197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3719 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3719  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 444 aa  901    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.633766  normal  0.0948534 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2807  outer membrane efflux protein/ immunoreative antigen  40.95 
 
 		 441 aa  345  8.999999999999999e-94  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4162  outer membrane efflux protein  35.89 
 
 		 443 aa  288  2e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000533026  normal  0.288124 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2662  outer membrane efflux protein  37.53 
 
 		 445 aa  270  4e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4492  outer membrane efflux protein  27.03 
 
 		 455 aa  174  2.9999999999999996e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.685781 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5506  outer membrane efflux protein  28 
 
 		 451 aa  174  2.9999999999999996e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.307266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1475  outer membrane efflux protein  26.91 
 
 		 449 aa  163  7e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.236212  normal  0.298581 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0610  outer membrane efflux protein  25.99 
 
 		 453 aa  155  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01970  outer membrane efflux protein, putative  26.02 
 
 		 456 aa  152  1e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.154405  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3429  outer membrane efflux protein  25.06 
 
 		 442 aa  151  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.437271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2819  outer membrane efflux protein  28.12 
 
 		 438 aa  150  4e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1266  outer membrane efflux protein  24.6 
 
 		 444 aa  143  6e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2515  outer membrane protein  26.5 
 
 		 463 aa  142  8e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1143  outer membrane efflux protein  25.65 
 
 		 455 aa  137  4e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0286987  normal  0.128527 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3706  outer membrane efflux protein  23.72 
 
 		 447 aa  125  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2362  outer membrane efflux protein  24.5 
 
 		 446 aa  126  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.451057 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2647  outer membrane efflux protein  26.55 
 
 		 445 aa  122  9.999999999999999e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.910769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1617  outer membrane efflux protein  24.36 
 
 		 467 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2173  outer membrane efflux protein  25.28 
 
 		 448 aa  120  7e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2560  outer membrane efflux protein  24.64 
 
 		 438 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1967  outer membrane efflux protein  23.72 
 
 		 443 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000399706  normal  0.35271 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1884  outer membrane efflux protein  21.65 
 
 		 483 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0833  outer membrane efflux protein  24.66 
 
 		 496 aa  114  4.0000000000000004e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0733  outer membrane efflux protein, putative  22.92 
 
 		 463 aa  113  6e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0627  outer membrane efflux protein, putative  21.45 
 
 		 470 aa  102  1e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.173588  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0042  outer membrane efflux protein  23.91 
 
 		 454 aa  100  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0954  outer membrane efflux protein  21.58 
 
 		 463 aa  98.6  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0837  outer membrane efflux protein  21.33 
 
 		 462 aa  89.4  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4543  outer membrane efflux protein  21.92 
 
 		 430 aa  82.4  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.781416  normal  0.876595 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1841  Outer membrane protein-like protein  22.93 
 
 		 438 aa  79.7  0.00000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1015  outer membrane protein  23.4 
 
 		 488 aa  79.7  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.22355e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0224  outer membrane efflux protein  22.53 
 
 		 419 aa  77.8  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000720591  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1217  outer membrane efflux protein  22.84 
 
 		 438 aa  75.9  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.87899  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0538  outer membrane efflux protein  19.78 
 
 		 462 aa  72  0.00000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3409  outer membrane efflux protein  22.33 
 
 		 419 aa  71.6  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000155286  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  21.85 
 
 		 441 aa  67.8  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3126  outer membrane efflux protein  22.85 
 
 		 444 aa  66.2  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01115  putative outer membrane transport/efflux protein  23.3 
 
 		 443 aa  65.5  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1440  outer membrane efflux protein  22.03 
 
 		 503 aa  65.1  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0455  outer membrane efflux protein  21.48 
 
 		 463 aa  63.9  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.236814  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0456  outer membrane efflux protein  21.48 
 
 		 456 aa  63.9  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0427  outer membrane efflux protein  22.36 
 
 		 455 aa  63.9  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.410338  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2298  outer membrane efflux protein  21.36 
 
 		 525 aa  63.5  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2243  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.66 
 
 		 455 aa  63.2  0.000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  24.2 
 
 		 1496 aa  62.4  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0063  outer membrane efflux protein  21.51 
 
 		 408 aa  62.8  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0180654  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2367  outer membrane efflux protein  22.45 
 
 		 495 aa  61.2  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1177  outer membrane efflux protein  21.39 
 
 		 427 aa  61.2  0.00000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3298  outer membrane efflux protein  22.01 
 
 		 418 aa  60.8  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000531453  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0384  outer membrane efflux protein  22.3 
 
 		 444 aa  60.5  0.00000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.895564  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2154  outer membrane protein CyaE, putative  22.22 
 
 		 453 aa  60.1  0.00000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5578  outer membrane efflux protein  20.58 
 
 		 451 aa  60.1  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.46516 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2026  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.09 
 
 		 405 aa  59.3  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.341805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1671  outer membrane efflux protein  22.52 
 
 		 461 aa  59.7  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4130  outer membrane efflux protein  21.58 
 
 		 516 aa  58.9  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4977  outer membrane efflux protein TolC, putative  22.72 
 
 		 479 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0491  Type I secretion outer membrane protein, TolC  22.03 
 
 		 477 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00611692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03690  outer membrane channel precursor protein  22.69 
 
 		 462 aa  57.8  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000344286  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0722  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.64 
 
 		 449 aa  57.8  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.278359  normal  0.698539 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65750  putative outer membrane efflux protein precursor  29.94 
 
 		 482 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0543  Type I secretion outer membrane protein, TolC  22.72 
 
 		 479 aa  57  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.991736 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0961  Outer membrane protein-like  20.9 
 
 		 491 aa  57.4  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0234127  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1835  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.11 
 
 		 447 aa  57  0.0000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.211257  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4142  outer membrane efflux protein  22.42 
 
 		 497 aa  56.6  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.958426  hitchhiker  0.00365026 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5705  outer membrane efflux protein  29.38 
 
 		 481 aa  56.6  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1629  outer membrane efflux protein  20.57 
 
 		 438 aa  56.6  0.0000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03674  putative outer membrane CHANEL lipoprotein  19.95 
 
 		 488 aa  56.2  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.119855 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1135  outer membrane protein TolC, putative  22.14 
 
 		 480 aa  55.8  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.196284  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0585  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.36 
 
 		 456 aa  56.2  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.449084  normal  0.127961 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4268  outer membrane channel protein  22.17 
 
 		 497 aa  56.2  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0102816 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3777  outer membrane channel protein  22.91 
 
 		 470 aa  55.5  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1738  putative outer membrane protein TolC  22.7 
 
 		 521 aa  55.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1561  RND efflux system, outer membrane lipoprotein CmeC  23.97 
 
 		 480 aa  55.5  0.000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0997  putative outer membrane protein TolC  22.7 
 
 		 476 aa  54.7  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.471122  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0296  outer membrane protein TolC, putative  22.7 
 
 		 476 aa  54.7  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.618695  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5078  outer membrane efflux protein  22.35 
 
 		 635 aa  54.7  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.851054  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1361  Outer membrane efflux protein  23.72 
 
 		 416 aa  54.7  0.000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.824117  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0366  outer membrane efflux protein  22.77 
 
 		 437 aa  54.7  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3619  outer membrane channel protein  24.4 
 
 		 469 aa  55.1  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0370  putative outer membrane protein TolC  22.7 
 
 		 446 aa  55.1  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00192444  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0269  putative outer membrane protein TolC  22.7 
 
 		 476 aa  54.7  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0165015  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1822  putative outer membrane protein TolC  21.9 
 
 		 476 aa  55.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1327  putative outer membrane protein TolC  22.7 
 
 		 446 aa  55.1  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.345184  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0066  outer membrane efflux protein  19.62 
 
 		 443 aa  54.3  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4799  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.19 
 
 		 477 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.125067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2818  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.22 
 
 		 469 aa  54.3  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.282777  normal  0.979363 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4181  outer membrane channel protein  24.77 
 
 		 449 aa  53.5  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1924  Outer membrane protein  28.06 
 
 		 494 aa  53.5  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0996265 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4169  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.33 
 
 		 470 aa  53.5  0.000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4923  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.01 
 
 		 477 aa  53.5  0.000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0096  outer membrane efflux protein  20.51 
 
 		 441 aa  53.1  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0943  TolC family type I secretion outer membrane protein  20.49 
 
 		 481 aa  52.8  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.359214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2830  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.95 
 
 		 455 aa  52.8  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0538261  hitchhiker  0.00247347 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0323  outer membrane channel protein  22.28 
 
 		 463 aa  52.4  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000673159  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4715  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.03 
 
 		 477 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.133912 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0066  outer membrane efflux protein  21.96 
 
 		 436 aa  51.6  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0120  outer membrane efflux protein  21.07 
 
 		 448 aa  52.4  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000165447  hitchhiker  0.000000000000561163 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4976  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.64 
 
 		 478 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1841  outer membrane efflux protein  34.11 
 
 		 471 aa  52.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.285879 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1126  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.53 
 
 		 450 aa  52.4  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>