22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2028 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2028  Outer membrane protein-like protein  100 
 
 		 617 aa  1249    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.950233  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3787  Outer membrane protein-like protein  35.46 
 
 		 462 aa  200  7.999999999999999e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.352992  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0280  hypothetical protein  32.81 
 
 		 465 aa  194  3e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0285  hypothetical protein  32.58 
 
 		 465 aa  193  9e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0284  Outer membrane protein-like  25.8 
 
 		 471 aa  121  3e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000446418  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00634  outer membrane component of multidrug efflux pump  24.88 
 
 		 476 aa  112  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.253495  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2831  putative outer membrane protein  26.28 
 
 		 483 aa  110  6e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000620867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01190  outer membrane component of multidrug efflux pump  33.45 
 
 		 307 aa  108  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188881  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3997  Outer membrane protein-like protein  28.24 
 
 		 486 aa  105  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000837564 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06470  hypothetical protein  24.71 
 
 		 469 aa  75.1  0.000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.324894  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0710  outer membrane protein-like protein  24.26 
 
 		 475 aa  72.8  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000000105718  normal  0.231109 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1351  outer membrane efflux protein  23.02 
 
 		 528 aa  59.7  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.225814  normal  0.0380363 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2562  outer membrane efflux protein  22.62 
 
 		 500 aa  57  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0520371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6409  outer membrane efflux protein  22.22 
 
 		 537 aa  54.3  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1875  outer membrane efflux protein  22.81 
 
 		 506 aa  53.9  0.000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0749  outer membrane efflux protein  23.55 
 
 		 490 aa  52.8  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0373  outer membrane efflux protein  24.91 
 
 		 662 aa  51.2  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.540248 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3959  Outer membrane protein-like protein  21.5 
 
 		 472 aa  48.1  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1126  outer membrane efflux protein  27.13 
 
 		 514 aa  47  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2551  outer membrane efflux protein  22.78 
 
 		 647 aa  46.6  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0651  outer membrane efflux protein  22.87 
 
 		 524 aa  44.7  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.703393  normal  0.0209094 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1445  outer membrane efflux protein  20.98 
 
 		 690 aa  43.9  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.757577  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>