29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_06470 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_06470  hypothetical protein  100 
 
 		 469 aa  936    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.324894  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3959  Outer membrane protein-like protein  46.83 
 
 		 472 aa  399  9.999999999999999e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3997  Outer membrane protein-like protein  32 
 
 		 486 aa  247  3e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000837564 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0710  outer membrane protein-like protein  33.03 
 
 		 475 aa  239  5.999999999999999e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000000105718  normal  0.231109 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2831  putative outer membrane protein  32.85 
 
 		 483 aa  224  2e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000620867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00634  outer membrane component of multidrug efflux pump  28.04 
 
 		 476 aa  97.8  4e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.253495  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0280  hypothetical protein  25 
 
 		 465 aa  85.1  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0285  hypothetical protein  24.78 
 
 		 465 aa  84  0.000000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0284  Outer membrane protein-like  22.96 
 
 		 471 aa  80.1  0.00000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000446418  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2028  Outer membrane protein-like protein  24.71 
 
 		 617 aa  75.1  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.950233  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3787  Outer membrane protein-like protein  24.66 
 
 		 462 aa  66.6  0.0000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.352992  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0066  outer membrane efflux protein  21.96 
 
 		 436 aa  60.8  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1967  outer membrane efflux protein  23.65 
 
 		 443 aa  52.8  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000399706  normal  0.35271 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0699  hypothetical protein  26.78 
 
 		 489 aa  49.3  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1351  outer membrane efflux protein  19.5 
 
 		 528 aa  48.5  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.225814  normal  0.0380363 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0582  outer membrane efflux protein  23.61 
 
 		 464 aa  48.5  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0719  hypothetical protein  26.78 
 
 		 479 aa  48.5  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4897  outer membrane efflux protein  22.6 
 
 		 437 aa  44.7  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0861249  normal  0.15922 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4090  outer membrane efflux protein  24.17 
 
 		 473 aa  44.7  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3464  outer membrane efflux protein  25.42 
 
 		 489 aa  44.3  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0487  outer membrane efflux protein  25.42 
 
 		 489 aa  44.3  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3640  outer membrane efflux protein  24.17 
 
 		 489 aa  44.3  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6409  outer membrane efflux protein  23.11 
 
 		 537 aa  43.9  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0530  outer membrane efflux protein  28.19 
 
 		 473 aa  43.1  0.009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.40399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0526  outer membrane efflux protein  28.19 
 
 		 489 aa  43.5  0.009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00662182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0505  outer membrane efflux protein  28.19 
 
 		 489 aa  43.1  0.009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3719  outer membrane efflux protein  21.46 
 
 		 444 aa  43.1  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.633766  normal  0.0948534 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1875  outer membrane efflux protein  21.41 
 
 		 506 aa  43.5  0.009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3814  outer membrane efflux protein  28.19 
 
 		 493 aa  43.1  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000440013  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>