36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3997 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3997  Outer membrane protein-like protein  100 
 
 		 486 aa  984    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000837564 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2831  putative outer membrane protein  45.09 
 
 		 483 aa  411  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000620867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3959  Outer membrane protein-like protein  35.01 
 
 		 472 aa  253  8.000000000000001e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06470  hypothetical protein  32 
 
 		 469 aa  247  3e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.324894  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0710  outer membrane protein-like protein  31.95 
 
 		 475 aa  205  2e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000000105718  normal  0.231109 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2028  Outer membrane protein-like protein  28.24 
 
 		 617 aa  105  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.950233  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0280  hypothetical protein  27.02 
 
 		 465 aa  90.9  5e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0285  hypothetical protein  26.79 
 
 		 465 aa  89.7  9e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00634  outer membrane component of multidrug efflux pump  24.6 
 
 		 476 aa  85.1  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.253495  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0284  Outer membrane protein-like  22.32 
 
 		 471 aa  70.5  0.00000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000446418  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1875  outer membrane efflux protein  23.52 
 
 		 506 aa  66.2  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1351  outer membrane efflux protein  23.17 
 
 		 528 aa  63.5  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.225814  normal  0.0380363 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0651  outer membrane efflux protein  25.34 
 
 		 524 aa  63.2  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.703393  normal  0.0209094 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3048  outer membrane channel protein  34.65 
 
 		 432 aa  60.5  0.00000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000973822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1733  outer membrane efflux protein  23.21 
 
 		 559 aa  54.7  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0725  outer membrane channel protein  29.13 
 
 		 435 aa  52.8  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000245313  hitchhiker  0.000963429 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3236  outer membrane channel protein  29.13 
 
 		 435 aa  52.8  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000456355  hitchhiker  0.0000511139 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0753  outer membrane channel protein  29.13 
 
 		 435 aa  52.8  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000555232  normal  0.0190145 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3563  outer membrane channel protein  24.69 
 
 		 434 aa  52.8  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000135514  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0806  outer membrane channel protein  29.92 
 
 		 435 aa  52  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000113836  hitchhiker  0.0000000000882186 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4195  outer membrane channel protein  23.8 
 
 		 443 aa  52  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000611538  hitchhiker  0.000431125 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3578  outer membrane channel protein  29.92 
 
 		 435 aa  52  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000408694  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0544  outer membrane channel protein  28.12 
 
 		 448 aa  52  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000576987  normal  0.601769 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0781  outer membrane channel protein  29.92 
 
 		 435 aa  52  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000184345  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0813  outer membrane channel protein  29.92 
 
 		 435 aa  52  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000621601  normal  0.257824 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2562  outer membrane efflux protein  22.66 
 
 		 500 aa  51.6  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0520371  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3904  outer membrane channel protein  24.17 
 
 		 435 aa  50.8  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0774  outer membrane channel protein  29.13 
 
 		 441 aa  47  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000983275  unclonable  0.000000000104798 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33750  putative outer membrane protein precursor  23.75 
 
 		 474 aa  46.6  0.0009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0658035  hitchhiker  0.0026818 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1600  outer membrane efflux protein  21.54 
 
 		 499 aa  45.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.174043  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3535  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.55 
 
 		 467 aa  45.1  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.908198 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3332  outer membrane channel protein  23.23 
 
 		 431 aa  45.1  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0563453  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2869  outer membrane protein  23.24 
 
 		 474 aa  44.3  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0768  outer membrane channel protein  21.22 
 
 		 435 aa  43.9  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000309945  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3261  type I secretion outer membrane protein, TolC  25.25 
 
 		 469 aa  43.9  0.007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.537181 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2221  outer membrane efflux protein  24.68 
 
 		 590 aa  43.1  0.01  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000846233  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>