17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3959 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3959  Outer membrane protein-like protein  100 
 
 		 472 aa  953    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06470  hypothetical protein  46.09 
 
 		 469 aa  401  9.999999999999999e-111  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.324894  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2831  putative outer membrane protein  34.39 
 
 		 483 aa  256  6e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000620867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3997  Outer membrane protein-like protein  35.09 
 
 		 486 aa  253  6e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000837564 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0710  outer membrane protein-like protein  31.89 
 
 		 475 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000000105718  normal  0.231109 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0285  hypothetical protein  25.92 
 
 		 465 aa  102  1e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0280  hypothetical protein  25.69 
 
 		 465 aa  100  7e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0284  Outer membrane protein-like  23.94 
 
 		 471 aa  89  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000446418  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00634  outer membrane component of multidrug efflux pump  24.08 
 
 		 476 aa  65.9  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.253495  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3787  Outer membrane protein-like protein  25.05 
 
 		 462 aa  62.8  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.352992  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6409  outer membrane efflux protein  21.32 
 
 		 537 aa  62.4  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0373  outer membrane efflux protein  23.45 
 
 		 662 aa  56.2  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.540248 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0150  Outer membrane efflux protein  23.53 
 
 		 415 aa  48.1  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.921658  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2028  Outer membrane protein-like protein  21.5 
 
 		 617 aa  47.8  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.950233  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0538  outer membrane efflux protein  22.06 
 
 		 462 aa  47.8  0.0005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1445  outer membrane efflux protein  21.84 
 
 		 690 aa  46.6  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.757577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4462  CzcA family heavy metal efflux protein  30.77 
 
 		 1446 aa  43.1  0.01  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>