18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3787 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009427  Saro_3787  Outer membrane protein-like protein  100 
 
 		 462 aa  887    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.352992  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01190  outer membrane component of multidrug efflux pump  52.44 
 
 		 307 aa  261  2e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188881  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2028  Outer membrane protein-like protein  35.6 
 
 		 617 aa  211  2e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.950233  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0280  hypothetical protein  32.41 
 
 		 465 aa  204  2e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0285  hypothetical protein  32.18 
 
 		 465 aa  203  4e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00634  outer membrane component of multidrug efflux pump  29 
 
 		 476 aa  171  2e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.253495  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0284  Outer membrane protein-like  27.89 
 
 		 471 aa  156  7e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000446418  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06470  hypothetical protein  24.63 
 
 		 469 aa  88.6  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.324894  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3959  Outer membrane protein-like protein  24.89 
 
 		 472 aa  79.3  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0710  outer membrane protein-like protein  23.44 
 
 		 475 aa  67.8  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000000105718  normal  0.231109 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6409  outer membrane efflux protein  26.68 
 
 		 537 aa  62  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2551  outer membrane efflux protein  27.09 
 
 		 647 aa  57  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2020  outer membrane efflux protein  26.35 
 
 		 491 aa  54.3  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0936605  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1600  outer membrane efflux protein  27.42 
 
 		 499 aa  46.6  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.174043  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1445  outer membrane efflux protein  23.28 
 
 		 690 aa  44.7  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.757577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0373  outer membrane efflux protein  24.19 
 
 		 662 aa  44.7  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.540248 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2200  outer membrane efflux protein  27.27 
 
 		 495 aa  43.9  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3077  outer membrane efflux protein  27.27 
 
 		 426 aa  43.5  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.767775  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>