  Outer membrane efflux protein  24.15 
 
 
517 aa  47.4  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5239  type I secretion outer membrane protein, TolC family  21.96 
 
 
488 aa  47  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3923  outer membrane efflux protein  25.73 
 
 
569 aa  47  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.19723 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003406  agglutination protein  25.23 
 
 
423 aa  46.6  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4696  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.66 
 
 
497 aa  46.2  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  22.63 
 
 
441 aa  46.6  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003403  agglutination protein  25.71 
 
 
436 aa  46.6  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000998881  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5161  type I secretion outer membrane protein, TolC family  21.66 
 
 
488 aa  46.2  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.451764  normal  0.264948 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0580  putative outer membrane transport protein  23.76 
 
 
451 aa  46.2  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04010  RND efflux system, outer membrane lipoprotein  23.48 
 
 
504 aa  45.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.174506  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0544  outer membrane channel protein  20 
 
 
448 aa  45.4  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000576987  normal  0.601769 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3563  outer membrane channel protein  20.86 
 
 
434 aa  46.2  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000135514  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3973  outer membrane efflux protein  22.22 
 
 
513 aa  45.8  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0704049 
 
 
-
 
NC_002950  PG1667  outer membrane efflux protein  21.05 
 
 
455 aa  46.2  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4579  outer membrane efflux protein  22.46 
 
 
515 aa  44.7  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0188996  decreased coverage  0.000000771093 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2639  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.81 
 
 
461 aa  44.3  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0733  outer membrane efflux protein, putative  19.25 
 
 
463 aa  44.3  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1165  Outer membrane efflux protein  28.48 
 
 
462 aa  43.9  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1875  outer membrane efflux protein  22.03 
 
 
506 aa  43.5  0.009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02621  outer membrane protein required for AvrXa21 activity C (raxC)  21.83 
 
 
443 aa  43.5  0.009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>