13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01190 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_01190  outer membrane component of multidrug efflux pump  100 
 
 		 307 aa  598  1e-170  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188881  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3787  Outer membrane protein-like protein  52.44 
 
 		 462 aa  238  1e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.352992  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0280  hypothetical protein  29.76 
 
 		 465 aa  123  5e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0285  hypothetical protein  29.41 
 
 		 465 aa  122  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2028  Outer membrane protein-like protein  33.55 
 
 		 617 aa  114  2.0000000000000002e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.950233  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00634  outer membrane component of multidrug efflux pump  25.8 
 
 		 476 aa  92  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.253495  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0284  Outer membrane protein-like  26.6 
 
 		 471 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000446418  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2831  putative outer membrane protein  22.3 
 
 		 483 aa  58.5  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000620867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1351  outer membrane efflux protein  26.6 
 
 		 528 aa  47.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.225814  normal  0.0380363 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3959  Outer membrane protein-like protein  21.24 
 
 		 472 aa  45.8  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2551  outer membrane efflux protein  24.3 
 
 		 647 aa  43.9  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2240  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  27.27 
 
 		 518 aa  42.7  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0766  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.75 
 
 		 480 aa  42.4  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000618276  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>