16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0710 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0710  outer membrane protein-like protein  100 
 
 		 475 aa  976    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000000105718  normal  0.231109 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06470  hypothetical protein  33.03 
 
 		 469 aa  239  5.999999999999999e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.324894  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3959  Outer membrane protein-like protein  31.99 
 
 		 472 aa  231  1e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2831  putative outer membrane protein  32.77 
 
 		 483 aa  219  1e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000620867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3997  Outer membrane protein-like protein  31.95 
 
 		 486 aa  205  2e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000837564 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0285  hypothetical protein  24.14 
 
 		 465 aa  77.4  0.0000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0280  hypothetical protein  24.14 
 
 		 465 aa  77  0.0000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2028  Outer membrane protein-like protein  24.26 
 
 		 617 aa  72.8  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.950233  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00634  outer membrane component of multidrug efflux pump  23.03 
 
 		 476 aa  67.8  0.0000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.253495  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0284  Outer membrane protein-like  21.82 
 
 		 471 aa  65.9  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000446418  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1351  outer membrane efflux protein  22.98 
 
 		 528 aa  62.8  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.225814  normal  0.0380363 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1733  outer membrane efflux protein  23.89 
 
 		 559 aa  54.7  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3787  Outer membrane protein-like protein  23.6 
 
 		 462 aa  50.8  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.352992  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6409  outer membrane efflux protein  25.16 
 
 		 537 aa  49.7  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3525  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  22.58 
 
 		 471 aa  46.2  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2471  outer membrane efflux protein  23.26 
 
 		 481 aa  43.9  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>