18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00634 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00634  outer membrane component of multidrug efflux pump  100 
 
 		 476 aa  971    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.253495  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0284  Outer membrane protein-like  35.23 
 
 		 471 aa  292  9e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000446418  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3787  Outer membrane protein-like protein  28.74 
 
 		 462 aa  152  1e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.352992  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0285  hypothetical protein  28.12 
 
 		 465 aa  137  5e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0280  hypothetical protein  28.12 
 
 		 465 aa  136  8e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2028  Outer membrane protein-like protein  24.88 
 
 		 617 aa  112  2.0000000000000002e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.950233  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06470  hypothetical protein  27.79 
 
 		 469 aa  99  2e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.324894  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01190  outer membrane component of multidrug efflux pump  25.36 
 
 		 307 aa  89  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188881  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3997  Outer membrane protein-like protein  24.6 
 
 		 486 aa  85.1  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000837564 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2831  putative outer membrane protein  22.45 
 
 		 483 aa  75.1  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000620867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0710  outer membrane protein-like protein  23.51 
 
 		 475 aa  68.9  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000000105718  normal  0.231109 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3959  Outer membrane protein-like protein  24.08 
 
 		 472 aa  65.9  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1351  outer membrane efflux protein  22.45 
 
 		 528 aa  54.7  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.225814  normal  0.0380363 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  28.34 
 
 		 1496 aa  50.4  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2126  hypothetical protein  35.48 
 
 		 508 aa  45.1  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1968  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  23.64 
 
 		 462 aa  45.1  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.840689 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1609  outer membrane efflux protein  30.49 
 
 		 499 aa  44.7  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.184768  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2027  outer membrane efflux protein  26.86 
 
 		 495 aa  44.3  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000179084 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>